Protein–RNA interactions for Protein: Q6PEE2

Ctif, CBP80/20-dependent translation initiation factor, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 600 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtifQ6PEE2 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CtifQ6PEE2 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
CtifQ6PEE2 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
CtifQ6PEE2 Gm8927-201ENSMUST00000181978 981 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
CtifQ6PEE2 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
CtifQ6PEE2 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
CtifQ6PEE2 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CtifQ6PEE2 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CtifQ6PEE2 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CtifQ6PEE2 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
CtifQ6PEE2 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
CtifQ6PEE2 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
CtifQ6PEE2 Vwf-201ENSMUST00000100941 1807 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
CtifQ6PEE2 Phka1-206ENSMUST00000122022 6115 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
CtifQ6PEE2 Phka1-202ENSMUST00000052012 6115 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CtifQ6PEE2 Prdx2-203ENSMUST00000109734 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
CtifQ6PEE2 Ugt1a6a-201ENSMUST00000014263 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CtifQ6PEE2 Mixl1-201ENSMUST00000027778 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CtifQ6PEE2 Lrrfip1-202ENSMUST00000068167 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
CtifQ6PEE2 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CtifQ6PEE2 Eef2k-203ENSMUST00000106488 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CtifQ6PEE2 Duox1-201ENSMUST00000099461 5267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
CtifQ6PEE2 Sars-202ENSMUST00000102625 1866 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CtifQ6PEE2 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CtifQ6PEE2 Cmklr1-201ENSMUST00000047936 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CtifQ6PEE2 Bin3-201ENSMUST00000022680 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CtifQ6PEE2 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CtifQ6PEE2 Ptcd3-201ENSMUST00000082094 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CtifQ6PEE2 Chrna3-201ENSMUST00000034851 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CtifQ6PEE2 Lmnb2-204ENSMUST00000179022 3370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CtifQ6PEE2 Thpo-201ENSMUST00000076422 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CtifQ6PEE2 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
CtifQ6PEE2 Rgp1-202ENSMUST00000107886 5888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
CtifQ6PEE2 E230020A03Rik-201ENSMUST00000194646 2386 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
CtifQ6PEE2 AC122371.1-201ENSMUST00000220876 1477 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CtifQ6PEE2 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CtifQ6PEE2 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CtifQ6PEE2 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
CtifQ6PEE2 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CtifQ6PEE2 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CtifQ6PEE2 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CtifQ6PEE2 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
CtifQ6PEE2 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CtifQ6PEE2 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
CtifQ6PEE2 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CtifQ6PEE2 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
CtifQ6PEE2 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CtifQ6PEE2 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CtifQ6PEE2 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC13.88□□□□□ -0.19
CtifQ6PEE2 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CtifQ6PEE2 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CtifQ6PEE2 Spred2-201ENSMUST00000093298 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CtifQ6PEE2 Gm39204-201ENSMUST00000210045 1307 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
CtifQ6PEE2 Lsamp-208ENSMUST00000189358 2766 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
CtifQ6PEE2 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CtifQ6PEE2 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
CtifQ6PEE2 Gabbr1-203ENSMUST00000172792 4036 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CtifQ6PEE2 Gm36957-201ENSMUST00000192982 2824 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
CtifQ6PEE2 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CtifQ6PEE2 Grin1-205ENSMUST00000114312 3838 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CtifQ6PEE2 Grin1-207ENSMUST00000114317 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CtifQ6PEE2 Faah-201ENSMUST00000049095 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CtifQ6PEE2 Pkn1-208ENSMUST00000144258 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CtifQ6PEE2 Tpcn2-201ENSMUST00000058022 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CtifQ6PEE2 Sec61g-203ENSMUST00000109643 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CtifQ6PEE2 Rgs20-202ENSMUST00000118000 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
CtifQ6PEE2 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CtifQ6PEE2 4921522P10Rik-201ENSMUST00000048606 2101 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CtifQ6PEE2 Plg-201ENSMUST00000014578 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CtifQ6PEE2 Brd3-210ENSMUST00000164296 2791 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
CtifQ6PEE2 Phka1-203ENSMUST00000113611 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
CtifQ6PEE2 Phka1-205ENSMUST00000120270 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
CtifQ6PEE2 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CtifQ6PEE2 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
CtifQ6PEE2 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
CtifQ6PEE2 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CtifQ6PEE2 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
CtifQ6PEE2 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
CtifQ6PEE2 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
CtifQ6PEE2 AC154305.4-201ENSMUST00000224520 614 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
CtifQ6PEE2 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CtifQ6PEE2 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CtifQ6PEE2 AC124577.2-201ENSMUST00000217413 2420 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
CtifQ6PEE2 Drd1-202ENSMUST00000221470 3576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CtifQ6PEE2 Mrap2-201ENSMUST00000049457 1931 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
CtifQ6PEE2 Ptprh-201ENSMUST00000049113 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CtifQ6PEE2 Fut1-201ENSMUST00000008605 2580 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CtifQ6PEE2 Wdr4-207ENSMUST00000171171 4153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CtifQ6PEE2 Gm8994-202ENSMUST00000204530 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CtifQ6PEE2 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CtifQ6PEE2 Atg7-212ENSMUST00000182902 2543 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
CtifQ6PEE2 Prickle1-202ENSMUST00000109255 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CtifQ6PEE2 Ttc25-201ENSMUST00000006976 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CtifQ6PEE2 Tceanc2-202ENSMUST00000057043 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CtifQ6PEE2 Gm36987-201ENSMUST00000194704 2979 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
CtifQ6PEE2 Fbxo46-201ENSMUST00000053109 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
CtifQ6PEE2 Zfp819-203ENSMUST00000120935 2156 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
CtifQ6PEE2 Gdf9-201ENSMUST00000018382 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
CtifQ6PEE2 Sdc1-201ENSMUST00000020911 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
CtifQ6PEE2 Zfp429-201ENSMUST00000109732 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
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