Protein–RNA interactions for Protein: Q5DTT3

Fam208b, Protein FAM208B, mousemouse

Predictions only

Length 2,382 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam208bQ5DTT3 Mrps34-201ENSMUST00000043907 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Fam208bQ5DTT3 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Fam208bQ5DTT3 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Fam208bQ5DTT3 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Fam208bQ5DTT3 Mapk8-204ENSMUST00000111944 1528 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Fam208bQ5DTT3 Mcm9-204ENSMUST00000219838 4132 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Fam208bQ5DTT3 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Fam208bQ5DTT3 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Fam208bQ5DTT3 Ankrd33-201ENSMUST00000070875 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Fam208bQ5DTT3 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Fam208bQ5DTT3 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Fam208bQ5DTT3 Tnrc6c-201ENSMUST00000026658 8724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Fam208bQ5DTT3 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Fam208bQ5DTT3 Dcaf6-201ENSMUST00000027856 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Fam208bQ5DTT3 Cyp4f17-201ENSMUST00000165999 1693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Fam208bQ5DTT3 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Fam208bQ5DTT3 Rnf214-205ENSMUST00000160699 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Fam208bQ5DTT3 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Fam208bQ5DTT3 Slc7a15-201ENSMUST00000036938 1907 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Fam208bQ5DTT3 6030468B19Rik-201ENSMUST00000106331 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Fam208bQ5DTT3 Tax1bp3-202ENSMUST00000108477 1153 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Fam208bQ5DTT3 Gm11755-201ENSMUST00000144096 891 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Fam208bQ5DTT3 Gm28727-201ENSMUST00000176549 443 ntTSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Fam208bQ5DTT3 AC069562.3-201ENSMUST00000225387 587 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Fam208bQ5DTT3 Sst-201ENSMUST00000004480 599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Fam208bQ5DTT3 Asphd1-201ENSMUST00000052937 730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Fam208bQ5DTT3 Rpl18-201ENSMUST00000072503 679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Fam208bQ5DTT3 Pomgnt1-201ENSMUST00000106494 2226 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Fam208bQ5DTT3 Gm26770-201ENSMUST00000180586 2237 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Fam208bQ5DTT3 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Fam208bQ5DTT3 Kcnt1-211ENSMUST00000171268 3771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
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Fam208bQ5DTT3 Txn2-203ENSMUST00000109747 1778 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Fam208bQ5DTT3 Tekt2-201ENSMUST00000030658 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Fam208bQ5DTT3 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
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Fam208bQ5DTT3 Zbtb1-201ENSMUST00000042779 12190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Fam208bQ5DTT3 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Fam208bQ5DTT3 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Fam208bQ5DTT3 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Fam208bQ5DTT3 Nme8-202ENSMUST00000091763 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Fam208bQ5DTT3 Zp3-201ENSMUST00000005073 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Fam208bQ5DTT3 Gm11595-201ENSMUST00000107440 1200 ntAPPRIS P1 BASIC11.2□□□□□ -0.62
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Fam208bQ5DTT3 Gm27438-201ENSMUST00000183480 110 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Fam208bQ5DTT3 Gm28694-201ENSMUST00000190681 722 ntTSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Fam208bQ5DTT3 Gm7003-201ENSMUST00000195089 312 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Fam208bQ5DTT3 Gm45224-201ENSMUST00000208203 414 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
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Fam208bQ5DTT3 Spata24-201ENSMUST00000025209 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
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Fam208bQ5DTT3 Spata24-202ENSMUST00000096573 709 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Fam208bQ5DTT3 AC126444.1-201ENSMUST00000225938 1768 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Fam208bQ5DTT3 Mpi-201ENSMUST00000034856 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Fam208bQ5DTT3 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Fam208bQ5DTT3 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Fam208bQ5DTT3 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Fam208bQ5DTT3 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Fam208bQ5DTT3 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
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Fam208bQ5DTT3 Rtbdn-203ENSMUST00000121880 1223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
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Fam208bQ5DTT3 Cmtm1-201ENSMUST00000159039 1130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
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Fam208bQ5DTT3 Rbakdn-201ENSMUST00000198334 520 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Fam208bQ5DTT3 AC141438.2-201ENSMUST00000215068 271 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Fam208bQ5DTT3 AC166095.1-201ENSMUST00000223731 1241 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Fam208bQ5DTT3 AC135114.1-201ENSMUST00000228682 270 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Fam208bQ5DTT3 Syngr4-201ENSMUST00000039049 967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Fam208bQ5DTT3 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Fam208bQ5DTT3 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Fam208bQ5DTT3 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Fam208bQ5DTT3 Gm15326-202ENSMUST00000128198 1422 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Fam208bQ5DTT3 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Fam208bQ5DTT3 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Fam208bQ5DTT3 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Fam208bQ5DTT3 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Fam208bQ5DTT3 Gm11696-203ENSMUST00000188296 1793 ntTSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Fam208bQ5DTT3 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Fam208bQ5DTT3 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Fam208bQ5DTT3 E130308A19Rik-201ENSMUST00000052420 3205 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Fam208bQ5DTT3 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
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