Protein–RNA interactions for Protein: Q78RX3

Smim12, Small integral membrane protein 12, mousemouse

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Length 92 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim12Q78RX3 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC11□□□□□ -0.65
Smim12Q78RX3 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC11□□□□□ -0.65
Smim12Q78RX3 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
Smim12Q78RX3 Cbfa2t2-ps1-201ENSMUST00000117165 730 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Smim12Q78RX3 Gm15376-201ENSMUST00000122258 783 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Smim12Q78RX3 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Smim12Q78RX3 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Smim12Q78RX3 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Smim12Q78RX3 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC11□□□□□ -0.65
Smim12Q78RX3 Gm29608-201ENSMUST00000190444 463 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Smim12Q78RX3 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Smim12Q78RX3 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Smim12Q78RX3 Gm4610-201ENSMUST00000198222 905 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Smim12Q78RX3 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
Smim12Q78RX3 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Smim12Q78RX3 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
Smim12Q78RX3 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Smim12Q78RX3 AC147241.1-201ENSMUST00000222173 785 ntTSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
Smim12Q78RX3 Nexmif-202ENSMUST00000087879 10891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Smim12Q78RX3 Lrrc8e-201ENSMUST00000053035 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Smim12Q78RX3 Nek3-202ENSMUST00000110730 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Smim12Q78RX3 AC122228.1-201ENSMUST00000223113 2057 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Smim12Q78RX3 Gm26747-201ENSMUST00000180597 1716 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Smim12Q78RX3 Arcn1-201ENSMUST00000034607 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Smim12Q78RX3 Smarcd2-203ENSMUST00000106843 2548 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Smim12Q78RX3 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Smim12Q78RX3 Ranbp17-202ENSMUST00000102815 5001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Smim12Q78RX3 Ifnar2-201ENSMUST00000023693 3047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Smim12Q78RX3 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Smim12Q78RX3 4930520O04Rik-202ENSMUST00000131898 2660 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Smim12Q78RX3 Micalcl-201ENSMUST00000033033 2259 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Smim12Q78RX3 Armc7-201ENSMUST00000035240 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Smim12Q78RX3 Arhgef15-203ENSMUST00000108671 4372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Smim12Q78RX3 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Smim12Q78RX3 4930432E11Rik-202ENSMUST00000063585 10871 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Smim12Q78RX3 Dlgap3-203ENSMUST00000106094 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Smim12Q78RX3 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Smim12Q78RX3 Gm44094-201ENSMUST00000204703 2030 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Smim12Q78RX3 Brd3-202ENSMUST00000077737 5272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Smim12Q78RX3 AC117194.1-201ENSMUST00000224847 3002 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Smim12Q78RX3 Gm42480-201ENSMUST00000198434 2595 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Smim12Q78RX3 Gm4755-201ENSMUST00000181803 2647 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Smim12Q78RX3 Vwf-202ENSMUST00000112253 2184 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Smim12Q78RX3 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Smim12Q78RX3 Cyp2a4-201ENSMUST00000098657 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Smim12Q78RX3 Kif26b-201ENSMUST00000160789 6216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Smim12Q78RX3 Sptbn2-201ENSMUST00000008991 8251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Smim12Q78RX3 Cul9-204ENSMUST00000182485 7848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Smim12Q78RX3 Ins2-204ENSMUST00000105932 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Smim12Q78RX3 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Smim12Q78RX3 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Smim12Q78RX3 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Smim12Q78RX3 Gm38223-201ENSMUST00000194484 695 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Smim12Q78RX3 Gm42550-201ENSMUST00000201553 960 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Smim12Q78RX3 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Smim12Q78RX3 Ins2-201ENSMUST00000000220 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Smim12Q78RX3 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Smim12Q78RX3 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Smim12Q78RX3 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Smim12Q78RX3 Rn7sk-201ENSMUST00000083103 331 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Smim12Q78RX3 Gm26315-201ENSMUST00000083890 321 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Smim12Q78RX3 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Smim12Q78RX3 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Smim12Q78RX3 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Smim12Q78RX3 Tlr9-201ENSMUST00000062241 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Smim12Q78RX3 4933439K11Rik-203ENSMUST00000169111 1869 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Smim12Q78RX3 Ncoa7-201ENSMUST00000068567 5105 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Smim12Q78RX3 B4galnt3-203ENSMUST00000212457 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Smim12Q78RX3 Gm16582-201ENSMUST00000159627 1930 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Smim12Q78RX3 Glo1-201ENSMUST00000024823 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Smim12Q78RX3 Mast3-203ENSMUST00000211948 4251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Smim12Q78RX3 Atxn7l1os2-201ENSMUST00000138617 2019 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Smim12Q78RX3 Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Smim12Q78RX3 Synpo-209ENSMUST00000143275 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Smim12Q78RX3 Ccdc163-201ENSMUST00000030452 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Smim12Q78RX3 Osbpl1a-201ENSMUST00000074352 3956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Smim12Q78RX3 Otub2-201ENSMUST00000021620 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Smim12Q78RX3 Gm45266-201ENSMUST00000210111 2173 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Smim12Q78RX3 Bcl7a-201ENSMUST00000031391 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Smim12Q78RX3 Astl-204ENSMUST00000179618 2236 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Smim12Q78RX3 Gm3764-205ENSMUST00000181134 2203 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Smim12Q78RX3 Armc6-201ENSMUST00000019679 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Smim12Q78RX3 Ccdc81-201ENSMUST00000041195 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Smim12Q78RX3 Slc26a6-201ENSMUST00000098376 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Smim12Q78RX3 Srr-202ENSMUST00000108447 3138 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Smim12Q78RX3 Cyth1-204ENSMUST00000106305 3179 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Smim12Q78RX3 Fancc-201ENSMUST00000073029 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Smim12Q78RX3 Kcnj12-203ENSMUST00000108717 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Smim12Q78RX3 Cops4-201ENSMUST00000045993 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Smim12Q78RX3 Anapc11-201ENSMUST00000026128 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Smim12Q78RX3 Adra1b-201ENSMUST00000067258 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Smim12Q78RX3 D030068K23Rik-201ENSMUST00000180382 2617 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Smim12Q78RX3 Slc16a2-201ENSMUST00000042664 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Smim12Q78RX3 Rapgef2-202ENSMUST00000118340 6544 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Smim12Q78RX3 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Smim12Q78RX3 Dmp1-201ENSMUST00000066708 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Smim12Q78RX3 Zfp64-203ENSMUST00000109162 2848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Smim12Q78RX3 Vmn1r45-207ENSMUST00000228492 2849 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Smim12Q78RX3 Nsd3-206ENSMUST00000142395 10105 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Smim12Q78RX3 Tmem39a-201ENSMUST00000002924 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
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