Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGC0

Htatsf1, HIV Tat-specific factor 1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 757 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Htatsf1Q8BGC0 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Htatsf1Q8BGC0 AC151895.1-201ENSMUST00000219025 1742 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Htatsf1Q8BGC0 Zfp341-202ENSMUST00000109702 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Htatsf1Q8BGC0 Smpd3-201ENSMUST00000067512 5148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Htatsf1Q8BGC0 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Htatsf1Q8BGC0 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Htatsf1Q8BGC0 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Htatsf1Q8BGC0 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Htatsf1Q8BGC0 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Htatsf1Q8BGC0 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Htatsf1Q8BGC0 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Htatsf1Q8BGC0 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Htatsf1Q8BGC0 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Htatsf1Q8BGC0 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Htatsf1Q8BGC0 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Htatsf1Q8BGC0 Api5-201ENSMUST00000028617 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Htatsf1Q8BGC0 Pcid2-201ENSMUST00000164416 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Htatsf1Q8BGC0 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Htatsf1Q8BGC0 Ano6-208ENSMUST00000227791 3149 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Htatsf1Q8BGC0 Sorcs1-205ENSMUST00000209413 4398 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Htatsf1Q8BGC0 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Htatsf1Q8BGC0 Gm26635-201ENSMUST00000181077 3199 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Htatsf1Q8BGC0 Sidt1-205ENSMUST00000136381 4404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Htatsf1Q8BGC0 Gm44851-201ENSMUST00000205735 2309 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Htatsf1Q8BGC0 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Htatsf1Q8BGC0 Zfand4-202ENSMUST00000112900 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Htatsf1Q8BGC0 Zfp125-201ENSMUST00000079237 2488 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Htatsf1Q8BGC0 Gpat3-201ENSMUST00000031255 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Htatsf1Q8BGC0 BC051019-201ENSMUST00000033334 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Htatsf1Q8BGC0 Parp3-202ENSMUST00000112479 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Htatsf1Q8BGC0 Atg2b-201ENSMUST00000041055 7546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Htatsf1Q8BGC0 Paupar-201ENSMUST00000194826 3482 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Htatsf1Q8BGC0 Intu-202ENSMUST00000091186 6387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Htatsf1Q8BGC0 Ttbk1-203ENSMUST00000225808 8926 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Htatsf1Q8BGC0 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Htatsf1Q8BGC0 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Htatsf1Q8BGC0 Treh-202ENSMUST00000071219 1927 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Htatsf1Q8BGC0 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Htatsf1Q8BGC0 Ankmy2-201ENSMUST00000041640 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Htatsf1Q8BGC0 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Htatsf1Q8BGC0 Rab11fip3-203ENSMUST00000122103 5015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Htatsf1Q8BGC0 Mir874-201ENSMUST00000104769 76 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Htatsf1Q8BGC0 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Htatsf1Q8BGC0 Gm11524-201ENSMUST00000119349 807 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Htatsf1Q8BGC0 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Htatsf1Q8BGC0 Gm7558-201ENSMUST00000193221 1165 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Htatsf1Q8BGC0 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Htatsf1Q8BGC0 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Htatsf1Q8BGC0 AC122314.1-201ENSMUST00000223056 2239 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Htatsf1Q8BGC0 Atp6v1b1-201ENSMUST00000006431 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Htatsf1Q8BGC0 Pphln1-204ENSMUST00000165935 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Htatsf1Q8BGC0 Calu-206ENSMUST00000172974 3063 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Htatsf1Q8BGC0 Gramd1b-201ENSMUST00000045682 7488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Htatsf1Q8BGC0 AL732309.2-201ENSMUST00000228052 3210 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Htatsf1Q8BGC0 Baiap2l1-201ENSMUST00000055190 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Htatsf1Q8BGC0 Misp-201ENSMUST00000046833 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Htatsf1Q8BGC0 Pphln1-202ENSMUST00000068457 3816 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Htatsf1Q8BGC0 Gprasp1-201ENSMUST00000113144 5843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Htatsf1Q8BGC0 Sdf4-201ENSMUST00000050078 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Htatsf1Q8BGC0 Fam214b-201ENSMUST00000036462 3074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Htatsf1Q8BGC0 Brdt-201ENSMUST00000031215 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Htatsf1Q8BGC0 Serpinb12-201ENSMUST00000081277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Htatsf1Q8BGC0 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Htatsf1Q8BGC0 Col6a3-208ENSMUST00000188587 8285 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Htatsf1Q8BGC0 Stx11-201ENSMUST00000042861 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Htatsf1Q8BGC0 4930430F08Rik-201ENSMUST00000054471 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Htatsf1Q8BGC0 Vit-201ENSMUST00000024880 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Htatsf1Q8BGC0 Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Htatsf1Q8BGC0 Slc35d1-203ENSMUST00000150285 4242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Htatsf1Q8BGC0 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Htatsf1Q8BGC0 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Htatsf1Q8BGC0 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Htatsf1Q8BGC0 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Htatsf1Q8BGC0 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Htatsf1Q8BGC0 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Htatsf1Q8BGC0 Ccpg1-208ENSMUST00000150826 2939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Htatsf1Q8BGC0 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Htatsf1Q8BGC0 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Htatsf1Q8BGC0 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Htatsf1Q8BGC0 Gm8515-201ENSMUST00000194852 576 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Htatsf1Q8BGC0 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Htatsf1Q8BGC0 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Htatsf1Q8BGC0 Wnt7b-201ENSMUST00000023015 3371 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Htatsf1Q8BGC0 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Htatsf1Q8BGC0 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Htatsf1Q8BGC0 A530016L24Rik-201ENSMUST00000057465 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Htatsf1Q8BGC0 Adprhl1-205ENSMUST00000204916 5228 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Htatsf1Q8BGC0 Sun2-202ENSMUST00000089311 3709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Htatsf1Q8BGC0 Gm37105-201ENSMUST00000192251 2085 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Htatsf1Q8BGC0 Rnft2-202ENSMUST00000121369 4431 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Htatsf1Q8BGC0 Nelfcd-202ENSMUST00000109075 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Htatsf1Q8BGC0 Jmjd8-205ENSMUST00000133595 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Htatsf1Q8BGC0 Psd-210ENSMUST00000225323 3398 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Htatsf1Q8BGC0 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Htatsf1Q8BGC0 Myh13-202ENSMUST00000108684 6062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Htatsf1Q8BGC0 Afmid-201ENSMUST00000073388 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Htatsf1Q8BGC0 Clpx-202ENSMUST00000113824 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Htatsf1Q8BGC0 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Htatsf1Q8BGC0 Uggt2-212ENSMUST00000156203 6456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Htatsf1Q8BGC0 Xpo1-201ENSMUST00000020538 5145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
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