Protein–RNA interactions for Protein: Q61398

Pcolce, Procollagen C-endopeptidase enhancer 1, mousemouse

Predictions only

Length 468 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PcolceQ61398 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
PcolceQ61398 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
PcolceQ61398 Hdgfl2-210ENSMUST00000225843 2238 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
PcolceQ61398 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
PcolceQ61398 Abhd6-203ENSMUST00000225234 1958 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
PcolceQ61398 Tnpo2-202ENSMUST00000166592 4884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
PcolceQ61398 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
PcolceQ61398 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
PcolceQ61398 Rab15-201ENSMUST00000021459 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
PcolceQ61398 Tulp2-201ENSMUST00000024233 1749 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
PcolceQ61398 Cidec-201ENSMUST00000032416 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
PcolceQ61398 Gjb5-201ENSMUST00000046498 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
PcolceQ61398 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
PcolceQ61398 Gm45706-201ENSMUST00000213063 2136 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
PcolceQ61398 Gm5422-202ENSMUST00000216161 2928 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
PcolceQ61398 Ccdc71-201ENSMUST00000061209 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
PcolceQ61398 Fancc-202ENSMUST00000099444 2288 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
PcolceQ61398 Rdh19-201ENSMUST00000077530 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
PcolceQ61398 Zfand4-202ENSMUST00000112900 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
PcolceQ61398 Timp3-201ENSMUST00000020234 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
PcolceQ61398 Rnf14-202ENSMUST00000170811 2886 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
PcolceQ61398 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
PcolceQ61398 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
PcolceQ61398 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
PcolceQ61398 Abhd6-202ENSMUST00000166497 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
PcolceQ61398 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
PcolceQ61398 Dpysl5-203ENSMUST00000114729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
PcolceQ61398 Sarm1-201ENSMUST00000061174 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
PcolceQ61398 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
PcolceQ61398 Mir874-201ENSMUST00000104769 76 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
PcolceQ61398 Rhox2g-201ENSMUST00000115169 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
PcolceQ61398 Tmem219-203ENSMUST00000120007 1087 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
PcolceQ61398 Sbk3-201ENSMUST00000133272 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
PcolceQ61398 Tnni2-206ENSMUST00000149529 768 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
PcolceQ61398 Hoxb5os-202ENSMUST00000150698 596 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
PcolceQ61398 Naa60-209ENSMUST00000175809 279 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
PcolceQ61398 1700120C18Rik-201ENSMUST00000182952 985 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
PcolceQ61398 2610306M01Rik-201ENSMUST00000185414 1042 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
PcolceQ61398 Gm43714-201ENSMUST00000198351 1204 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
PcolceQ61398 Gm44364-201ENSMUST00000198368 141 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
PcolceQ61398 3830422I06Rik-201ENSMUST00000200199 1181 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
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PcolceQ61398 Gm7619-201ENSMUST00000210649 1282 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
PcolceQ61398 Comt-201ENSMUST00000000335 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
PcolceQ61398 Ceacam10-201ENSMUST00000038069 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
PcolceQ61398 Ppp1r14d-201ENSMUST00000076084 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
PcolceQ61398 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
PcolceQ61398 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
PcolceQ61398 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
PcolceQ61398 Diaph3-202ENSMUST00000168889 4582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
PcolceQ61398 Diaph3-201ENSMUST00000022599 4582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
PcolceQ61398 Zbtb25-205ENSMUST00000176509 1591 ntTSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
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PcolceQ61398 Exd2-201ENSMUST00000038185 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
PcolceQ61398 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
PcolceQ61398 Ercc5-201ENSMUST00000027214 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
PcolceQ61398 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
PcolceQ61398 Aacs-201ENSMUST00000031445 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
PcolceQ61398 Dnm2-201ENSMUST00000072362 3502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
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PcolceQ61398 AC122371.1-201ENSMUST00000220876 1477 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
PcolceQ61398 Acot7-202ENSMUST00000075363 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
PcolceQ61398 Spry2-201ENSMUST00000022709 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
PcolceQ61398 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
PcolceQ61398 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
PcolceQ61398 Zer1-202ENSMUST00000113677 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
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PcolceQ61398 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
PcolceQ61398 1700128E19Rik-201ENSMUST00000134409 2439 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
PcolceQ61398 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
PcolceQ61398 Acy1-201ENSMUST00000024031 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
PcolceQ61398 Hectd2-208ENSMUST00000169036 3842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
PcolceQ61398 Azi2-201ENSMUST00000044454 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
PcolceQ61398 Dcun1d3-206ENSMUST00000207233 2917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
PcolceQ61398 A530072M11Rik-201ENSMUST00000151122 1852 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
PcolceQ61398 Fsd1-201ENSMUST00000011733 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
PcolceQ61398 Vmn1r65-201ENSMUST00000086338 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
PcolceQ61398 Gm42688-201ENSMUST00000101253 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
PcolceQ61398 Styxl1-202ENSMUST00000111161 963 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
PcolceQ61398 Gm14350-201ENSMUST00000116642 640 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
PcolceQ61398 Gm5687-201ENSMUST00000118252 640 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
PcolceQ61398 1700069L16Rik-203ENSMUST00000162388 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
PcolceQ61398 Gm17180-201ENSMUST00000172211 435 ntTSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
PcolceQ61398 Rn7s1-201ENSMUST00000174924 300 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
PcolceQ61398 Rn7s2-201ENSMUST00000175032 300 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
PcolceQ61398 Gm26461-201ENSMUST00000175064 290 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
PcolceQ61398 Gm27514-201ENSMUST00000183692 110 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
PcolceQ61398 Swi5-207ENSMUST00000183946 768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
PcolceQ61398 Gm35409-201ENSMUST00000196412 1102 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
PcolceQ61398 Gm42929-201ENSMUST00000198374 1286 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
PcolceQ61398 Gm18753-201ENSMUST00000201000 566 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
PcolceQ61398 Tpd52l1-205ENSMUST00000215515 857 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
PcolceQ61398 CU024892.2-201ENSMUST00000224608 832 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
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