Protein–RNA interactions for Protein: Q80VR2

Ell3, RNA polymerase II elongation factor ELL3, mousemouse

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Length 395 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ell3Q80VR2 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ell3Q80VR2 Synj2-202ENSMUST00000080283 4793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ell3Q80VR2 Tcf4-250ENSMUST00000202458 2610 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ell3Q80VR2 Abca7-203ENSMUST00000171637 6638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ell3Q80VR2 Gm595-201ENSMUST00000114928 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ell3Q80VR2 Kctd18-210ENSMUST00000164963 2114 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ell3Q80VR2 Psmd9-201ENSMUST00000100729 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ell3Q80VR2 Tubd1-201ENSMUST00000020821 2070 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ell3Q80VR2 Gm5989-201ENSMUST00000096092 2077 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Ell3Q80VR2 Dach2-201ENSMUST00000067219 2520 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ell3Q80VR2 Hnrnpk-202ENSMUST00000116403 2970 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ell3Q80VR2 Fip1l1-204ENSMUST00000113536 4769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ell3Q80VR2 Ptgdr-201ENSMUST00000095959 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ell3Q80VR2 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ell3Q80VR2 Adora1-202ENSMUST00000086465 4968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ell3Q80VR2 Bop1-201ENSMUST00000023217 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ell3Q80VR2 Rfx6-204ENSMUST00000219364 2682 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ell3Q80VR2 Gm26880-201ENSMUST00000181610 1318 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ell3Q80VR2 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Ell3Q80VR2 Cyth3-202ENSMUST00000116456 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ell3Q80VR2 AI839979-202ENSMUST00000201790 1539 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ell3Q80VR2 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ell3Q80VR2 Fmo1-201ENSMUST00000046049 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ell3Q80VR2 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ell3Q80VR2 Smg8-201ENSMUST00000020801 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ell3Q80VR2 Chst4-201ENSMUST00000109222 1942 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ell3Q80VR2 Vmn1r24-201ENSMUST00000228097 1901 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ell3Q80VR2 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ell3Q80VR2 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Ell3Q80VR2 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ell3Q80VR2 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Ell3Q80VR2 Nat8f1-201ENSMUST00000161198 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ell3Q80VR2 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Ell3Q80VR2 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ell3Q80VR2 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Ell3Q80VR2 2810047C21Rik1-202ENSMUST00000210322 1179 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ell3Q80VR2 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Ell3Q80VR2 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ell3Q80VR2 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ell3Q80VR2 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ell3Q80VR2 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ell3Q80VR2 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ell3Q80VR2 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ell3Q80VR2 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ell3Q80VR2 Cog7-203ENSMUST00000205438 3355 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ell3Q80VR2 Tmed9-203ENSMUST00000224741 1450 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Ell3Q80VR2 Hspa2-202ENSMUST00000219555 2526 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ell3Q80VR2 Otop1-201ENSMUST00000063136 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ell3Q80VR2 Vps52-201ENSMUST00000025178 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ell3Q80VR2 AC159195.1-201ENSMUST00000225867 2086 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Ell3Q80VR2 Slc25a42-201ENSMUST00000063788 3081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ell3Q80VR2 Chrd-201ENSMUST00000007171 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ell3Q80VR2 Apbb2-216ENSMUST00000162366 6540 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ell3Q80VR2 Lrch1-201ENSMUST00000088970 4694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ell3Q80VR2 Lamb3-209ENSMUST00000194677 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ell3Q80VR2 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Ell3Q80VR2 Zfp957-201ENSMUST00000040802 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Ell3Q80VR2 Rasa3-201ENSMUST00000117551 4404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Ell3Q80VR2 Lig1-210ENSMUST00000165964 3166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Ell3Q80VR2 Grm4-202ENSMUST00000118489 2976 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Ell3Q80VR2 Ddx55-201ENSMUST00000071057 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Ell3Q80VR2 Abo-201ENSMUST00000102900 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Ell3Q80VR2 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Ell3Q80VR2 Thrb-203ENSMUST00000091471 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Ell3Q80VR2 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Ell3Q80VR2 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Ell3Q80VR2 Fosb-203ENSMUST00000207716 3546 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ell3Q80VR2 Man2c1-215ENSMUST00000161182 2909 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ell3Q80VR2 Gtf2ird1-224ENSMUST00000202280 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ell3Q80VR2 Gm10578-202ENSMUST00000211070 2876 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ell3Q80VR2 Acvr1c-201ENSMUST00000028178 9162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ell3Q80VR2 Lipe-201ENSMUST00000003207 3613 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ell3Q80VR2 Ccdc114-201ENSMUST00000038720 2460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ell3Q80VR2 Sema6d-207ENSMUST00000103240 4372 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ell3Q80VR2 Mtr-201ENSMUST00000099856 8294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ell3Q80VR2 2010315B03Rik-202ENSMUST00000177714 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ell3Q80VR2 Gm10652-201ENSMUST00000199790 2622 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Ell3Q80VR2 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ell3Q80VR2 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ell3Q80VR2 Baiap3-202ENSMUST00000182056 4645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ell3Q80VR2 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ell3Q80VR2 Pabpc2-201ENSMUST00000063219 2586 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ell3Q80VR2 Zfp853-203ENSMUST00000212715 3133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ell3Q80VR2 Wdr33-201ENSMUST00000025264 6206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ell3Q80VR2 R3hdm2-210ENSMUST00000164831 2937 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ell3Q80VR2 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ell3Q80VR2 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ell3Q80VR2 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Ell3Q80VR2 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Ell3Q80VR2 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ell3Q80VR2 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ell3Q80VR2 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Ell3Q80VR2 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Ell3Q80VR2 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ell3Q80VR2 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Ell3Q80VR2 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Ell3Q80VR2 Gnb4-205ENSMUST00000155737 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ell3Q80VR2 Tmc4-201ENSMUST00000038743 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ell3Q80VR2 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ell3Q80VR2 Pcsk7-209ENSMUST00000216672 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
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