Protein–RNA interactions for Protein: Q7TS74

Ckap2l, Cytoskeleton-associated protein 2-like, mousemouse

Predictions only

Length 745 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ckap2lQ7TS74 Rab10os-203ENSMUST00000178074 4006 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ckap2lQ7TS74 Gpd2-201ENSMUST00000028167 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ckap2lQ7TS74 Arr3-201ENSMUST00000113769 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ckap2lQ7TS74 Rabepk-207ENSMUST00000145903 2968 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ckap2lQ7TS74 Wfs1-201ENSMUST00000043964 3787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ckap2lQ7TS74 Rbms1-201ENSMUST00000028347 4436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ckap2lQ7TS74 Stard5-202ENSMUST00000117410 2832 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ckap2lQ7TS74 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ckap2lQ7TS74 Net1-201ENSMUST00000091853 2680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Ckap2lQ7TS74 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Ckap2lQ7TS74 Trpv4-202ENSMUST00000112217 2436 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ckap2lQ7TS74 Etaa1-201ENSMUST00000076661 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ckap2lQ7TS74 Rbfox2-202ENSMUST00000111581 3072 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ckap2lQ7TS74 Acbd5-213ENSMUST00000227809 1986 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ckap2lQ7TS74 Gm5989-201ENSMUST00000096092 2077 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Ckap2lQ7TS74 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ckap2lQ7TS74 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ckap2lQ7TS74 Coasy-202ENSMUST00000107308 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ckap2lQ7TS74 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ckap2lQ7TS74 Trim23-201ENSMUST00000022225 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ckap2lQ7TS74 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ckap2lQ7TS74 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ckap2lQ7TS74 Ppfia4-205ENSMUST00000189361 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ckap2lQ7TS74 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ckap2lQ7TS74 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Ckap2lQ7TS74 Cox16-202ENSMUST00000110340 668 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ckap2lQ7TS74 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ckap2lQ7TS74 Gm26464-201ENSMUST00000157094 305 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Ckap2lQ7TS74 Gm16251-201ENSMUST00000162649 338 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ckap2lQ7TS74 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ckap2lQ7TS74 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ckap2lQ7TS74 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ckap2lQ7TS74 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Ckap2lQ7TS74 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ckap2lQ7TS74 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ckap2lQ7TS74 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ckap2lQ7TS74 Tcf4-204ENSMUST00000114978 2437 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ckap2lQ7TS74 Nmral1-204ENSMUST00000120056 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ckap2lQ7TS74 E2f7-201ENSMUST00000073781 5473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ckap2lQ7TS74 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ckap2lQ7TS74 Myadm-203ENSMUST00000203328 1899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ckap2lQ7TS74 Hp1bp3-201ENSMUST00000030541 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ckap2lQ7TS74 Fibin-201ENSMUST00000099626 2267 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ckap2lQ7TS74 Vwa7-201ENSMUST00000007245 4313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ckap2lQ7TS74 Cadm1-203ENSMUST00000114547 4444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ckap2lQ7TS74 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ckap2lQ7TS74 Kcnc1-203ENSMUST00000160433 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ckap2lQ7TS74 Bmp7-201ENSMUST00000009143 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ckap2lQ7TS74 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ckap2lQ7TS74 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ckap2lQ7TS74 Rpap1-203ENSMUST00000110793 5458 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ckap2lQ7TS74 Rasgef1a-202ENSMUST00000203482 2227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ckap2lQ7TS74 Ccdc162-208ENSMUST00000179614 2739 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ckap2lQ7TS74 Ano6-208ENSMUST00000227791 3149 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ckap2lQ7TS74 Col6a2-201ENSMUST00000001181 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ckap2lQ7TS74 Csrnp2-201ENSMUST00000061457 4126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ckap2lQ7TS74 Ddr1-204ENSMUST00000119825 3769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ckap2lQ7TS74 Ttpa-203ENSMUST00000121491 2862 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ckap2lQ7TS74 Vmn1r65-201ENSMUST00000086338 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ckap2lQ7TS74 Capn11-201ENSMUST00000120717 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ckap2lQ7TS74 Sorbs3-202ENSMUST00000227259 2481 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ckap2lQ7TS74 4921507P07Rik-201ENSMUST00000031852 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ckap2lQ7TS74 Lctl-201ENSMUST00000034969 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ckap2lQ7TS74 Madd-209ENSMUST00000111371 5816 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ckap2lQ7TS74 Madd-210ENSMUST00000111372 5813 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ckap2lQ7TS74 Hnrnpc-211ENSMUST00000228748 1691 ntAPPRIS P5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ckap2lQ7TS74 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ckap2lQ7TS74 Pbx1-205ENSMUST00000176540 6876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ckap2lQ7TS74 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ckap2lQ7TS74 Tmem132e-202ENSMUST00000092852 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ckap2lQ7TS74 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ckap2lQ7TS74 Gm11524-201ENSMUST00000119349 807 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Ckap2lQ7TS74 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ckap2lQ7TS74 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ckap2lQ7TS74 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ckap2lQ7TS74 Gm29019-202ENSMUST00000188623 564 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ckap2lQ7TS74 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ckap2lQ7TS74 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ckap2lQ7TS74 Ttbk2-202ENSMUST00000057135 11066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ckap2lQ7TS74 Myh2-203ENSMUST00000170159 6083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ckap2lQ7TS74 Abcc6-201ENSMUST00000002850 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ckap2lQ7TS74 Phrf1-202ENSMUST00000122143 4864 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ckap2lQ7TS74 Qrfp-201ENSMUST00000057407 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ckap2lQ7TS74 Trp53i11-202ENSMUST00000111266 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ckap2lQ7TS74 Usp33-209ENSMUST00000197748 4183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ckap2lQ7TS74 Gm3764-205ENSMUST00000181134 2203 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ckap2lQ7TS74 Acly-203ENSMUST00000107389 4426 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ckap2lQ7TS74 Sema4a-202ENSMUST00000107531 2897 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ckap2lQ7TS74 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ckap2lQ7TS74 Nsun7-204ENSMUST00000202994 3632 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ckap2lQ7TS74 Kdm2a-201ENSMUST00000047898 8578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ckap2lQ7TS74 Rspry1-201ENSMUST00000060389 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ckap2lQ7TS74 Astn1-202ENSMUST00000170718 2927 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ckap2lQ7TS74 Scyl2-201ENSMUST00000092227 3566 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ckap2lQ7TS74 Bud13-201ENSMUST00000074957 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ckap2lQ7TS74 Stx3-203ENSMUST00000075304 2430 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ckap2lQ7TS74 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ckap2lQ7TS74 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ckap2lQ7TS74 Slc26a5-201ENSMUST00000030878 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ckap2lQ7TS74 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.5 ms