Protein–RNA interactions for Protein: Q6EBV9

Atg9b, Autophagy-related protein 9B, mousemouse

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Length 922 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg9bQ6EBV9 Ormdl1-201ENSMUST00000027266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Atg9bQ6EBV9 Cnot3-201ENSMUST00000038913 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Atg9bQ6EBV9 Gcdh-201ENSMUST00000003907 2167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Atg9bQ6EBV9 Rpsa-ps10-201ENSMUST00000057740 885 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Atg9bQ6EBV9 Pigh-201ENSMUST00000072154 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Atg9bQ6EBV9 Adgrl1-204ENSMUST00000131717 5152 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Atg9bQ6EBV9 Map4k2-201ENSMUST00000025897 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Atg9bQ6EBV9 Hp1bp3-201ENSMUST00000030541 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
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Atg9bQ6EBV9 Set-202ENSMUST00000102866 2824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Atg9bQ6EBV9 Vps29-208ENSMUST00000155671 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Atg9bQ6EBV9 Inpp5a-202ENSMUST00000097975 2301 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Atg9bQ6EBV9 Wipf3-201ENSMUST00000126637 4414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Atg9bQ6EBV9 Slc8a2-201ENSMUST00000168693 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Atg9bQ6EBV9 Adamtsl4-202ENSMUST00000117782 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Atg9bQ6EBV9 Ccr7-201ENSMUST00000103134 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
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Atg9bQ6EBV9 Rnps1-201ENSMUST00000088512 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Atg9bQ6EBV9 Tubb2a-201ENSMUST00000056427 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Atg9bQ6EBV9 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Atg9bQ6EBV9 Tgm1-203ENSMUST00000178034 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Atg9bQ6EBV9 Folr1-205ENSMUST00000106986 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
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Atg9bQ6EBV9 D930015M05Rik-201ENSMUST00000126002 1190 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
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Atg9bQ6EBV9 Mymx-204ENSMUST00000208801 437 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
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Atg9bQ6EBV9 1700123K08Rik-201ENSMUST00000031501 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Atg9bQ6EBV9 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
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Atg9bQ6EBV9 Dnm2-201ENSMUST00000072362 3502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Atg9bQ6EBV9 Mtdh-201ENSMUST00000022865 6919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
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Atg9bQ6EBV9 Rpn1-201ENSMUST00000032143 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Atg9bQ6EBV9 Abo-201ENSMUST00000102900 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Atg9bQ6EBV9 Dctn2-201ENSMUST00000026479 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Atg9bQ6EBV9 Rubcn-203ENSMUST00000115105 5255 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Atg9bQ6EBV9 Edrf1-202ENSMUST00000128901 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Atg9bQ6EBV9 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
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Atg9bQ6EBV9 Kpna7-203ENSMUST00000116454 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Atg9bQ6EBV9 Rnf214-205ENSMUST00000160699 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Atg9bQ6EBV9 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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Atg9bQ6EBV9 Lsm7-208ENSMUST00000220225 1129 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Atg9bQ6EBV9 Pfdn1-201ENSMUST00000025204 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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Atg9bQ6EBV9 Grm6-201ENSMUST00000000631 4291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Atg9bQ6EBV9 Ispd-205ENSMUST00000221895 4022 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Atg9bQ6EBV9 Podn-201ENSMUST00000044248 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Atg9bQ6EBV9 Col9a3-201ENSMUST00000103059 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Atg9bQ6EBV9 Saa3-202ENSMUST00000210913 2200 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Atg9bQ6EBV9 Gm13075-202ENSMUST00000149247 1621 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Atg9bQ6EBV9 Tfe3-206ENSMUST00000115679 3239 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Atg9bQ6EBV9 Arhgef37-201ENSMUST00000171629 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Atg9bQ6EBV9 Usp33-209ENSMUST00000197748 4183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Atg9bQ6EBV9 0610010F05Rik-208ENSMUST00000180260 4128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Atg9bQ6EBV9 Sphk2-203ENSMUST00000210060 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Atg9bQ6EBV9 Copb2-201ENSMUST00000035033 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Atg9bQ6EBV9 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Atg9bQ6EBV9 Rfx7-203ENSMUST00000183372 1457 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Atg9bQ6EBV9 Slc4a1ap-209ENSMUST00000202214 2806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Atg9bQ6EBV9 Angel2-203ENSMUST00000110899 3673 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Atg9bQ6EBV9 Pou5f2-201ENSMUST00000175955 1394 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Atg9bQ6EBV9 Trp53-202ENSMUST00000108657 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Atg9bQ6EBV9 Sirt2-202ENSMUST00000122915 1828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Atg9bQ6EBV9 2900097C17Rik-202ENSMUST00000192863 4915 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
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