Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGG7

Ubash3b, Ubiquitin-associated and SH3 domain-containing protein B, mousemouse

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Length 638 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubash3bQ8BGG7 Rtn4rl1-201ENSMUST00000102514 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ubash3bQ8BGG7 Cyth1-203ENSMUST00000106302 3119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ubash3bQ8BGG7 Phrf1-202ENSMUST00000122143 4864 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ubash3bQ8BGG7 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ubash3bQ8BGG7 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ubash3bQ8BGG7 Tspoap1-201ENSMUST00000039627 7616 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ubash3bQ8BGG7 Nif3l1-206ENSMUST00000171597 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ubash3bQ8BGG7 Rab11fip3-203ENSMUST00000122103 5015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ubash3bQ8BGG7 Map3k11-201ENSMUST00000004156 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ubash3bQ8BGG7 Abca7-202ENSMUST00000132517 6696 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ubash3bQ8BGG7 Chfr-202ENSMUST00000112519 3159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ubash3bQ8BGG7 4930458D05Rik-201ENSMUST00000142871 3055 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ubash3bQ8BGG7 Esrrb-203ENSMUST00000110204 4196 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ubash3bQ8BGG7 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ubash3bQ8BGG7 Dnpep-209ENSMUST00000187836 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ubash3bQ8BGG7 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Ubash3bQ8BGG7 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ubash3bQ8BGG7 Gm44891-201ENSMUST00000208817 2223 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Ubash3bQ8BGG7 Fgd3-203ENSMUST00000110087 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ubash3bQ8BGG7 Irf6-201ENSMUST00000076521 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ubash3bQ8BGG7 Pbxip1-201ENSMUST00000038942 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ubash3bQ8BGG7 Ifnar2-201ENSMUST00000023693 3047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ubash3bQ8BGG7 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ubash3bQ8BGG7 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ubash3bQ8BGG7 Hdac5-201ENSMUST00000008999 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ubash3bQ8BGG7 Gm20633-201ENSMUST00000176742 2831 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Ubash3bQ8BGG7 Hltf-201ENSMUST00000002502 4955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ubash3bQ8BGG7 Usp19-210ENSMUST00000193678 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ubash3bQ8BGG7 Bpi-203ENSMUST00000109500 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ubash3bQ8BGG7 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ubash3bQ8BGG7 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ubash3bQ8BGG7 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ubash3bQ8BGG7 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ubash3bQ8BGG7 Pdcd6-203ENSMUST00000222759 1376 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ubash3bQ8BGG7 Btrc-202ENSMUST00000111936 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ubash3bQ8BGG7 Cwc27-201ENSMUST00000022228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ubash3bQ8BGG7 Ampd2-202ENSMUST00000102637 3586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ubash3bQ8BGG7 Pck2-205ENSMUST00000226352 2784 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Ubash3bQ8BGG7 Adrb3-201ENSMUST00000081438 2795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ubash3bQ8BGG7 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ubash3bQ8BGG7 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ubash3bQ8BGG7 Gm12537-201ENSMUST00000119266 1002 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Ubash3bQ8BGG7 Gm11524-201ENSMUST00000119349 807 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Ubash3bQ8BGG7 Gm12070-201ENSMUST00000119551 1002 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Ubash3bQ8BGG7 Gm12671-201ENSMUST00000119978 1002 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Ubash3bQ8BGG7 Gm13292-201ENSMUST00000120014 1000 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Ubash3bQ8BGG7 Gm12403-201ENSMUST00000121384 959 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Ubash3bQ8BGG7 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Ubash3bQ8BGG7 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ubash3bQ8BGG7 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ubash3bQ8BGG7 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ubash3bQ8BGG7 Gm10359-201ENSMUST00000180167 1002 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Ubash3bQ8BGG7 Gm12033-201ENSMUST00000180654 1002 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Ubash3bQ8BGG7 Gm5559-201ENSMUST00000180755 1002 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Ubash3bQ8BGG7 Gm4335-201ENSMUST00000182581 1004 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Ubash3bQ8BGG7 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Ubash3bQ8BGG7 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ubash3bQ8BGG7 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Ubash3bQ8BGG7 AC134328.1-201ENSMUST00000222693 667 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ubash3bQ8BGG7 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ubash3bQ8BGG7 Scn5a-201ENSMUST00000065196 8287 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ubash3bQ8BGG7 Myadm-203ENSMUST00000203328 1899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ubash3bQ8BGG7 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ubash3bQ8BGG7 Asap1-201ENSMUST00000023008 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ubash3bQ8BGG7 Dnajc13-201ENSMUST00000035170 8012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ubash3bQ8BGG7 Omp-201ENSMUST00000098281 2144 ntAPPRIS P1 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ubash3bQ8BGG7 Itpr3-201ENSMUST00000049308 8990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ubash3bQ8BGG7 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ubash3bQ8BGG7 2810403A07Rik-201ENSMUST00000029696 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ubash3bQ8BGG7 Myo18a-210ENSMUST00000130305 5450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ubash3bQ8BGG7 Phf13-201ENSMUST00000055688 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ubash3bQ8BGG7 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ubash3bQ8BGG7 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ubash3bQ8BGG7 Pnpla5-201ENSMUST00000019012 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ubash3bQ8BGG7 Tacc3-202ENSMUST00000079534 2899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ubash3bQ8BGG7 Ano6-208ENSMUST00000227791 3149 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ubash3bQ8BGG7 Pex12-207ENSMUST00000176518 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ubash3bQ8BGG7 Samd4-201ENSMUST00000022386 4564 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ubash3bQ8BGG7 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ubash3bQ8BGG7 Chrna3-201ENSMUST00000034851 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ubash3bQ8BGG7 Glipr2-202ENSMUST00000107855 1816 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ubash3bQ8BGG7 Zfp341-202ENSMUST00000109702 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ubash3bQ8BGG7 Gria4-203ENSMUST00000163309 2338 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ubash3bQ8BGG7 Ptpru-201ENSMUST00000030741 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ubash3bQ8BGG7 Speg-201ENSMUST00000087122 10801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ubash3bQ8BGG7 Ripor3-201ENSMUST00000099073 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ubash3bQ8BGG7 Unc5c-202ENSMUST00000106236 9646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ubash3bQ8BGG7 Acbd5-213ENSMUST00000227809 1986 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ubash3bQ8BGG7 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ubash3bQ8BGG7 Arr3-201ENSMUST00000113769 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ubash3bQ8BGG7 Gm43677-201ENSMUST00000198098 2378 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Ubash3bQ8BGG7 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ubash3bQ8BGG7 BC030867-201ENSMUST00000100392 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ubash3bQ8BGG7 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ubash3bQ8BGG7 Tagln2-201ENSMUST00000111228 716 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ubash3bQ8BGG7 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ubash3bQ8BGG7 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ubash3bQ8BGG7 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ubash3bQ8BGG7 Zc3h18-201ENSMUST00000017622 3810 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ubash3bQ8BGG7 Gga3-201ENSMUST00000019135 3816 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
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