Protein–RNA interactions for Protein: Q78IS1

Tmed3, Transmembrane emp24 domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed3Q78IS1 Sec61g-203ENSMUST00000109643 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Tmed3Q78IS1 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Tmed3Q78IS1 Sec22b-201ENSMUST00000029476 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Tmed3Q78IS1 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Tmed3Q78IS1 Tmem161a-201ENSMUST00000002413 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Tmed3Q78IS1 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Tmed3Q78IS1 Vsig10l-201ENSMUST00000107977 3836 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Tmed3Q78IS1 Gm42141-201ENSMUST00000196534 2172 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Tmed3Q78IS1 Srrm2-201ENSMUST00000088621 8564 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Tmed3Q78IS1 Prx-202ENSMUST00000098644 4841 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Tmed3Q78IS1 Ccdc57-201ENSMUST00000056781 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Tmed3Q78IS1 Slc35a4-202ENSMUST00000050476 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Tmed3Q78IS1 Prkag3-202ENSMUST00000113672 2003 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Tmed3Q78IS1 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Tmed3Q78IS1 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Tmed3Q78IS1 Hdac6-202ENSMUST00000115642 4069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Tmed3Q78IS1 Myh8-201ENSMUST00000019625 6149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Tmed3Q78IS1 Inpp4a-206ENSMUST00000132615 3038 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Tmed3Q78IS1 Gm37613-201ENSMUST00000195677 3580 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Tmed3Q78IS1 Dnm2-201ENSMUST00000072362 3502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Tmed3Q78IS1 Dis3l-201ENSMUST00000068367 3605 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Tmed3Q78IS1 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Tmed3Q78IS1 Micalcl-201ENSMUST00000033033 2259 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Tmed3Q78IS1 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Tmed3Q78IS1 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Tmed3Q78IS1 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Tmed3Q78IS1 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Tmed3Q78IS1 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Tmed3Q78IS1 Gm28913-201ENSMUST00000186240 364 ntTSL 3 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Tmed3Q78IS1 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Tmed3Q78IS1 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Tmed3Q78IS1 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Tmed3Q78IS1 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Tmed3Q78IS1 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Tmed3Q78IS1 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Tmed3Q78IS1 Hvcn1-202ENSMUST00000100747 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Tmed3Q78IS1 Spata13-207ENSMUST00000160973 7467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Tmed3Q78IS1 Chrnd-201ENSMUST00000073252 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Tmed3Q78IS1 Casc1-203ENSMUST00000111728 2682 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Tmed3Q78IS1 Mtmr11-201ENSMUST00000054356 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Tmed3Q78IS1 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Tmed3Q78IS1 Inpp4a-211ENSMUST00000168546 2964 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Tmed3Q78IS1 Uchl1os-201ENSMUST00000152002 1685 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Tmed3Q78IS1 Cr1l-201ENSMUST00000075451 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Tmed3Q78IS1 Acnat2-201ENSMUST00000081541 1664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Tmed3Q78IS1 Adgrl3-214ENSMUST00000120445 5230 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Tmed3Q78IS1 Slc25a42-202ENSMUST00000110127 3196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Tmed3Q78IS1 Dtx3l-202ENSMUST00000114885 2648 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Tmed3Q78IS1 Gm44942-201ENSMUST00000096093 2072 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Tmed3Q78IS1 Zfp597-201ENSMUST00000090522 5668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Tmed3Q78IS1 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Tmed3Q78IS1 Rasgef1b-203ENSMUST00000146396 3339 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Tmed3Q78IS1 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Tmed3Q78IS1 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Tmed3Q78IS1 Rpap2-205ENSMUST00000112655 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Tmed3Q78IS1 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Tmed3Q78IS1 Otud7b-202ENSMUST00000090785 8101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Tmed3Q78IS1 Adamts10-201ENSMUST00000087623 4043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Tmed3Q78IS1 Nos3-201ENSMUST00000030834 4132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Tmed3Q78IS1 Hsd3b6-201ENSMUST00000029463 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Tmed3Q78IS1 Kbtbd12-202ENSMUST00000120933 4644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Tmed3Q78IS1 Slc37a4-207ENSMUST00000215420 2128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Tmed3Q78IS1 Phf24-202ENSMUST00000107975 6494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Tmed3Q78IS1 Gm2238-201ENSMUST00000192074 3669 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Tmed3Q78IS1 Mki67-201ENSMUST00000033310 10061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Tmed3Q78IS1 Agtrap-201ENSMUST00000030865 3996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Tmed3Q78IS1 Cyb5r3-202ENSMUST00000162178 2547 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Tmed3Q78IS1 Trub2-201ENSMUST00000048044 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Tmed3Q78IS1 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Tmed3Q78IS1 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Tmed3Q78IS1 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Tmed3Q78IS1 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Tmed3Q78IS1 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Tmed3Q78IS1 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Tmed3Q78IS1 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Tmed3Q78IS1 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Tmed3Q78IS1 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Tmed3Q78IS1 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Tmed3Q78IS1 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Tmed3Q78IS1 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Tmed3Q78IS1 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Tmed3Q78IS1 Myt1l-201ENSMUST00000021009 5027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Tmed3Q78IS1 Lrrc36-201ENSMUST00000067305 2082 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Tmed3Q78IS1 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Tmed3Q78IS1 Cutal-201ENSMUST00000028228 2179 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Tmed3Q78IS1 Tnip1-202ENSMUST00000102730 2787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Tmed3Q78IS1 Msh5-201ENSMUST00000007250 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Tmed3Q78IS1 Gm26599-201ENSMUST00000180590 3189 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Tmed3Q78IS1 Zbtb42-201ENSMUST00000169593 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Tmed3Q78IS1 Armt1-201ENSMUST00000095893 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Tmed3Q78IS1 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Tmed3Q78IS1 Slc6a9-209ENSMUST00000163288 2107 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Tmed3Q78IS1 Gm15941-205ENSMUST00000140044 1825 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Tmed3Q78IS1 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Tmed3Q78IS1 Pcdhga6-201ENSMUST00000195823 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Tmed3Q78IS1 Rbm8a-203ENSMUST00000198027 2757 ntTSL 3 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Tmed3Q78IS1 Tspan14-201ENSMUST00000047652 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Tmed3Q78IS1 Hectd4-201ENSMUST00000042614 15482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Tmed3Q78IS1 Gatsl2-201ENSMUST00000016088 7367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Tmed3Q78IS1 Rdh13-201ENSMUST00000008579 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.4 ms