Protein–RNA interactions for Protein: Q61657

Hes3, Transcription factor HES-3, mousemouse

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Length 175 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hes3Q61657 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Hes3Q61657 Lef1-204ENSMUST00000106341 3357 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Hes3Q61657 Lef1-202ENSMUST00000066849 3398 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Hes3Q61657 Nek1-209ENSMUST00000211672 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Hes3Q61657 Ip6k1-201ENSMUST00000035214 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Hes3Q61657 Corin-201ENSMUST00000005352 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Hes3Q61657 Spcs3-201ENSMUST00000067476 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Hes3Q61657 Ephb6-201ENSMUST00000114732 3762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Hes3Q61657 Serpinb6d-201ENSMUST00000059637 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Hes3Q61657 Mgll-201ENSMUST00000089449 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
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Hes3Q61657 Msh4-201ENSMUST00000005630 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Hes3Q61657 Zfp219-202ENSMUST00000166169 3017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Hes3Q61657 Kdm4a-202ENSMUST00000097911 4550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Hes3Q61657 Gm11725-201ENSMUST00000125607 1850 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Hes3Q61657 Gm15336-201ENSMUST00000128894 1571 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Hes3Q61657 Hoxb13-201ENSMUST00000062709 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Hes3Q61657 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Hes3Q61657 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Hes3Q61657 Selenoh-203ENSMUST00000117299 747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
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Hes3Q61657 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Hes3Q61657 Plekhd1os-201ENSMUST00000153297 944 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Hes3Q61657 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Hes3Q61657 Fam173b-201ENSMUST00000042702 1164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Hes3Q61657 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
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Hes3Q61657 Gm12280-201ENSMUST00000155836 1624 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Hes3Q61657 Hsd3b4-202ENSMUST00000196861 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Hes3Q61657 Gm10681-201ENSMUST00000058728 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Hes3Q61657 5830411N06Rik-202ENSMUST00000093984 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Hes3Q61657 Fnip2-203ENSMUST00000133154 7299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Hes3Q61657 Fen1-201ENSMUST00000025651 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Hes3Q61657 Rnf224-201ENSMUST00000091318 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Hes3Q61657 Ccdc126-202ENSMUST00000114491 2372 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Hes3Q61657 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Hes3Q61657 Tulp2-201ENSMUST00000024233 1749 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Hes3Q61657 Naaa-201ENSMUST00000113102 2414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Hes3Q61657 Tmem104-202ENSMUST00000100235 4561 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Hes3Q61657 Tmem104-201ENSMUST00000061450 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Hes3Q61657 Rbm39-203ENSMUST00000109587 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Hes3Q61657 Thtpa-201ENSMUST00000050575 2830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Hes3Q61657 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
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Hes3Q61657 Sstr5-202ENSMUST00000165183 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Hes3Q61657 Mier1-205ENSMUST00000106858 4830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Hes3Q61657 Srp54a-202ENSMUST00000220578 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Hes3Q61657 Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 3031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Hes3Q61657 Itga2b-201ENSMUST00000103086 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Hes3Q61657 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
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Hes3Q61657 Plekhd1-201ENSMUST00000140770 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Hes3Q61657 Gm8994-202ENSMUST00000204530 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
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Hes3Q61657 Dhx57-202ENSMUST00000086555 5077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Hes3Q61657 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
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Hes3Q61657 Sorcs1-206ENSMUST00000209783 3489 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
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Hes3Q61657 4931414P19Rik-201ENSMUST00000022786 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Hes3Q61657 Cpeb1-201ENSMUST00000098331 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Hes3Q61657 Sgk3-201ENSMUST00000097826 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Hes3Q61657 Mixl1-201ENSMUST00000027778 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Hes3Q61657 Eps8l3-201ENSMUST00000037375 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Hes3Q61657 Eif1ax-201ENSMUST00000087143 5172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Hes3Q61657 Pik3r1-202ENSMUST00000055518 7113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Hes3Q61657 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Hes3Q61657 Zfp12-203ENSMUST00000077485 4294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Hes3Q61657 Samd5-201ENSMUST00000100070 6818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Hes3Q61657 Acly-203ENSMUST00000107389 4426 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Hes3Q61657 Rapsn-202ENSMUST00000111445 1450 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Hes3Q61657 Ptpru-201ENSMUST00000030741 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Hes3Q61657 Kcnj12-203ENSMUST00000108717 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Hes3Q61657 Wnt7b-202ENSMUST00000109424 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Hes3Q61657 Rnf14-201ENSMUST00000072376 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Hes3Q61657 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Hes3Q61657 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Hes3Q61657 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Hes3Q61657 Slc16a12-201ENSMUST00000009522 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Hes3Q61657 Rspo2-203ENSMUST00000226810 3091 ntAPPRIS P1 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Hes3Q61657 Ntsr1-202ENSMUST00000170448 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Hes3Q61657 Zfp429-202ENSMUST00000181071 2117 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63 ms