Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0Q4

Nek11, Serine/threonine-protein kinase Nek11, mousemouse

Predictions only

Length 628 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nek11Q8C0Q4 Hps3-202ENSMUST00000108321 3385 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nek11Q8C0Q4 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nek11Q8C0Q4 Disp1-205ENSMUST00000195372 4901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nek11Q8C0Q4 Plekha5-212ENSMUST00000204876 1928 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nek11Q8C0Q4 Max-201ENSMUST00000082136 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nek11Q8C0Q4 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nek11Q8C0Q4 Gigyf2-201ENSMUST00000027475 5724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nek11Q8C0Q4 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nek11Q8C0Q4 Cttnbp2nl-202ENSMUST00000098763 4834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nek11Q8C0Q4 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nek11Q8C0Q4 Ins2-204ENSMUST00000105932 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nek11Q8C0Q4 D930015M05Rik-201ENSMUST00000126002 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nek11Q8C0Q4 Gm26185-201ENSMUST00000157692 266 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Nek11Q8C0Q4 Syce3-202ENSMUST00000167959 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nek11Q8C0Q4 Gm26927-201ENSMUST00000182385 965 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Nek11Q8C0Q4 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nek11Q8C0Q4 Gm18187-201ENSMUST00000196476 984 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Nek11Q8C0Q4 Gm31651-201ENSMUST00000198864 560 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nek11Q8C0Q4 2810047C21Rik1-202ENSMUST00000210322 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nek11Q8C0Q4 Gm3654-202ENSMUST00000210597 472 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nek11Q8C0Q4 Ins2-201ENSMUST00000000220 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nek11Q8C0Q4 Lsm7-208ENSMUST00000220225 1129 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nek11Q8C0Q4 Ccdc25-201ENSMUST00000022614 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nek11Q8C0Q4 Aldh9a1-201ENSMUST00000028004 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nek11Q8C0Q4 Scara5-201ENSMUST00000022610 3794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nek11Q8C0Q4 Zfp777-201ENSMUST00000095944 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nek11Q8C0Q4 Gart-201ENSMUST00000023684 3518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nek11Q8C0Q4 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nek11Q8C0Q4 Nmral1-202ENSMUST00000079130 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nek11Q8C0Q4 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nek11Q8C0Q4 Chfr-201ENSMUST00000014812 3146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nek11Q8C0Q4 Nr3c1-203ENSMUST00000115567 6436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nek11Q8C0Q4 Olfr763-201ENSMUST00000077460 2523 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nek11Q8C0Q4 Trim26-210ENSMUST00000179968 3203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nek11Q8C0Q4 Evi5l-203ENSMUST00000176149 3938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nek11Q8C0Q4 Tesmin-203ENSMUST00000142193 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nek11Q8C0Q4 Pgghg-201ENSMUST00000079403 2981 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nek11Q8C0Q4 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nek11Q8C0Q4 Igf1-203ENSMUST00000105300 1673 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nek11Q8C0Q4 Rab15-201ENSMUST00000021459 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nek11Q8C0Q4 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nek11Q8C0Q4 Wwox-203ENSMUST00000109108 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nek11Q8C0Q4 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nek11Q8C0Q4 Usp33-209ENSMUST00000197748 4183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nek11Q8C0Q4 Folr1-205ENSMUST00000106986 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nek11Q8C0Q4 Timm10-202ENSMUST00000111631 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nek11Q8C0Q4 Gm11751-201ENSMUST00000126187 460 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nek11Q8C0Q4 Pisd-ps2-202ENSMUST00000142526 1175 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Nek11Q8C0Q4 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nek11Q8C0Q4 Gm15494-202ENSMUST00000171665 451 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nek11Q8C0Q4 Gm22121-201ENSMUST00000175148 54 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Nek11Q8C0Q4 Naa60-209ENSMUST00000175809 279 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nek11Q8C0Q4 Gm27682-201ENSMUST00000183930 110 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Nek11Q8C0Q4 1700094J05Rik-202ENSMUST00000190491 997 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nek11Q8C0Q4 5330425B07Rik-201ENSMUST00000196714 1027 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Nek11Q8C0Q4 Mymx-204ENSMUST00000208801 437 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nek11Q8C0Q4 AC159474.1-201ENSMUST00000218454 374 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nek11Q8C0Q4 AC153506.3-201ENSMUST00000219287 1029 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nek11Q8C0Q4 Rpl29-201ENSMUST00000059802 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nek11Q8C0Q4 Slc16a3-208ENSMUST00000168579 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nek11Q8C0Q4 Pcdhgb8-202ENSMUST00000208907 2796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nek11Q8C0Q4 Cdk10-212ENSMUST00000213005 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nek11Q8C0Q4 Polrmt-202ENSMUST00000159016 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nek11Q8C0Q4 Gm853-201ENSMUST00000023884 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nek11Q8C0Q4 Tars2-202ENSMUST00000074339 2313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nek11Q8C0Q4 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nek11Q8C0Q4 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nek11Q8C0Q4 Polr3e-202ENSMUST00000106483 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nek11Q8C0Q4 Tcf4-230ENSMUST00000201205 2270 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nek11Q8C0Q4 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nek11Q8C0Q4 Gm2885-201ENSMUST00000181895 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nek11Q8C0Q4 Skp1a-201ENSMUST00000037324 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nek11Q8C0Q4 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nek11Q8C0Q4 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nek11Q8C0Q4 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nek11Q8C0Q4 Gm42863-201ENSMUST00000197875 2958 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Nek11Q8C0Q4 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nek11Q8C0Q4 Cdc25c-201ENSMUST00000060710 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nek11Q8C0Q4 Gm26519-201ENSMUST00000181193 2249 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nek11Q8C0Q4 Hdgfl2-210ENSMUST00000225843 2238 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nek11Q8C0Q4 Gpr153-203ENSMUST00000105651 3777 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nek11Q8C0Q4 Gpr153-201ENSMUST00000055754 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nek11Q8C0Q4 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nek11Q8C0Q4 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nek11Q8C0Q4 Psme2b-201ENSMUST00000104958 837 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nek11Q8C0Q4 Gm14704-201ENSMUST00000120300 874 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Nek11Q8C0Q4 Gm15046-201ENSMUST00000130153 408 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nek11Q8C0Q4 Pelp1-202ENSMUST00000135148 562 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nek11Q8C0Q4 Tldc2-202ENSMUST00000166140 639 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nek11Q8C0Q4 Gm8835-201ENSMUST00000173096 1169 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Nek11Q8C0Q4 Gm20457-201ENSMUST00000173374 682 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nek11Q8C0Q4 Pfdn6-205ENSMUST00000174426 396 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nek11Q8C0Q4 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nek11Q8C0Q4 Gm43818-201ENSMUST00000200605 466 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Nek11Q8C0Q4 Tgif2-ps1-201ENSMUST00000203590 713 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Nek11Q8C0Q4 Gm9299-201ENSMUST00000206392 1140 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Nek11Q8C0Q4 Rpl18-208ENSMUST00000211061 552 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nek11Q8C0Q4 Reep1-202ENSMUST00000212631 953 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nek11Q8C0Q4 Ier3-201ENSMUST00000003635 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nek11Q8C0Q4 Vmn1r213-201ENSMUST00000076897 1155 ntAPPRIS P2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.6 ms