Protein–RNA interactions for Protein: Q6IFZ6

Krt77, Keratin, type II cytoskeletal 1b, mousemouse

Predictions only

Length 572 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt77Q6IFZ6 Ptdss2-201ENSMUST00000026568 3624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Krt77Q6IFZ6 Slc7a11-205ENSMUST00000194462 2419 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Krt77Q6IFZ6 Pbx1-205ENSMUST00000176540 6876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Krt77Q6IFZ6 Wdr18-201ENSMUST00000045247 3911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Krt77Q6IFZ6 Eef1akmt3-201ENSMUST00000116231 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Krt77Q6IFZ6 Grin1-205ENSMUST00000114312 3838 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Krt77Q6IFZ6 Grin1-207ENSMUST00000114317 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Krt77Q6IFZ6 E2f3-201ENSMUST00000102948 5097 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Krt77Q6IFZ6 Patj-201ENSMUST00000030290 2495 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Krt77Q6IFZ6 2900026A02Rik-203ENSMUST00000212276 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Krt77Q6IFZ6 Smarcd2-203ENSMUST00000106843 2548 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Krt77Q6IFZ6 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Krt77Q6IFZ6 Foxj3-202ENSMUST00000106310 4660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Krt77Q6IFZ6 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Krt77Q6IFZ6 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Krt77Q6IFZ6 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Krt77Q6IFZ6 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Krt77Q6IFZ6 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Krt77Q6IFZ6 A630014C17Rik-201ENSMUST00000150973 2984 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Krt77Q6IFZ6 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Krt77Q6IFZ6 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Krt77Q6IFZ6 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Krt77Q6IFZ6 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Krt77Q6IFZ6 Btnl2-202ENSMUST00000178562 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Krt77Q6IFZ6 Btnl2-201ENSMUST00000025198 2564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Krt77Q6IFZ6 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Krt77Q6IFZ6 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Krt77Q6IFZ6 Podn-202ENSMUST00000106708 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Krt77Q6IFZ6 Rapgef3-217ENSMUST00000177352 3395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Krt77Q6IFZ6 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Krt77Q6IFZ6 Rab10os-203ENSMUST00000178074 4006 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Krt77Q6IFZ6 Grhl2-201ENSMUST00000022895 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Krt77Q6IFZ6 Polrmt-201ENSMUST00000020580 3755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Krt77Q6IFZ6 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Krt77Q6IFZ6 Bdnf-205ENSMUST00000111045 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Krt77Q6IFZ6 Camsap3-203ENSMUST00000207077 3832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Krt77Q6IFZ6 Dnmbp-205ENSMUST00000212396 6100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Krt77Q6IFZ6 Gsn-205ENSMUST00000201185 2607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Krt77Q6IFZ6 Rara-207ENSMUST00000164748 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Krt77Q6IFZ6 Zmym1-202ENSMUST00000106099 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Krt77Q6IFZ6 Klf11-201ENSMUST00000020982 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Krt77Q6IFZ6 Gcom1-201ENSMUST00000163998 1726 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Krt77Q6IFZ6 Gm37660-201ENSMUST00000192754 1732 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Krt77Q6IFZ6 Tcf12-218ENSMUST00000184783 3489 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Krt77Q6IFZ6 2610011E03Rik-201ENSMUST00000200128 2235 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Krt77Q6IFZ6 Elp4-202ENSMUST00000122965 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Krt77Q6IFZ6 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Krt77Q6IFZ6 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Krt77Q6IFZ6 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Krt77Q6IFZ6 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Krt77Q6IFZ6 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Krt77Q6IFZ6 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Krt77Q6IFZ6 0610005C13Rik-202ENSMUST00000209510 671 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Krt77Q6IFZ6 2810047C21Rik1-202ENSMUST00000210322 1179 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Krt77Q6IFZ6 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Krt77Q6IFZ6 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Krt77Q6IFZ6 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Krt77Q6IFZ6 Olfr142-201ENSMUST00000099752 918 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Krt77Q6IFZ6 Sstr5-202ENSMUST00000165183 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Krt77Q6IFZ6 Tcf4-249ENSMUST00000202435 2427 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Krt77Q6IFZ6 Cacnb2-203ENSMUST00000114723 3945 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Krt77Q6IFZ6 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Krt77Q6IFZ6 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Krt77Q6IFZ6 Lmbr1-201ENSMUST00000055195 4926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Krt77Q6IFZ6 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Krt77Q6IFZ6 Zbtb42-203ENSMUST00000174780 3160 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Krt77Q6IFZ6 Calcr-204ENSMUST00000170266 2175 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Krt77Q6IFZ6 Pnpla5-201ENSMUST00000019012 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Krt77Q6IFZ6 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Krt77Q6IFZ6 Pcdhb16-201ENSMUST00000051442 5225 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Krt77Q6IFZ6 Apol6-201ENSMUST00000127957 2034 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Krt77Q6IFZ6 Ajuba-201ENSMUST00000054487 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Krt77Q6IFZ6 Cnn1-201ENSMUST00000001384 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Krt77Q6IFZ6 Ckm-203ENSMUST00000208710 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Krt77Q6IFZ6 Ptgir-201ENSMUST00000086101 2725 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Krt77Q6IFZ6 Col6a2-201ENSMUST00000001181 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Krt77Q6IFZ6 Nudt8-201ENSMUST00000155405 3904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.27
Krt77Q6IFZ6 Rxfp3-201ENSMUST00000058007 4275 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.27
Krt77Q6IFZ6 Specc1-213ENSMUST00000202179 6676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Krt77Q6IFZ6 Olfr1234-202ENSMUST00000111543 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.27
Krt77Q6IFZ6 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Krt77Q6IFZ6 Sfmbt1-206ENSMUST00000228006 3299 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.27
Krt77Q6IFZ6 Gm10392-201ENSMUST00000100807 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.27
Krt77Q6IFZ6 Zfp541-202ENSMUST00000209369 4879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Krt77Q6IFZ6 Olfr533-206ENSMUST00000217179 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Krt77Q6IFZ6 Mpi-201ENSMUST00000034856 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Krt77Q6IFZ6 Mrps26-202ENSMUST00000145614 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Krt77Q6IFZ6 Itfg2-201ENSMUST00000001559 2320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Krt77Q6IFZ6 Usp24-201ENSMUST00000094933 10575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Krt77Q6IFZ6 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Krt77Q6IFZ6 Grm7-202ENSMUST00000172951 4197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Krt77Q6IFZ6 Ints5-201ENSMUST00000096249 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Krt77Q6IFZ6 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Krt77Q6IFZ6 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Krt77Q6IFZ6 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Krt77Q6IFZ6 Synj2bp-205ENSMUST00000169158 691 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Krt77Q6IFZ6 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Krt77Q6IFZ6 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Krt77Q6IFZ6 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Krt77Q6IFZ6 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.5 ms