Protein–RNA interactions for Protein: Q5SW46

Lpo, Lactoperoxidase, mousemouse

Predictions only

Length 710 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LpoQ5SW46 Gm17105-201ENSMUST00000163715 652 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
LpoQ5SW46 U2af1l4-221ENSMUST00000167361 860 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
LpoQ5SW46 Iqcf6-201ENSMUST00000171091 537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
LpoQ5SW46 Gm27046-201ENSMUST00000182160 463 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
LpoQ5SW46 Gm3096-201ENSMUST00000185770 364 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
LpoQ5SW46 Gm6652-201ENSMUST00000186414 1070 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
LpoQ5SW46 Gm35082-201ENSMUST00000207308 338 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
LpoQ5SW46 CT009486.1-201ENSMUST00000222047 661 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
LpoQ5SW46 AC167013.1-201ENSMUST00000228592 202 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
LpoQ5SW46 H2-Oa-201ENSMUST00000025192 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
LpoQ5SW46 Cryba2-201ENSMUST00000006721 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
LpoQ5SW46 Lrmda-201ENSMUST00000075639 908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
LpoQ5SW46 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
LpoQ5SW46 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
LpoQ5SW46 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
LpoQ5SW46 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
LpoQ5SW46 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
LpoQ5SW46 Pbld1-201ENSMUST00000020266 2407 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
LpoQ5SW46 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
LpoQ5SW46 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
LpoQ5SW46 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
LpoQ5SW46 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
LpoQ5SW46 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
LpoQ5SW46 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
LpoQ5SW46 Tubb2a-ps2-201ENSMUST00000221547 1339 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
LpoQ5SW46 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
LpoQ5SW46 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
LpoQ5SW46 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
LpoQ5SW46 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
LpoQ5SW46 Dusp26-203ENSMUST00000161713 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
LpoQ5SW46 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
LpoQ5SW46 Cd300lf-202ENSMUST00000106561 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
LpoQ5SW46 Gm36266-201ENSMUST00000196660 1749 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
LpoQ5SW46 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
LpoQ5SW46 Zc3h18-201ENSMUST00000017622 3810 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
LpoQ5SW46 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.27
LpoQ5SW46 Ttc4-201ENSMUST00000026480 2121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
LpoQ5SW46 Vrk1-204ENSMUST00000220629 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
LpoQ5SW46 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
LpoQ5SW46 Ccdc71-201ENSMUST00000061209 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
LpoQ5SW46 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
LpoQ5SW46 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
LpoQ5SW46 Gm4909-201ENSMUST00000118749 794 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
LpoQ5SW46 Gm4760-201ENSMUST00000119663 1030 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
LpoQ5SW46 Endov-204ENSMUST00000129327 1184 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
LpoQ5SW46 Mitd1-205ENSMUST00000139725 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
LpoQ5SW46 Ndufa2-201ENSMUST00000014438 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
LpoQ5SW46 Rps19-ps11-201ENSMUST00000160308 433 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
LpoQ5SW46 Ccdc188-201ENSMUST00000167061 747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
LpoQ5SW46 Rhoc-204ENSMUST00000176347 583 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
LpoQ5SW46 Gm27239-201ENSMUST00000184638 642 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
LpoQ5SW46 1700020N18Rik-201ENSMUST00000188956 547 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
LpoQ5SW46 Gm44405-201ENSMUST00000198952 126 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
LpoQ5SW46 Brsk1-205ENSMUST00000206024 1216 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
LpoQ5SW46 AC158605.1-202ENSMUST00000217860 540 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
LpoQ5SW46 AC113031.8-201ENSMUST00000227856 631 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
LpoQ5SW46 Tnfrsf17-201ENSMUST00000023140 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
LpoQ5SW46 Olfr368-201ENSMUST00000053990 985 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.28
LpoQ5SW46 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
LpoQ5SW46 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
LpoQ5SW46 Ppox-201ENSMUST00000073120 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
LpoQ5SW46 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
LpoQ5SW46 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
LpoQ5SW46 Atat1-212ENSMUST00000141662 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
LpoQ5SW46 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
LpoQ5SW46 Myl6-202ENSMUST00000217733 1668 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
LpoQ5SW46 BB123696-201ENSMUST00000222580 2056 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
LpoQ5SW46 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
LpoQ5SW46 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
LpoQ5SW46 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
LpoQ5SW46 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
LpoQ5SW46 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
LpoQ5SW46 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
LpoQ5SW46 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
LpoQ5SW46 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
LpoQ5SW46 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
LpoQ5SW46 Slc25a42-201ENSMUST00000063788 3081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
LpoQ5SW46 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
LpoQ5SW46 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
LpoQ5SW46 Pianp-207ENSMUST00000162170 2053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
LpoQ5SW46 Spats2l-203ENSMUST00000164302 2088 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
LpoQ5SW46 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
LpoQ5SW46 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
LpoQ5SW46 Fbp1-201ENSMUST00000092888 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
LpoQ5SW46 Apoc1-202ENSMUST00000108451 532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
LpoQ5SW46 Gm6370-201ENSMUST00000110611 1142 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
LpoQ5SW46 Pla2g10-202ENSMUST00000115807 964 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
LpoQ5SW46 Gm14028-201ENSMUST00000117434 479 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
LpoQ5SW46 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
LpoQ5SW46 Acyp1-204ENSMUST00000121930 634 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
LpoQ5SW46 Gm15479-201ENSMUST00000139309 1133 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
LpoQ5SW46 Gm6309-201ENSMUST00000174320 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
LpoQ5SW46 Gm27341-201ENSMUST00000183570 106 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
LpoQ5SW46 Gm28139-201ENSMUST00000189480 643 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
LpoQ5SW46 1700041M19Rik-202ENSMUST00000190908 1123 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
LpoQ5SW46 Gm32468-201ENSMUST00000214199 1040 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
LpoQ5SW46 Gm8712-201ENSMUST00000221090 701 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
LpoQ5SW46 Nit2-201ENSMUST00000023432 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
LpoQ5SW46 Ssc4d-201ENSMUST00000054895 1191 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
LpoQ5SW46 Nmral1-201ENSMUST00000074970 1155 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.1 ms