Protein–RNA interactions for Protein: Q62209

Sycp1, Synaptonemal complex protein 1, mousemouse

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Length 993 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sycp1Q62209 Lrpprc-201ENSMUST00000112308 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sycp1Q62209 Otx2-209ENSMUST00000226501 2592 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sycp1Q62209 Gm37795-201ENSMUST00000194216 2459 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Sycp1Q62209 Gm11725-201ENSMUST00000125607 1850 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sycp1Q62209 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sycp1Q62209 Fbxl12-207ENSMUST00000151861 1668 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sycp1Q62209 Gm10040-201ENSMUST00000080726 1662 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Sycp1Q62209 Tmed9-203ENSMUST00000224741 1450 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Sycp1Q62209 Gm15851-201ENSMUST00000160564 662 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sycp1Q62209 Psmc3ip-201ENSMUST00000019447 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sycp1Q62209 Gm4610-201ENSMUST00000198222 905 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sycp1Q62209 Fam24a-203ENSMUST00000207784 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sycp1Q62209 9230020A06Rik-204ENSMUST00000215201 1116 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sycp1Q62209 CT030657.3-201ENSMUST00000222707 1200 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Sycp1Q62209 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sycp1Q62209 Glis3-202ENSMUST00000112612 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sycp1Q62209 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sycp1Q62209 Gm28386-201ENSMUST00000189147 1849 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Sycp1Q62209 Brwd1-202ENSMUST00000099502 8547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sycp1Q62209 Lrp2bp-202ENSMUST00000110380 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sycp1Q62209 Hsd3b4-202ENSMUST00000196861 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sycp1Q62209 Gm10681-201ENSMUST00000058728 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sycp1Q62209 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sycp1Q62209 Xpo1-201ENSMUST00000020538 5145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sycp1Q62209 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sycp1Q62209 D630023F18Rik-201ENSMUST00000050047 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sycp1Q62209 Klhl26-203ENSMUST00000209415 2919 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sycp1Q62209 Aqp6-201ENSMUST00000023754 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sycp1Q62209 Rhbdd2-201ENSMUST00000043707 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sycp1Q62209 Plagl1-201ENSMUST00000121325 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sycp1Q62209 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sycp1Q62209 Mogat2-201ENSMUST00000064231 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sycp1Q62209 Gm9924-202ENSMUST00000192760 2311 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Sycp1Q62209 Zfp467-206ENSMUST00000114561 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sycp1Q62209 Ildr1-202ENSMUST00000089618 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sycp1Q62209 Gm26770-201ENSMUST00000180586 2237 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sycp1Q62209 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sycp1Q62209 Celrr-202ENSMUST00000181433 1561 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sycp1Q62209 4933435G04Rik-201ENSMUST00000205892 2108 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Sycp1Q62209 Grid1-201ENSMUST00000043349 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sycp1Q62209 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sycp1Q62209 Egfl7-208ENSMUST00000149789 683 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sycp1Q62209 Pmepa1os-201ENSMUST00000150185 680 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sycp1Q62209 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Sycp1Q62209 1700029B24Rik-201ENSMUST00000194040 497 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Sycp1Q62209 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sycp1Q62209 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sycp1Q62209 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sycp1Q62209 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sycp1Q62209 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sycp1Q62209 Stard8-201ENSMUST00000036606 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sycp1Q62209 Krba1-202ENSMUST00000077093 8380 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sycp1Q62209 Gm14371-201ENSMUST00000138925 1518 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Sycp1Q62209 Mb21d1-201ENSMUST00000034898 3231 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sycp1Q62209 Sdf4-201ENSMUST00000050078 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sycp1Q62209 Gm5912-201ENSMUST00000122282 1438 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Sycp1Q62209 Plcd3-201ENSMUST00000103077 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sycp1Q62209 Setdb2-201ENSMUST00000095775 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sycp1Q62209 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sycp1Q62209 1300002E11Rik-202ENSMUST00000181780 1650 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sycp1Q62209 Myo18a-220ENSMUST00000164334 5381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sycp1Q62209 Galnt6-202ENSMUST00000159715 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sycp1Q62209 Tenm3-201ENSMUST00000033965 8961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sycp1Q62209 Pcnx-201ENSMUST00000021567 12139 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sycp1Q62209 Ywhab-201ENSMUST00000018470 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sycp1Q62209 B230206H07Rik-202ENSMUST00000134845 3269 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sycp1Q62209 Pisd-202ENSMUST00000071829 1986 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sycp1Q62209 Gtf2i-203ENSMUST00000111261 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sycp1Q62209 Sipa1l2-204ENSMUST00000212987 6690 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sycp1Q62209 Rhbdd3-203ENSMUST00000109878 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sycp1Q62209 Wdr66-202ENSMUST00000121964 4873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sycp1Q62209 Rnf44-218ENSMUST00000177950 3941 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sycp1Q62209 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sycp1Q62209 Gm5303-201ENSMUST00000117943 1252 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Sycp1Q62209 Gm11400-201ENSMUST00000120853 1214 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Sycp1Q62209 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sycp1Q62209 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Sycp1Q62209 Zc3h18-201ENSMUST00000017622 3810 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sycp1Q62209 Prss54-202ENSMUST00000180075 1152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sycp1Q62209 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sycp1Q62209 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sycp1Q62209 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sycp1Q62209 AC154595.3-201ENSMUST00000224579 384 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Sycp1Q62209 AC125117.1-201ENSMUST00000228121 468 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Sycp1Q62209 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sycp1Q62209 Olfr373-201ENSMUST00000074540 945 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sycp1Q62209 Ppp1r14d-201ENSMUST00000076084 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sycp1Q62209 Kars-202ENSMUST00000093120 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sycp1Q62209 Szrd1-203ENSMUST00000102487 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sycp1Q62209 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sycp1Q62209 Oprm1-214ENSMUST00000105605 1503 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sycp1Q62209 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sycp1Q62209 Ugt1a6a-201ENSMUST00000014263 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sycp1Q62209 Pqlc2-202ENSMUST00000105801 2756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sycp1Q62209 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sycp1Q62209 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sycp1Q62209 Mest-202ENSMUST00000124665 2665 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sycp1Q62209 Has3-203ENSMUST00000176144 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sycp1Q62209 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sycp1Q62209 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
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