Protein–RNA interactions for Protein: Q60987

Foxg1, Forkhead box protein G1, mousemouse

Predictions only

Length 481 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxg1Q60987 Dpysl5-203ENSMUST00000114729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Foxg1Q60987 Spib-201ENSMUST00000035323 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Foxg1Q60987 Pigh-201ENSMUST00000072154 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Foxg1Q60987 Tollip-204ENSMUST00000151890 1753 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Foxg1Q60987 Ddx31-201ENSMUST00000113853 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Foxg1Q60987 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Foxg1Q60987 Phldb1-213ENSMUST00000144251 3589 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Foxg1Q60987 Col9a3-201ENSMUST00000103059 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Foxg1Q60987 Adam11-202ENSMUST00000103081 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Foxg1Q60987 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Foxg1Q60987 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Foxg1Q60987 Rps13-203ENSMUST00000205490 1317 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Foxg1Q60987 AC153938.1-201ENSMUST00000220354 1425 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Foxg1Q60987 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Foxg1Q60987 Cdc73-201ENSMUST00000018337 11586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Foxg1Q60987 Evi5l-202ENSMUST00000176072 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Foxg1Q60987 Neu2-204ENSMUST00000165109 1824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Foxg1Q60987 Cpq-207ENSMUST00000228916 1842 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Foxg1Q60987 Nagk-202ENSMUST00000113850 1918 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Foxg1Q60987 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Foxg1Q60987 Gm10544-201ENSMUST00000180516 2239 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Foxg1Q60987 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Foxg1Q60987 Fen1-201ENSMUST00000025651 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Foxg1Q60987 Dhx58-201ENSMUST00000017974 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Foxg1Q60987 Spata21-201ENSMUST00000051907 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Foxg1Q60987 Lztr1-201ENSMUST00000023444 3112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Foxg1Q60987 Pyroxd2-201ENSMUST00000076505 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Foxg1Q60987 Gm22018-201ENSMUST00000104357 131 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Foxg1Q60987 Glrx2-202ENSMUST00000111957 580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Foxg1Q60987 Htr2c-203ENSMUST00000112831 809 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Foxg1Q60987 Gm12742-201ENSMUST00000117326 410 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Foxg1Q60987 Gm13392-201ENSMUST00000117708 150 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Foxg1Q60987 Gm15420-201ENSMUST00000133274 382 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Foxg1Q60987 Gm12315-201ENSMUST00000151599 911 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Foxg1Q60987 Gm25261-201ENSMUST00000157416 134 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Foxg1Q60987 Gm6222-202ENSMUST00000182143 629 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Foxg1Q60987 Mymx-204ENSMUST00000208801 437 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Foxg1Q60987 AC166051.1-201ENSMUST00000214313 210 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Foxg1Q60987 Cebpe-201ENSMUST00000064290 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Foxg1Q60987 Alkbh3-202ENSMUST00000111240 1395 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Foxg1Q60987 Poc1b-203ENSMUST00000159228 1799 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Foxg1Q60987 4930444K16Rik-201ENSMUST00000220438 1767 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Foxg1Q60987 Whamm-203ENSMUST00000209044 1879 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Foxg1Q60987 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Foxg1Q60987 Gcdh-201ENSMUST00000003907 2167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Foxg1Q60987 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Foxg1Q60987 Slc8b1-204ENSMUST00000111890 2775 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Foxg1Q60987 Nfic-202ENSMUST00000078185 3163 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Foxg1Q60987 Hps3-202ENSMUST00000108321 3385 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Foxg1Q60987 Slc35d1-203ENSMUST00000150285 4242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Foxg1Q60987 Gatad2a-206ENSMUST00000212478 3622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Foxg1Q60987 Atat1-212ENSMUST00000141662 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Foxg1Q60987 Dera-207ENSMUST00000203693 1446 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Foxg1Q60987 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Foxg1Q60987 Cluh-201ENSMUST00000092915 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Foxg1Q60987 Hectd2-208ENSMUST00000169036 3842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Foxg1Q60987 2310007B03Rik-201ENSMUST00000043718 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Foxg1Q60987 Sp6-202ENSMUST00000107622 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Foxg1Q60987 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Foxg1Q60987 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Foxg1Q60987 Adamts7-208ENSMUST00000167122 5338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Foxg1Q60987 Hk3-208ENSMUST00000153665 2945 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Foxg1Q60987 Setd1b-206ENSMUST00000174836 7515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Foxg1Q60987 Gm38157-201ENSMUST00000194178 1698 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Foxg1Q60987 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Foxg1Q60987 Ampd2-202ENSMUST00000102637 3586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Foxg1Q60987 Pex12-207ENSMUST00000176518 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Foxg1Q60987 Crx-203ENSMUST00000172758 1469 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Foxg1Q60987 Dcaf6-201ENSMUST00000027856 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Foxg1Q60987 Tbc1d1-201ENSMUST00000043893 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Foxg1Q60987 Umad1-206ENSMUST00000160705 624 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Foxg1Q60987 Gm16251-201ENSMUST00000162649 338 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Foxg1Q60987 Gm5370-201ENSMUST00000187187 574 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Foxg1Q60987 1700120C14Rik-202ENSMUST00000187967 391 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Foxg1Q60987 Gm43630-201ENSMUST00000201550 776 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Foxg1Q60987 Gm34084-201ENSMUST00000222236 1298 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Foxg1Q60987 Gm19163-201ENSMUST00000223313 780 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Foxg1Q60987 Pfdn1-201ENSMUST00000025204 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Foxg1Q60987 Olfr1423-201ENSMUST00000087831 933 ntAPPRIS P1 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Foxg1Q60987 Usmg5-201ENSMUST00000096014 341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Foxg1Q60987 Sdf4-202ENSMUST00000097734 973 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Foxg1Q60987 Naga-201ENSMUST00000023088 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Foxg1Q60987 Engase-202ENSMUST00000135383 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Foxg1Q60987 Arl14ep-201ENSMUST00000028536 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Foxg1Q60987 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Foxg1Q60987 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Foxg1Q60987 Chml-201ENSMUST00000104984 6905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Foxg1Q60987 Chml-202ENSMUST00000209720 6905 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Foxg1Q60987 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Foxg1Q60987 Heg1-201ENSMUST00000126532 6714 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Foxg1Q60987 Pkp3-201ENSMUST00000066873 2848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Foxg1Q60987 Sv2c-203ENSMUST00000182289 2197 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Foxg1Q60987 H2-T22-201ENSMUST00000058801 1534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Foxg1Q60987 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Foxg1Q60987 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Foxg1Q60987 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Foxg1Q60987 Ccdc94-201ENSMUST00000086869 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Foxg1Q60987 Dctn2-201ENSMUST00000026479 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
Foxg1Q60987 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Foxg1Q60987 Espn-213ENSMUST00000105659 3595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.3 ms