Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5U9

Ubqln3, Ubiquilin-3, mousemouse

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Length 658 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubqln3Q8C5U9 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
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Ubqln3Q8C5U9 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ubqln3Q8C5U9 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ubqln3Q8C5U9 Gm28911-201ENSMUST00000188837 117 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Ubqln3Q8C5U9 Fuom-201ENSMUST00000026539 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ubqln3Q8C5U9 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ubqln3Q8C5U9 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
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Ubqln3Q8C5U9 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ubqln3Q8C5U9 Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 6941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
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Ubqln3Q8C5U9 Mast3-203ENSMUST00000211948 4251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
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Ubqln3Q8C5U9 Il13ra1-201ENSMUST00000033418 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
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Ubqln3Q8C5U9 Esyt3-201ENSMUST00000042158 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
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Ubqln3Q8C5U9 Elmsan1-201ENSMUST00000046266 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ubqln3Q8C5U9 Wdr81-204ENSMUST00000173320 6908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ubqln3Q8C5U9 Ranbp17-202ENSMUST00000102815 5001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ubqln3Q8C5U9 Dnmbp-202ENSMUST00000212032 5074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ubqln3Q8C5U9 Begain-204ENSMUST00000209829 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
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Ubqln3Q8C5U9 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ubqln3Q8C5U9 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ubqln3Q8C5U9 Gm15429-201ENSMUST00000151268 798 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Ubqln3Q8C5U9 Gm16251-201ENSMUST00000162649 338 ntTSL 3 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ubqln3Q8C5U9 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ubqln3Q8C5U9 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ubqln3Q8C5U9 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Ubqln3Q8C5U9 Gm17330-201ENSMUST00000221047 165 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
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Ubqln3Q8C5U9 AC150560.1-201ENSMUST00000227731 1187 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Ubqln3Q8C5U9 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ubqln3Q8C5U9 Gm24447-201ENSMUST00000083977 338 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.9 ms