Protein–RNA interactions for Protein: Q3UU56

Gm29609, Predicted gene 29609, mousemouse

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Length 907 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm29609Q3UU56 Klk6-203ENSMUST00000107968 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm29609Q3UU56 Nt5c3b-203ENSMUST00000107397 1348 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm29609Q3UU56 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm29609Q3UU56 Ighv7-3-201ENSMUST00000103461 361 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm29609Q3UU56 Gm12416-201ENSMUST00000120911 1008 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm29609Q3UU56 Gm14730-201ENSMUST00000122378 1045 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm29609Q3UU56 Gm16229-201ENSMUST00000133270 1232 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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Gm29609Q3UU56 A930009A15Rik-201ENSMUST00000173620 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm29609Q3UU56 Mymx-203ENSMUST00000178858 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm29609Q3UU56 Gm43240-201ENSMUST00000198543 630 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm29609Q3UU56 Chfr-212ENSMUST00000200038 606 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm29609Q3UU56 Gm7498-201ENSMUST00000203282 1084 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
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Gm29609Q3UU56 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm29609Q3UU56 Tnfrsf4-201ENSMUST00000030952 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm29609Q3UU56 BC049730-201ENSMUST00000051714 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm29609Q3UU56 Aurkc-201ENSMUST00000086248 1154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm29609Q3UU56 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm29609Q3UU56 Sema4a-214ENSMUST00000166237 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm29609Q3UU56 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm29609Q3UU56 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm29609Q3UU56 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm29609Q3UU56 Chchd3-201ENSMUST00000066379 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm29609Q3UU56 Kcnt1-204ENSMUST00000114176 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm29609Q3UU56 Pja1-201ENSMUST00000036354 2563 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm29609Q3UU56 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm29609Q3UU56 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm29609Q3UU56 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm29609Q3UU56 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm29609Q3UU56 Mfsd14b-201ENSMUST00000054730 3251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm29609Q3UU56 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm29609Q3UU56 Gm43650-201ENSMUST00000197337 1382 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm29609Q3UU56 Gm30214-201ENSMUST00000199271 1383 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm29609Q3UU56 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
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Gm29609Q3UU56 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm29609Q3UU56 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm29609Q3UU56 Gm13612-201ENSMUST00000119276 390 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm29609Q3UU56 Gm11793-201ENSMUST00000120433 981 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
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Gm29609Q3UU56 Gm26728-201ENSMUST00000185268 595 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
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Gm29609Q3UU56 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm29609Q3UU56 Bud13-201ENSMUST00000074957 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm29609Q3UU56 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm29609Q3UU56 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm29609Q3UU56 Gm5989-201ENSMUST00000096092 2077 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm29609Q3UU56 Bak1-202ENSMUST00000078691 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm29609Q3UU56 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
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Gm29609Q3UU56 Fam155a-201ENSMUST00000110969 3388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm29609Q3UU56 Dnpep-209ENSMUST00000187836 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm29609Q3UU56 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm29609Q3UU56 B230369F24Rik-201ENSMUST00000141846 2560 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
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Gm29609Q3UU56 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm29609Q3UU56 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
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Gm29609Q3UU56 Prr15l-201ENSMUST00000054311 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm29609Q3UU56 Leng8-203ENSMUST00000121270 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm29609Q3UU56 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm29609Q3UU56 Bpi-203ENSMUST00000109500 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
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Gm29609Q3UU56 Tex26-201ENSMUST00000031667 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm29609Q3UU56 Tsc22d4-201ENSMUST00000031738 1043 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm29609Q3UU56 Gm9843-201ENSMUST00000052867 504 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm29609Q3UU56 Ppp1r14d-201ENSMUST00000076084 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm29609Q3UU56 Efr3a-205ENSMUST00000173858 2848 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm29609Q3UU56 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm29609Q3UU56 Sv2c-203ENSMUST00000182289 2197 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm29609Q3UU56 Ehd1-201ENSMUST00000025684 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm29609Q3UU56 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm29609Q3UU56 Nrg1-210ENSMUST00000208488 2403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm29609Q3UU56 Wnt9a-201ENSMUST00000000128 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm29609Q3UU56 Zeb2-211ENSMUST00000153561 2070 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm29609Q3UU56 Sgce-204ENSMUST00000115577 1776 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm29609Q3UU56 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm29609Q3UU56 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm29609Q3UU56 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm29609Q3UU56 Col9a3-201ENSMUST00000103059 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm29609Q3UU56 Ces2e-202ENSMUST00000109410 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm29609Q3UU56 Cenpl-202ENSMUST00000111618 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm29609Q3UU56 Klhl15-201ENSMUST00000096369 3944 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
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