Protein–RNA interactions for Protein: Q5SWW4

Med13, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 13, mousemouse

Predictions only

Length 2,171 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Med13Q5SWW4 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Med13Q5SWW4 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Med13Q5SWW4 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Med13Q5SWW4 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Med13Q5SWW4 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Med13Q5SWW4 Crx-203ENSMUST00000172758 1469 ntTSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Med13Q5SWW4 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Med13Q5SWW4 Gm45495-201ENSMUST00000200940 1700 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Med13Q5SWW4 Gm3287-205ENSMUST00000228893 1332 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Med13Q5SWW4 Tjap1-203ENSMUST00000180283 2368 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Med13Q5SWW4 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Med13Q5SWW4 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Med13Q5SWW4 Rbpsuh-rs3-201ENSMUST00000182751 1441 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Med13Q5SWW4 Zbtb7b-201ENSMUST00000029677 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Med13Q5SWW4 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Med13Q5SWW4 Gm13736-201ENSMUST00000119272 253 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Med13Q5SWW4 Hmgn1-202ENSMUST00000133885 261 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Med13Q5SWW4 Gm43050-201ENSMUST00000201062 338 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
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Med13Q5SWW4 Dnajc4-201ENSMUST00000025915 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Med13Q5SWW4 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Med13Q5SWW4 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Med13Q5SWW4 Pdgfra-205ENSMUST00000201711 4088 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Med13Q5SWW4 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Med13Q5SWW4 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Med13Q5SWW4 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Med13Q5SWW4 Pitpnb-201ENSMUST00000086635 2761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Med13Q5SWW4 Wdr45-223ENSMUST00000207675 1335 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Med13Q5SWW4 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Med13Q5SWW4 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.51
Med13Q5SWW4 1700110I01Rik-201ENSMUST00000112775 1671 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.51
Med13Q5SWW4 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Med13Q5SWW4 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Med13Q5SWW4 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Med13Q5SWW4 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Med13Q5SWW4 Lgals12-203ENSMUST00000159983 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Med13Q5SWW4 Tex45-203ENSMUST00000161680 1526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Med13Q5SWW4 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Med13Q5SWW4 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
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Med13Q5SWW4 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
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Med13Q5SWW4 Gm45433-201ENSMUST00000209386 247 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Med13Q5SWW4 AC110091.1-201ENSMUST00000216004 691 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Med13Q5SWW4 Defb22-201ENSMUST00000028966 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Med13Q5SWW4 2410015M20Rik-201ENSMUST00000052832 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Med13Q5SWW4 Olfr398-201ENSMUST00000053874 945 ntAPPRIS P1 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Med13Q5SWW4 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Med13Q5SWW4 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Med13Q5SWW4 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Med13Q5SWW4 Mecr-201ENSMUST00000030742 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Med13Q5SWW4 Atxn2l-201ENSMUST00000040202 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Med13Q5SWW4 Tmem268-201ENSMUST00000077709 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Med13Q5SWW4 Pianp-207ENSMUST00000162170 2053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Med13Q5SWW4 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Med13Q5SWW4 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Med13Q5SWW4 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Med13Q5SWW4 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Med13Q5SWW4 Cdk15-201ENSMUST00000114248 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Med13Q5SWW4 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Med13Q5SWW4 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Med13Q5SWW4 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
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