Protein–RNA interactions for Protein: Q6P9L4

Usp49, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 49, mousemouse

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Length 685 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp49Q6P9L4 Lmntd1-201ENSMUST00000111706 2350 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Usp49Q6P9L4 Tufm-201ENSMUST00000098048 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Usp49Q6P9L4 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Usp49Q6P9L4 Ptgr2-208ENSMUST00000147363 1869 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Usp49Q6P9L4 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Usp49Q6P9L4 Gm36864-203ENSMUST00000223070 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Usp49Q6P9L4 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Usp49Q6P9L4 Dennd2d-201ENSMUST00000029508 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Usp49Q6P9L4 Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 3031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Usp49Q6P9L4 Cdc25c-201ENSMUST00000060710 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Usp49Q6P9L4 Lrpprc-201ENSMUST00000112308 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Usp49Q6P9L4 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Usp49Q6P9L4 Adamts7-208ENSMUST00000167122 5338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Usp49Q6P9L4 Dnaja2-201ENSMUST00000034138 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Usp49Q6P9L4 Armcx1-203ENSMUST00000113197 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Usp49Q6P9L4 Gm10544-201ENSMUST00000180516 2239 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Usp49Q6P9L4 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Usp49Q6P9L4 Gm10156-201ENSMUST00000122364 462 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Usp49Q6P9L4 Gm8810-201ENSMUST00000172895 754 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Usp49Q6P9L4 Gm20652-201ENSMUST00000177314 383 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Usp49Q6P9L4 Gm6244-201ENSMUST00000178732 841 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Usp49Q6P9L4 Gm8652-201ENSMUST00000181363 964 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Usp49Q6P9L4 Gm38297-201ENSMUST00000195122 1057 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Usp49Q6P9L4 Hax1-207ENSMUST00000198782 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Usp49Q6P9L4 Tmem86b-201ENSMUST00000055085 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Usp49Q6P9L4 Serpinb12-201ENSMUST00000081277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Usp49Q6P9L4 Chodl-202ENSMUST00000069148 2051 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Usp49Q6P9L4 Armcx1-202ENSMUST00000051256 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Usp49Q6P9L4 Gm595-201ENSMUST00000114928 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Usp49Q6P9L4 Dlgap3-203ENSMUST00000106094 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Usp49Q6P9L4 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Usp49Q6P9L4 4933406P04Rik-201ENSMUST00000092680 1789 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Usp49Q6P9L4 Gpatch4-203ENSMUST00000193398 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Usp49Q6P9L4 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Usp49Q6P9L4 Poc1b-201ENSMUST00000020113 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Usp49Q6P9L4 Cyp2b10-201ENSMUST00000005477 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Usp49Q6P9L4 Acap1-201ENSMUST00000001631 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Usp49Q6P9L4 Emp1-206ENSMUST00000205156 2911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Usp49Q6P9L4 Nek3-202ENSMUST00000110730 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Usp49Q6P9L4 Slc12a8-206ENSMUST00000122427 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Usp49Q6P9L4 Tcf4-210ENSMUST00000128706 2066 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Usp49Q6P9L4 Npr1-201ENSMUST00000029540 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Usp49Q6P9L4 Rbm39-203ENSMUST00000109587 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Usp49Q6P9L4 Actc1-201ENSMUST00000090269 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Usp49Q6P9L4 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Usp49Q6P9L4 Mir692-1-201ENSMUST00000102263 109 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Usp49Q6P9L4 Zbtb32-201ENSMUST00000108150 854 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Usp49Q6P9L4 Etfrf1-206ENSMUST00000111725 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Usp49Q6P9L4 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
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Usp49Q6P9L4 Gm38161-201ENSMUST00000195344 576 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
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Usp49Q6P9L4 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Usp49Q6P9L4 Plpp4-201ENSMUST00000094018 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Usp49Q6P9L4 Mest-202ENSMUST00000124665 2665 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Usp49Q6P9L4 Arcn1-201ENSMUST00000034607 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Usp49Q6P9L4 Nup98-201ENSMUST00000070165 4052 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Usp49Q6P9L4 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Usp49Q6P9L4 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Usp49Q6P9L4 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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Usp49Q6P9L4 Vps52-201ENSMUST00000025178 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Usp49Q6P9L4 Ube2j2-204ENSMUST00000105582 1394 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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Usp49Q6P9L4 BC051019-201ENSMUST00000033334 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Usp49Q6P9L4 Tmem200a-201ENSMUST00000066049 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Usp49Q6P9L4 Zc3hc1-210ENSMUST00000152391 1673 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Usp49Q6P9L4 Phyh-201ENSMUST00000027975 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Usp49Q6P9L4 Tmem186-201ENSMUST00000052505 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Usp49Q6P9L4 Syngap1-201ENSMUST00000081285 4315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Usp49Q6P9L4 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Usp49Q6P9L4 Slco4a1-202ENSMUST00000038259 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Usp49Q6P9L4 Gm16853-201ENSMUST00000181812 1986 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Usp49Q6P9L4 Gm26593-201ENSMUST00000181848 1970 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Usp49Q6P9L4 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Usp49Q6P9L4 Gm44094-201ENSMUST00000204703 2030 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Usp49Q6P9L4 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Usp49Q6P9L4 Spop-202ENSMUST00000107724 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Usp49Q6P9L4 Tfe3-202ENSMUST00000079542 3163 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Usp49Q6P9L4 Gabpb1-205ENSMUST00000110424 2613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Usp49Q6P9L4 Dnm2-206ENSMUST00000172482 2613 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Usp49Q6P9L4 Ldha-214ENSMUST00000210815 1535 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Usp49Q6P9L4 Gm38385-201ENSMUST00000194454 2351 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Usp49Q6P9L4 Sirt2-202ENSMUST00000122915 1828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Usp49Q6P9L4 Gm16229-201ENSMUST00000133270 1232 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Usp49Q6P9L4 Gm11684-201ENSMUST00000144975 757 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Usp49Q6P9L4 BC046401-201ENSMUST00000155786 847 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Usp49Q6P9L4 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Usp49Q6P9L4 Gm34549-203ENSMUST00000208300 896 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Usp49Q6P9L4 Gm6458-201ENSMUST00000211573 635 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Usp49Q6P9L4 Sct-204ENSMUST00000211667 506 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Usp49Q6P9L4 AC166051.1-201ENSMUST00000214313 210 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Usp49Q6P9L4 AC155237.1-201ENSMUST00000226196 1279 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Usp49Q6P9L4 Tex26-201ENSMUST00000031667 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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