Protein–RNA interactions for Protein: Q60764

Mkrn3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase makorin-3, mousemouse

Predictions only

Length 544 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mkrn3Q60764 Atp5d-201ENSMUST00000003156 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Mkrn3Q60764 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Mkrn3Q60764 Mrps17-201ENSMUST00000042191 832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Mkrn3Q60764 Manf-201ENSMUST00000069036 960 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Mkrn3Q60764 Gm26616-202ENSMUST00000195676 3107 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Mkrn3Q60764 Slc25a22-202ENSMUST00000106006 2277 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Mkrn3Q60764 Syngr2-202ENSMUST00000120928 1402 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Mkrn3Q60764 Dnajc12-201ENSMUST00000043317 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Mkrn3Q60764 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Mkrn3Q60764 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Mkrn3Q60764 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Mkrn3Q60764 D230017M19Rik-201ENSMUST00000180722 3096 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Mkrn3Q60764 Anapc11-201ENSMUST00000026128 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Mkrn3Q60764 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Mkrn3Q60764 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Mkrn3Q60764 Atp5f1-201ENSMUST00000118209 1604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Mkrn3Q60764 Eno2-216ENSMUST00000204896 1640 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Mkrn3Q60764 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Mkrn3Q60764 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Mkrn3Q60764 Erg-201ENSMUST00000077773 2232 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Mkrn3Q60764 Prkag2-202ENSMUST00000076306 2838 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Mkrn3Q60764 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Mkrn3Q60764 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Mkrn3Q60764 Cdkal1-202ENSMUST00000091674 2427 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Mkrn3Q60764 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Mkrn3Q60764 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Mkrn3Q60764 Foxred2-202ENSMUST00000117725 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Mkrn3Q60764 AC123738.2-201ENSMUST00000223791 1899 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Mkrn3Q60764 Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 1701 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Mkrn3Q60764 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Mkrn3Q60764 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Mkrn3Q60764 Smim8-202ENSMUST00000108131 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Mkrn3Q60764 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Mkrn3Q60764 4931428L18Rik-201ENSMUST00000127775 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Mkrn3Q60764 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Mkrn3Q60764 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Mkrn3Q60764 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Mkrn3Q60764 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Mkrn3Q60764 Nat8f4-202ENSMUST00000159755 1129 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Mkrn3Q60764 Rps19-ps13-201ENSMUST00000180504 441 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Mkrn3Q60764 Gm2449-201ENSMUST00000180676 585 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Mkrn3Q60764 Gm26894-201ENSMUST00000180828 1134 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Mkrn3Q60764 Gm43240-201ENSMUST00000198543 630 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Mkrn3Q60764 4933408A14Rik-201ENSMUST00000199037 729 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Mkrn3Q60764 Sox2ot-216ENSMUST00000200092 767 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Mkrn3Q60764 Gm42550-201ENSMUST00000201553 960 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Mkrn3Q60764 Gm43761-201ENSMUST00000202132 991 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Mkrn3Q60764 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Mkrn3Q60764 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Mkrn3Q60764 Prrt3-205ENSMUST00000205170 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Mkrn3Q60764 Retsat-205ENSMUST00000176364 1647 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Mkrn3Q60764 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Mkrn3Q60764 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Mkrn3Q60764 Trim23-201ENSMUST00000022225 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Mkrn3Q60764 Tfcp2-201ENSMUST00000009877 3250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Mkrn3Q60764 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Mkrn3Q60764 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Mkrn3Q60764 Ociad1-202ENSMUST00000071081 1311 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Mkrn3Q60764 Zwilch-209ENSMUST00000176299 1831 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Mkrn3Q60764 Lhx6-201ENSMUST00000112960 3345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Mkrn3Q60764 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Mkrn3Q60764 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Mkrn3Q60764 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Mkrn3Q60764 Mapt-201ENSMUST00000100347 1362 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Mkrn3Q60764 Arr3-201ENSMUST00000113769 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Mkrn3Q60764 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Mkrn3Q60764 Setdb2-205ENSMUST00000161459 2995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Mkrn3Q60764 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Mkrn3Q60764 Grm5-201ENSMUST00000107263 3516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Mkrn3Q60764 Sdc4-201ENSMUST00000017153 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Mkrn3Q60764 Gm45053-201ENSMUST00000206112 2499 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Mkrn3Q60764 Gm43670-201ENSMUST00000199047 1767 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Mkrn3Q60764 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Mkrn3Q60764 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Mkrn3Q60764 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Mkrn3Q60764 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Mkrn3Q60764 Sema4a-202ENSMUST00000107531 2897 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Mkrn3Q60764 Plxdc1-201ENSMUST00000017561 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Mkrn3Q60764 Gm14127-201ENSMUST00000117906 678 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Mkrn3Q60764 Gm13829-201ENSMUST00000119600 138 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Mkrn3Q60764 Gm11622-201ENSMUST00000120525 691 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Mkrn3Q60764 St6galnac6-209ENSMUST00000131229 1013 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Mkrn3Q60764 Gm24239-201ENSMUST00000157791 255 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Mkrn3Q60764 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Mkrn3Q60764 Gm10142-201ENSMUST00000179767 363 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Mkrn3Q60764 Gm26909-201ENSMUST00000181668 627 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Mkrn3Q60764 Gm8581-201ENSMUST00000188636 890 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Mkrn3Q60764 Gm29152-201ENSMUST00000189284 325 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Mkrn3Q60764 Gm29608-201ENSMUST00000190444 463 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Mkrn3Q60764 Gm43553-201ENSMUST00000200900 685 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Mkrn3Q60764 Gm33460-201ENSMUST00000212286 536 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Mkrn3Q60764 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Mkrn3Q60764 Gm17794-201ENSMUST00000220252 955 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Mkrn3Q60764 Acbd7-202ENSMUST00000228935 534 ntAPPRIS ALT1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Mkrn3Q60764 Fuom-201ENSMUST00000026539 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Mkrn3Q60764 Ppp1r14d-201ENSMUST00000076084 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Mkrn3Q60764 Iqcf4-201ENSMUST00000085111 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Mkrn3Q60764 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Mkrn3Q60764 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Mkrn3Q60764 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.5 ms