Protein–RNA interactions for Protein: Q62255

Sall3, Sal-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,320 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sall3Q62255 Gm11630-201ENSMUST00000152825 382 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Sall3Q62255 Mcpt8-201ENSMUST00000015594 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Sall3Q62255 Gm5523-201ENSMUST00000180415 997 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
Sall3Q62255 Gm27023-201ENSMUST00000182372 285 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
Sall3Q62255 Ip6k2-202ENSMUST00000192028 1199 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Sall3Q62255 Gm19208-201ENSMUST00000213861 912 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
Sall3Q62255 Net1-206ENSMUST00000222504 447 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Sall3Q62255 Rpl24-201ENSMUST00000023269 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Sall3Q62255 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Sall3Q62255 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sall3Q62255 Ugt1a2-201ENSMUST00000049289 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sall3Q62255 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sall3Q62255 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sall3Q62255 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sall3Q62255 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sall3Q62255 Actr8-204ENSMUST00000224797 2328 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sall3Q62255 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sall3Q62255 Fen1-201ENSMUST00000025651 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sall3Q62255 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sall3Q62255 Chchd3-202ENSMUST00000115091 1363 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sall3Q62255 Gm8798-201ENSMUST00000211877 1661 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Sall3Q62255 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sall3Q62255 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sall3Q62255 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sall3Q62255 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sall3Q62255 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sall3Q62255 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sall3Q62255 BB123696-201ENSMUST00000222580 2056 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sall3Q62255 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sall3Q62255 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sall3Q62255 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sall3Q62255 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sall3Q62255 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sall3Q62255 Spert-202ENSMUST00000164082 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sall3Q62255 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sall3Q62255 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sall3Q62255 Gm24749-201ENSMUST00000157838 343 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Sall3Q62255 Gm22334-201ENSMUST00000158070 133 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Sall3Q62255 Rlbp1-202ENSMUST00000179243 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sall3Q62255 Gm34767-201ENSMUST00000191813 1062 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Sall3Q62255 Gm37666-201ENSMUST00000194110 866 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Sall3Q62255 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sall3Q62255 4933421D24Rik-201ENSMUST00000209302 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sall3Q62255 Gm31224-201ENSMUST00000212682 513 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sall3Q62255 Rps12-203ENSMUST00000218107 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sall3Q62255 Abracl-204ENSMUST00000220110 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sall3Q62255 Gm6994-201ENSMUST00000088880 1163 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sall3Q62255 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sall3Q62255 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sall3Q62255 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sall3Q62255 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sall3Q62255 Sun1-203ENSMUST00000100517 1522 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sall3Q62255 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sall3Q62255 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sall3Q62255 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sall3Q62255 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sall3Q62255 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sall3Q62255 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sall3Q62255 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sall3Q62255 Etfrf1-203ENSMUST00000111721 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sall3Q62255 AC110816.2-201ENSMUST00000220360 1323 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sall3Q62255 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sall3Q62255 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sall3Q62255 Cyp4f16-208ENSMUST00000169591 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sall3Q62255 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sall3Q62255 Ano6-208ENSMUST00000227791 3149 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sall3Q62255 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sall3Q62255 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sall3Q62255 Orc3-201ENSMUST00000048706 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sall3Q62255 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sall3Q62255 Fam166b-203ENSMUST00000107929 865 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sall3Q62255 Zar1l-201ENSMUST00000118769 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sall3Q62255 Olfr647-ps1-201ENSMUST00000121599 960 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Sall3Q62255 Tmem40-205ENSMUST00000166254 811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sall3Q62255 Stard10-207ENSMUST00000173270 670 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sall3Q62255 Gm27552-201ENSMUST00000183351 62 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Sall3Q62255 Gm27844-201ENSMUST00000183613 62 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Sall3Q62255 Gm43050-201ENSMUST00000201062 338 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sall3Q62255 AC125209.1-201ENSMUST00000225812 766 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Sall3Q62255 Defb22-201ENSMUST00000028966 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sall3Q62255 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sall3Q62255 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sall3Q62255 Fbxo48-201ENSMUST00000061327 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sall3Q62255 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sall3Q62255 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sall3Q62255 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sall3Q62255 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sall3Q62255 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sall3Q62255 Ficd-201ENSMUST00000065698 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sall3Q62255 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sall3Q62255 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sall3Q62255 Prkcd-202ENSMUST00000112202 2005 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sall3Q62255 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sall3Q62255 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sall3Q62255 Kpna7-203ENSMUST00000116454 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sall3Q62255 Arl4a-205ENSMUST00000146905 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sall3Q62255 Gm16066-201ENSMUST00000118575 1086 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sall3Q62255 Gm13315-201ENSMUST00000120376 991 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Sall3Q62255 Nkx2-2os-202ENSMUST00000184407 458 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Sall3Q62255 Rpl7a-ps2-201ENSMUST00000200554 774 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.2 ms