Protein–RNA interactions for Protein: Q3ULW6

Ccdc33, Coiled-coil domain-containing protein 33, mousemouse

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Length 985 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc33Q3ULW6 Trem3-201ENSMUST00000048065 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccdc33Q3ULW6 Otud6a-201ENSMUST00000060241 873 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccdc33Q3ULW6 Saa3-201ENSMUST00000006956 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccdc33Q3ULW6 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccdc33Q3ULW6 Cdc26-201ENSMUST00000084525 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccdc33Q3ULW6 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccdc33Q3ULW6 Arr3-201ENSMUST00000113769 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccdc33Q3ULW6 Pdcd6-203ENSMUST00000222759 1376 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccdc33Q3ULW6 Fbxo44-208ENSMUST00000167160 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccdc33Q3ULW6 Gm6015-201ENSMUST00000217493 1586 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccdc33Q3ULW6 Snap23-202ENSMUST00000110711 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccdc33Q3ULW6 Gm44241-201ENSMUST00000203230 1662 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccdc33Q3ULW6 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccdc33Q3ULW6 Chfr-201ENSMUST00000014812 3146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccdc33Q3ULW6 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccdc33Q3ULW6 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccdc33Q3ULW6 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccdc33Q3ULW6 Zfyve28-201ENSMUST00000094868 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc33Q3ULW6 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc33Q3ULW6 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc33Q3ULW6 Gm39377-201ENSMUST00000214587 2533 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc33Q3ULW6 Ptgdr2-201ENSMUST00000037261 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc33Q3ULW6 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc33Q3ULW6 Prrx1-204ENSMUST00000174397 6527 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc33Q3ULW6 Ints1-201ENSMUST00000072607 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc33Q3ULW6 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc33Q3ULW6 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc33Q3ULW6 Rhox2c-201ENSMUST00000115190 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc33Q3ULW6 Rbm3-204ENSMUST00000115617 1152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc33Q3ULW6 Gm8805-201ENSMUST00000117848 313 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc33Q3ULW6 Pdlim2-204ENSMUST00000127836 920 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc33Q3ULW6 D230022J07Rik-201ENSMUST00000144735 1062 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc33Q3ULW6 Gm44064-201ENSMUST00000204964 1087 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc33Q3ULW6 Stambp-ps1-201ENSMUST00000209280 1208 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc33Q3ULW6 AC173210.1-201ENSMUST00000222341 1131 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc33Q3ULW6 H2-M10.2-201ENSMUST00000023845 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc33Q3ULW6 Ccl24-201ENSMUST00000004936 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc33Q3ULW6 Gm16519-201ENSMUST00000092011 489 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc33Q3ULW6 Tfe3-206ENSMUST00000115679 3239 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc33Q3ULW6 Hdac5-203ENSMUST00000107151 4852 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc33Q3ULW6 Ap2a1-204ENSMUST00000167930 3376 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc33Q3ULW6 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc33Q3ULW6 Tspyl5-201ENSMUST00000042021 4010 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc33Q3ULW6 Rhbdd3-203ENSMUST00000109878 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc33Q3ULW6 Hsd3b4-202ENSMUST00000196861 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc33Q3ULW6 Gm10681-201ENSMUST00000058728 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc33Q3ULW6 Ncald-211ENSMUST00000168992 3538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc33Q3ULW6 Tbc1d1-201ENSMUST00000043893 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc33Q3ULW6 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc33Q3ULW6 Engase-202ENSMUST00000135383 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc33Q3ULW6 Naa15-205ENSMUST00000193266 7480 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc33Q3ULW6 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc33Q3ULW6 Slc22a15-201ENSMUST00000106928 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc33Q3ULW6 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc33Q3ULW6 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc33Q3ULW6 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc33Q3ULW6 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc33Q3ULW6 Casc4-202ENSMUST00000089912 3602 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc33Q3ULW6 Trpc7-206ENSMUST00000173513 2241 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc33Q3ULW6 Gm43061-201ENSMUST00000198850 2241 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc33Q3ULW6 Prss42-201ENSMUST00000035715 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc33Q3ULW6 Fam13b-201ENSMUST00000040506 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Ccdc33Q3ULW6 Dnpep-203ENSMUST00000185419 2833 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc33Q3ULW6 Styxl1-205ENSMUST00000111164 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc33Q3ULW6 Gm14350-201ENSMUST00000116642 640 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
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Ccdc33Q3ULW6 Gm24990-201ENSMUST00000157406 323 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc33Q3ULW6 Gnpda2-207ENSMUST00000173927 1011 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc33Q3ULW6 1700011D18Rik-201ENSMUST00000205762 277 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc33Q3ULW6 CT025533.2-201ENSMUST00000228715 1248 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc33Q3ULW6 Odf4-201ENSMUST00000038932 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc33Q3ULW6 Cryba2-201ENSMUST00000006721 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc33Q3ULW6 Cbx3-ps1-201ENSMUST00000091539 545 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc33Q3ULW6 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc33Q3ULW6 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc33Q3ULW6 Dda1-206ENSMUST00000138892 1738 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc33Q3ULW6 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc33Q3ULW6 Otud4-203ENSMUST00000173286 7213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc33Q3ULW6 Phldb1-213ENSMUST00000144251 3589 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc33Q3ULW6 Ctdspl2-204ENSMUST00000110578 3386 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc33Q3ULW6 Wwox-203ENSMUST00000109108 1771 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc33Q3ULW6 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc33Q3ULW6 Zc3h4-201ENSMUST00000098789 6039 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc33Q3ULW6 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc33Q3ULW6 Acap1-201ENSMUST00000001631 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc33Q3ULW6 Sh2d7-202ENSMUST00000118413 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc33Q3ULW6 Fam118b-202ENSMUST00000063782 1662 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc33Q3ULW6 Map10-201ENSMUST00000053078 3542 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc33Q3ULW6 Hck-204ENSMUST00000191431 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc33Q3ULW6 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc33Q3ULW6 Pdcd1-201ENSMUST00000027507 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc33Q3ULW6 Oas1e-201ENSMUST00000100785 1801 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc33Q3ULW6 4933424N20Rik-201ENSMUST00000200749 1463 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc33Q3ULW6 Lrp1-202ENSMUST00000118455 2097 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc33Q3ULW6 Aqp6-201ENSMUST00000023754 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc33Q3ULW6 4933431E20Rik-209ENSMUST00000146337 1636 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc33Q3ULW6 Igf1-206ENSMUST00000122100 651 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc33Q3ULW6 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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