Protein–RNA interactions for Protein: Q7TPR4

Actn1, Alpha-actinin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 892 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Actn1Q7TPR4 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Actn1Q7TPR4 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Actn1Q7TPR4 Mpi-201ENSMUST00000034856 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Actn1Q7TPR4 Jph2-201ENSMUST00000017961 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Actn1Q7TPR4 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Actn1Q7TPR4 Dpysl4-202ENSMUST00000121184 2727 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Actn1Q7TPR4 Slc4a1ap-209ENSMUST00000202214 2806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Actn1Q7TPR4 Myh7-201ENSMUST00000102803 6135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Actn1Q7TPR4 Gm37861-201ENSMUST00000193534 2869 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Actn1Q7TPR4 Gm45638-201ENSMUST00000211507 2878 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Actn1Q7TPR4 Pcp2-206ENSMUST00000144977 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Actn1Q7TPR4 Gm5637-201ENSMUST00000153890 1119 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Actn1Q7TPR4 Gm45233-201ENSMUST00000203633 898 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Actn1Q7TPR4 Gm7619-201ENSMUST00000210649 1282 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Actn1Q7TPR4 Gm45865-201ENSMUST00000211815 945 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Actn1Q7TPR4 AC167229.2-201ENSMUST00000218902 675 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Actn1Q7TPR4 CT573034.1-201ENSMUST00000222983 313 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Actn1Q7TPR4 Mir433-201ENSMUST00000093564 124 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Actn1Q7TPR4 4930528D03Rik-203ENSMUST00000225577 1348 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Actn1Q7TPR4 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Actn1Q7TPR4 E230029C05Rik-202ENSMUST00000207458 2445 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Actn1Q7TPR4 Cant1-203ENSMUST00000106287 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Actn1Q7TPR4 Tbc1d1-201ENSMUST00000043893 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Actn1Q7TPR4 Kcnn2-205ENSMUST00000183850 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Actn1Q7TPR4 Lypla1-201ENSMUST00000027036 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Actn1Q7TPR4 Bhlhb9-204ENSMUST00000180025 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Actn1Q7TPR4 Setd1b-206ENSMUST00000174836 7515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Actn1Q7TPR4 Adam22-207ENSMUST00000115388 9161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Actn1Q7TPR4 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Actn1Q7TPR4 Hadhb-202ENSMUST00000114783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Actn1Q7TPR4 Gm43423-201ENSMUST00000198390 2094 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Actn1Q7TPR4 5330426L24Rik-201ENSMUST00000200008 2175 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Actn1Q7TPR4 Gm44891-201ENSMUST00000208817 2223 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Actn1Q7TPR4 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Actn1Q7TPR4 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Actn1Q7TPR4 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Actn1Q7TPR4 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Actn1Q7TPR4 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Actn1Q7TPR4 Ahdc1-204ENSMUST00000105916 6602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Actn1Q7TPR4 Adcyap1r1-202ENSMUST00000070756 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Actn1Q7TPR4 Phlda2-201ENSMUST00000010904 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Actn1Q7TPR4 Gm11618-201ENSMUST00000117946 267 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Actn1Q7TPR4 Rab15-204ENSMUST00000122419 856 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Actn1Q7TPR4 Gm11751-201ENSMUST00000126187 460 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Actn1Q7TPR4 1700012C08Rik-201ENSMUST00000141554 363 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Actn1Q7TPR4 Cdk3-ps-202ENSMUST00000174177 915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Actn1Q7TPR4 Smad7-204ENSMUST00000174411 769 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Actn1Q7TPR4 D930030I03Rik-201ENSMUST00000180735 920 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Actn1Q7TPR4 Gm29608-201ENSMUST00000190444 463 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Actn1Q7TPR4 Jakmip1-215ENSMUST00000212047 1191 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Actn1Q7TPR4 Tyms-ps-201ENSMUST00000219550 915 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Actn1Q7TPR4 Ifi30-202ENSMUST00000222087 981 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Actn1Q7TPR4 Dlk1-204ENSMUST00000109843 1300 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Actn1Q7TPR4 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Actn1Q7TPR4 Haus7-201ENSMUST00000033737 1380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Actn1Q7TPR4 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Actn1Q7TPR4 2610507B11Rik-201ENSMUST00000010421 7443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Actn1Q7TPR4 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Actn1Q7TPR4 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Actn1Q7TPR4 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Actn1Q7TPR4 Efhc1-201ENSMUST00000038447 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Actn1Q7TPR4 Gm2115-201ENSMUST00000180387 7055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Actn1Q7TPR4 Zfp384-202ENSMUST00000054553 2451 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Actn1Q7TPR4 Mknk1-201ENSMUST00000019677 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Actn1Q7TPR4 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Actn1Q7TPR4 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Actn1Q7TPR4 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Actn1Q7TPR4 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Actn1Q7TPR4 Dhx30-201ENSMUST00000062368 3806 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Actn1Q7TPR4 Nfasc-207ENSMUST00000187861 4927 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Actn1Q7TPR4 Gk5-202ENSMUST00000122383 4455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Actn1Q7TPR4 Scara5-201ENSMUST00000022610 3794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Actn1Q7TPR4 Spib-201ENSMUST00000035323 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Actn1Q7TPR4 Ptgdr2-201ENSMUST00000037261 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Actn1Q7TPR4 Bptf-202ENSMUST00000106762 11847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Actn1Q7TPR4 Astl-202ENSMUST00000089673 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Actn1Q7TPR4 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Actn1Q7TPR4 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Actn1Q7TPR4 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Actn1Q7TPR4 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Actn1Q7TPR4 Rnf26-205ENSMUST00000215685 1804 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Actn1Q7TPR4 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Actn1Q7TPR4 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Actn1Q7TPR4 Mfsd4b5-205ENSMUST00000170579 1554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Actn1Q7TPR4 Dlx5-202ENSMUST00000142635 1324 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Actn1Q7TPR4 Tmod4-202ENSMUST00000107227 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Actn1Q7TPR4 Gm14381-201ENSMUST00000122105 414 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Actn1Q7TPR4 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Actn1Q7TPR4 Gm15738-202ENSMUST00000140892 427 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Actn1Q7TPR4 A930009A15Rik-201ENSMUST00000173620 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Actn1Q7TPR4 Pced1c-ps-201ENSMUST00000187740 751 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Actn1Q7TPR4 Gm18753-201ENSMUST00000201000 566 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Actn1Q7TPR4 Gm6334-201ENSMUST00000207083 228 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Actn1Q7TPR4 Caly-203ENSMUST00000211044 1029 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Actn1Q7TPR4 Gm10608-202ENSMUST00000213924 676 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Actn1Q7TPR4 Gm4935-201ENSMUST00000221316 1198 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Actn1Q7TPR4 Tsc22d4-201ENSMUST00000031738 1043 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Actn1Q7TPR4 Mrap-201ENSMUST00000038197 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Actn1Q7TPR4 Fgf2-201ENSMUST00000038885 462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Actn1Q7TPR4 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
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