Protein–RNA interactions for Protein: Q63ZW6

Col4a5, Col4a5 protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,691 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col4a5Q63ZW6 Gm17831-201ENSMUST00000205579 900 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Col4a5Q63ZW6 Fabp6-201ENSMUST00000020672 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Col4a5Q63ZW6 Gm45799-208ENSMUST00000211054 490 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Col4a5Q63ZW6 Gm40709-203ENSMUST00000219695 973 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Col4a5Q63ZW6 Ggps1-204ENSMUST00000221713 667 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Col4a5Q63ZW6 4930569F06Rik-201ENSMUST00000036821 433 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Col4a5Q63ZW6 Sgce-209ENSMUST00000133306 1619 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Col4a5Q63ZW6 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Col4a5Q63ZW6 B430119L08Rik-201ENSMUST00000130054 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Col4a5Q63ZW6 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Col4a5Q63ZW6 Gm16958-201ENSMUST00000180603 1765 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Col4a5Q63ZW6 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Col4a5Q63ZW6 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Col4a5Q63ZW6 Fibin-201ENSMUST00000099626 2267 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Col4a5Q63ZW6 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Col4a5Q63ZW6 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Col4a5Q63ZW6 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Col4a5Q63ZW6 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Col4a5Q63ZW6 Rorc-204ENSMUST00000200009 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Col4a5Q63ZW6 Lrrfip2-213ENSMUST00000216430 1525 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Col4a5Q63ZW6 Oraov1-201ENSMUST00000033388 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Col4a5Q63ZW6 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Col4a5Q63ZW6 Dph7-201ENSMUST00000028351 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Col4a5Q63ZW6 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Col4a5Q63ZW6 D930032P07Rik-201ENSMUST00000181393 1314 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Col4a5Q63ZW6 Ppm1b-204ENSMUST00000112307 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Col4a5Q63ZW6 Pfkfb3-204ENSMUST00000114844 2107 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Col4a5Q63ZW6 Cdc20b-201ENSMUST00000109244 1620 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Col4a5Q63ZW6 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Col4a5Q63ZW6 Zbtb2-202ENSMUST00000100078 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Col4a5Q63ZW6 Ccl1-202ENSMUST00000108189 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Col4a5Q63ZW6 Cdk2ap1-202ENSMUST00000111472 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Col4a5Q63ZW6 Gm12816-201ENSMUST00000118069 1212 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Col4a5Q63ZW6 Gm16071-201ENSMUST00000119589 793 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Col4a5Q63ZW6 Gm6485-201ENSMUST00000160676 439 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Col4a5Q63ZW6 Gm17826-201ENSMUST00000189720 798 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Col4a5Q63ZW6 Gm44958-201ENSMUST00000203734 736 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Col4a5Q63ZW6 Ccl1-201ENSMUST00000021043 611 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Col4a5Q63ZW6 2010001M07Rik-201ENSMUST00000214235 364 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Col4a5Q63ZW6 CT009713.8-202ENSMUST00000224732 385 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Col4a5Q63ZW6 Dmrtc1c2-201ENSMUST00000087896 1255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Col4a5Q63ZW6 Gm5879-201ENSMUST00000089501 1209 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Col4a5Q63ZW6 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Col4a5Q63ZW6 Lins1-202ENSMUST00000077967 2647 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Col4a5Q63ZW6 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Col4a5Q63ZW6 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Col4a5Q63ZW6 Add2-202ENSMUST00000203196 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Col4a5Q63ZW6 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Col4a5Q63ZW6 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Col4a5Q63ZW6 Gm26543-201ENSMUST00000180729 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Col4a5Q63ZW6 Abo-201ENSMUST00000102900 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Col4a5Q63ZW6 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Col4a5Q63ZW6 4930554G24Rik-201ENSMUST00000126260 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Col4a5Q63ZW6 Gm36635-201ENSMUST00000221152 1332 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Col4a5Q63ZW6 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Col4a5Q63ZW6 Copb2-201ENSMUST00000035033 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Col4a5Q63ZW6 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Col4a5Q63ZW6 1110002L01Rik-202ENSMUST00000168012 3569 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Col4a5Q63ZW6 Hmgcll1-202ENSMUST00000117981 1189 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Col4a5Q63ZW6 Gm13822-201ENSMUST00000127563 346 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Col4a5Q63ZW6 Gm11683-201ENSMUST00000147006 918 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Col4a5Q63ZW6 Gm23085-201ENSMUST00000157849 293 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Col4a5Q63ZW6 2610027F03Rik-202ENSMUST00000186982 603 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Col4a5Q63ZW6 D3Ertd751e-215ENSMUST00000195882 680 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Col4a5Q63ZW6 Nkg7-203ENSMUST00000206741 686 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Col4a5Q63ZW6 Tagln3-201ENSMUST00000096057 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Col4a5Q63ZW6 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Col4a5Q63ZW6 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Col4a5Q63ZW6 Gm43721-201ENSMUST00000199677 2313 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Col4a5Q63ZW6 Asb10-201ENSMUST00000048302 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Col4a5Q63ZW6 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Col4a5Q63ZW6 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Col4a5Q63ZW6 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Col4a5Q63ZW6 Fuca2-201ENSMUST00000060212 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Col4a5Q63ZW6 Atg7-207ENSMUST00000182428 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Col4a5Q63ZW6 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Col4a5Q63ZW6 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Col4a5Q63ZW6 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Col4a5Q63ZW6 Ppil2-212ENSMUST00000164458 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Col4a5Q63ZW6 Cdc42se1-201ENSMUST00000053872 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Col4a5Q63ZW6 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Col4a5Q63ZW6 Gm4726-201ENSMUST00000135604 736 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Col4a5Q63ZW6 Gm6019-201ENSMUST00000148369 736 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Col4a5Q63ZW6 Gm5852-201ENSMUST00000194119 1021 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Col4a5Q63ZW6 Gm5542-201ENSMUST00000195485 1089 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Col4a5Q63ZW6 Gm45338-204ENSMUST00000210658 1105 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Col4a5Q63ZW6 U2af1l4-201ENSMUST00000043273 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Col4a5Q63ZW6 Gm9962-201ENSMUST00000085241 321 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Col4a5Q63ZW6 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Col4a5Q63ZW6 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Col4a5Q63ZW6 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Col4a5Q63ZW6 Cyp2b10-201ENSMUST00000005477 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Col4a5Q63ZW6 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Col4a5Q63ZW6 Kars-201ENSMUST00000034426 2008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Col4a5Q63ZW6 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Col4a5Q63ZW6 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Col4a5Q63ZW6 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Col4a5Q63ZW6 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Col4a5Q63ZW6 Gm11752-201ENSMUST00000143291 510 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Col4a5Q63ZW6 Gm23218-201ENSMUST00000158124 276 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 85.6 ms