Protein–RNA interactions for Protein: Q768S4

Rph3al, Rab effector Noc2, mousemouse

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Length 302 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rph3alQ768S4 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rph3alQ768S4 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rph3alQ768S4 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rph3alQ768S4 Wscd1-201ENSMUST00000021168 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rph3alQ768S4 Sesn2-201ENSMUST00000030724 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rph3alQ768S4 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rph3alQ768S4 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rph3alQ768S4 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rph3alQ768S4 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rph3alQ768S4 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Rph3alQ768S4 Gm15770-201ENSMUST00000117498 584 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Rph3alQ768S4 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rph3alQ768S4 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rph3alQ768S4 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rph3alQ768S4 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rph3alQ768S4 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rph3alQ768S4 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Rph3alQ768S4 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rph3alQ768S4 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rph3alQ768S4 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Rph3alQ768S4 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Rph3alQ768S4 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Rph3alQ768S4 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rph3alQ768S4 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Rph3alQ768S4 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rph3alQ768S4 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rph3alQ768S4 Gm3695-201ENSMUST00000087222 1009 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Rph3alQ768S4 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rph3alQ768S4 Parp14-201ENSMUST00000042665 7417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rph3alQ768S4 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rph3alQ768S4 Gm8108-202ENSMUST00000170207 1961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rph3alQ768S4 Add2-202ENSMUST00000203196 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rph3alQ768S4 Nxf1-201ENSMUST00000010241 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rph3alQ768S4 Plekhb1-204ENSMUST00000107045 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rph3alQ768S4 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rph3alQ768S4 Wdr45-204ENSMUST00000115689 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rph3alQ768S4 Col6a4-201ENSMUST00000121963 7371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rph3alQ768S4 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rph3alQ768S4 Gm42416-201ENSMUST00000115661 2856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rph3alQ768S4 Gipc3-201ENSMUST00000045102 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rph3alQ768S4 Vsig10l-201ENSMUST00000107977 3836 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rph3alQ768S4 Parp16-201ENSMUST00000069000 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rph3alQ768S4 Ndst1-201ENSMUST00000169273 6070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rph3alQ768S4 Gm20683-201ENSMUST00000176751 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rph3alQ768S4 Tjap1-201ENSMUST00000012440 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rph3alQ768S4 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rph3alQ768S4 Cdh7-202ENSMUST00000112701 4945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rph3alQ768S4 Zfp710-202ENSMUST00000164056 5871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rph3alQ768S4 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rph3alQ768S4 Coasy-202ENSMUST00000107308 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rph3alQ768S4 Gm38385-201ENSMUST00000194454 2351 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Rph3alQ768S4 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rph3alQ768S4 Klk2-ps-202ENSMUST00000206865 2684 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rph3alQ768S4 Gad1-205ENSMUST00000130998 1705 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rph3alQ768S4 Nf1-202ENSMUST00000108251 9217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rph3alQ768S4 Mcpt9-201ENSMUST00000095798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rph3alQ768S4 Ece1-201ENSMUST00000102518 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rph3alQ768S4 Tom1l2-202ENSMUST00000093046 4849 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rph3alQ768S4 F10-204ENSMUST00000128418 1395 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rph3alQ768S4 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rph3alQ768S4 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rph3alQ768S4 Ccr7-201ENSMUST00000103134 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rph3alQ768S4 F2-202ENSMUST00000111335 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rph3alQ768S4 Gm17435-202ENSMUST00000212699 1998 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Rph3alQ768S4 Gja5-203ENSMUST00000199597 3668 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rph3alQ768S4 Sgk1-204ENSMUST00000120509 3096 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rph3alQ768S4 Tcf4-249ENSMUST00000202435 2427 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rph3alQ768S4 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rph3alQ768S4 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rph3alQ768S4 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rph3alQ768S4 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rph3alQ768S4 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Rph3alQ768S4 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Rph3alQ768S4 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rph3alQ768S4 9330198N18Rik-201ENSMUST00000146702 1247 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rph3alQ768S4 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rph3alQ768S4 Setdb2-205ENSMUST00000161459 2995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rph3alQ768S4 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rph3alQ768S4 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rph3alQ768S4 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rph3alQ768S4 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rph3alQ768S4 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rph3alQ768S4 Psen1-201ENSMUST00000041806 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rph3alQ768S4 Dnaja2-201ENSMUST00000034138 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rph3alQ768S4 Gnat2-201ENSMUST00000058669 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rph3alQ768S4 Zfp64-203ENSMUST00000109162 2848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rph3alQ768S4 Epb41-207ENSMUST00000105975 5235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rph3alQ768S4 Msh4-201ENSMUST00000005630 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rph3alQ768S4 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rph3alQ768S4 Zfp248-205ENSMUST00000161519 2243 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rph3alQ768S4 Otof-201ENSMUST00000074171 7129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rph3alQ768S4 Tyk2-203ENSMUST00000214454 4770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rph3alQ768S4 Ercc4-201ENSMUST00000023206 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rph3alQ768S4 Ttc23l-201ENSMUST00000022857 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rph3alQ768S4 C1qtnf6-201ENSMUST00000023075 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rph3alQ768S4 Slc25a36-202ENSMUST00000085206 5227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rph3alQ768S4 Krit1-201ENSMUST00000080085 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Rph3alQ768S4 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Rph3alQ768S4 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Rph3alQ768S4 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
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