Protein–RNA interactions for Protein: Q62066

Phox2a, Paired mesoderm homeobox protein 2A, mousemouse

Predictions only

Length 280 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phox2aQ62066 Trappc5-202ENSMUST00000207787 4411 ntAPPRIS P1 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Phox2aQ62066 AC159314.1-201ENSMUST00000216917 3485 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Phox2aQ62066 Gm29050-201ENSMUST00000190732 2528 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Phox2aQ62066 Apbb1-201ENSMUST00000081165 2530 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Phox2aQ62066 Zfp654-202ENSMUST00000207826 6261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Phox2aQ62066 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.68
Phox2aQ62066 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC10.77□□□□□ -0.68
Phox2aQ62066 Gm5124-201ENSMUST00000127554 1970 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.68
Phox2aQ62066 Gm44401-201ENSMUST00000204462 2375 ntBASIC10.77□□□□□ -0.68
Phox2aQ62066 Rac1-201ENSMUST00000080537 4159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Phox2aQ62066 Col18a1-203ENSMUST00000105409 4791 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Phox2aQ62066 Pomgnt1-201ENSMUST00000106494 2226 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Phox2aQ62066 Cyb561d1-203ENSMUST00000106655 4275 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Phox2aQ62066 Rxfp3-201ENSMUST00000058007 4275 ntAPPRIS P1 BASIC10.77□□□□□ -0.68
Phox2aQ62066 Scn10a-201ENSMUST00000084787 6416 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Phox2aQ62066 Adora1-203ENSMUST00000169927 4581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Phox2aQ62066 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Phox2aQ62066 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Phox2aQ62066 Aebp2-206ENSMUST00000161335 2524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Phox2aQ62066 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Phox2aQ62066 Tnfaip3-201ENSMUST00000019997 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Phox2aQ62066 Gm43721-201ENSMUST00000199677 2313 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Phox2aQ62066 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Phox2aQ62066 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Phox2aQ62066 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Phox2aQ62066 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Phox2aQ62066 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Phox2aQ62066 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Phox2aQ62066 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Phox2aQ62066 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Phox2aQ62066 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Phox2aQ62066 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Phox2aQ62066 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Phox2aQ62066 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Phox2aQ62066 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Phox2aQ62066 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Phox2aQ62066 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Phox2aQ62066 Maats1-201ENSMUST00000023501 2750 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Phox2aQ62066 Dmp1-201ENSMUST00000066708 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Phox2aQ62066 Gm44292-201ENSMUST00000205194 2364 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Phox2aQ62066 Tgfb2-206ENSMUST00000195201 3485 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Phox2aQ62066 Gcdh-201ENSMUST00000003907 2167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Phox2aQ62066 Arvcf-204ENSMUST00000115613 4800 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Phox2aQ62066 Bcl11a-201ENSMUST00000000881 3061 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Phox2aQ62066 Gpr179-201ENSMUST00000093942 9219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Phox2aQ62066 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Phox2aQ62066 Leprot-202ENSMUST00000106927 1754 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Phox2aQ62066 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Phox2aQ62066 Nfatc4-202ENSMUST00000172271 3775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Phox2aQ62066 Gm21982-201ENSMUST00000146232 3821 ntTSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Phox2aQ62066 Slc6a16-201ENSMUST00000179310 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Phox2aQ62066 5430419D17Rik-201ENSMUST00000050586 2928 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Phox2aQ62066 Zfp526-201ENSMUST00000055604 3380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Phox2aQ62066 Gucy2e-203ENSMUST00000108665 3645 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Phox2aQ62066 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Phox2aQ62066 Prdm1-201ENSMUST00000039174 5281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Phox2aQ62066 Fn3krp-201ENSMUST00000038096 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Phox2aQ62066 AC154404.1-201ENSMUST00000223601 2077 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Phox2aQ62066 Zfp772-201ENSMUST00000074455 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Phox2aQ62066 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Phox2aQ62066 Capn9-201ENSMUST00000093033 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Phox2aQ62066 Fgd5-202ENSMUST00000113466 5621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Phox2aQ62066 Frmpd2-203ENSMUST00000208577 5192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Phox2aQ62066 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Phox2aQ62066 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Phox2aQ62066 Ppp1r16b-202ENSMUST00000052927 6685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Phox2aQ62066 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Phox2aQ62066 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Phox2aQ62066 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Phox2aQ62066 Hdac7-205ENSMUST00000118294 4069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Phox2aQ62066 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Phox2aQ62066 Tcf4-234ENSMUST00000201410 1915 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Phox2aQ62066 Tcf4-243ENSMUST00000202057 1941 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Phox2aQ62066 Daam2-202ENSMUST00000224595 1926 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Phox2aQ62066 Ttc23l-201ENSMUST00000022857 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Phox2aQ62066 Misp-201ENSMUST00000046833 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Phox2aQ62066 Synpo-211ENSMUST00000155195 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Phox2aQ62066 Eprs-201ENSMUST00000046514 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Phox2aQ62066 Myh10-203ENSMUST00000102611 7791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Phox2aQ62066 Ehbp1-202ENSMUST00000109563 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Phox2aQ62066 Epb41l5-201ENSMUST00000027632 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Phox2aQ62066 Chd5-201ENSMUST00000005175 9122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Phox2aQ62066 AC160411.1-201ENSMUST00000218544 4560 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Phox2aQ62066 Zfp335-201ENSMUST00000041361 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Phox2aQ62066 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Phox2aQ62066 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Phox2aQ62066 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Phox2aQ62066 Gm38114-201ENSMUST00000191877 1232 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Phox2aQ62066 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Phox2aQ62066 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Phox2aQ62066 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Phox2aQ62066 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Phox2aQ62066 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Phox2aQ62066 2410131K14Rik-201ENSMUST00000049138 5649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Phox2aQ62066 Lig1-201ENSMUST00000098814 3091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Phox2aQ62066 Sel1l-210ENSMUST00000178462 6150 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Phox2aQ62066 Snap23-201ENSMUST00000028743 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Phox2aQ62066 Phf24-202ENSMUST00000107975 6494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Phox2aQ62066 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Phox2aQ62066 Galnt11-202ENSMUST00000114950 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
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