Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJD6

Usp19, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 19, mousemouse

Predictions only

Length 1,360 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp19Q3UJD6 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Usp19Q3UJD6 5830462O15Rik-201ENSMUST00000214603 1655 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Usp19Q3UJD6 Spred3-201ENSMUST00000048923 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Usp19Q3UJD6 Trpv1-201ENSMUST00000006106 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Usp19Q3UJD6 Cbarp-214ENSMUST00000169546 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Usp19Q3UJD6 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Usp19Q3UJD6 Rab3d-201ENSMUST00000115351 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Usp19Q3UJD6 Lmntd1-201ENSMUST00000111706 2350 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Usp19Q3UJD6 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Usp19Q3UJD6 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Usp19Q3UJD6 Phf13-201ENSMUST00000055688 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Usp19Q3UJD6 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Usp19Q3UJD6 Fam71f2-201ENSMUST00000115286 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Usp19Q3UJD6 Gm15782-201ENSMUST00000121073 445 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Usp19Q3UJD6 Pdlim2-204ENSMUST00000127836 920 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Usp19Q3UJD6 Gm12167-201ENSMUST00000148132 578 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Usp19Q3UJD6 Gm13115-201ENSMUST00000156438 620 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Usp19Q3UJD6 Gm26083-201ENSMUST00000157904 193 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Usp19Q3UJD6 Gm17111-201ENSMUST00000169981 411 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Usp19Q3UJD6 1700015O11Rik-201ENSMUST00000180964 678 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Usp19Q3UJD6 Gm37008-201ENSMUST00000195712 319 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Usp19Q3UJD6 Tmem205-203ENSMUST00000213698 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Usp19Q3UJD6 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Usp19Q3UJD6 4930429D17Rik-201ENSMUST00000198193 1624 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Usp19Q3UJD6 Syt2-204ENSMUST00000188842 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Usp19Q3UJD6 Slc23a4-201ENSMUST00000044387 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Usp19Q3UJD6 Exosc2-201ENSMUST00000038474 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Usp19Q3UJD6 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Usp19Q3UJD6 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Usp19Q3UJD6 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Usp19Q3UJD6 Sema4a-213ENSMUST00000165898 3125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Usp19Q3UJD6 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Usp19Q3UJD6 Gm43570-201ENSMUST00000199951 3688 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Usp19Q3UJD6 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Usp19Q3UJD6 Bcat2-203ENSMUST00000209204 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Usp19Q3UJD6 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Usp19Q3UJD6 Aamp-202ENSMUST00000178235 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Usp19Q3UJD6 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Usp19Q3UJD6 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Usp19Q3UJD6 Arfip1-201ENSMUST00000098990 2799 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Usp19Q3UJD6 B4galnt3-203ENSMUST00000212457 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Usp19Q3UJD6 Plekhb1-203ENSMUST00000107044 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Usp19Q3UJD6 Ampd2-202ENSMUST00000102637 3586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Usp19Q3UJD6 Zfp248-205ENSMUST00000161519 2243 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Usp19Q3UJD6 4930581F22Rik-201ENSMUST00000093873 2402 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Usp19Q3UJD6 Gm12714-201ENSMUST00000143391 669 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Usp19Q3UJD6 Cabp2-201ENSMUST00000159148 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Usp19Q3UJD6 Gm17180-201ENSMUST00000172211 435 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Usp19Q3UJD6 Rab11b-ps2-201ENSMUST00000178377 657 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Usp19Q3UJD6 Dleu2-205ENSMUST00000182325 463 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Usp19Q3UJD6 Dleu2-212ENSMUST00000183079 535 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Usp19Q3UJD6 Gm27516-201ENSMUST00000184237 98 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Usp19Q3UJD6 Gm7783-201ENSMUST00000204795 781 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Usp19Q3UJD6 4933424G06Rik-204ENSMUST00000208994 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Usp19Q3UJD6 Cyb5d1-201ENSMUST00000051620 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Usp19Q3UJD6 n-R5s77-201ENSMUST00000083757 119 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Usp19Q3UJD6 Gm44775-201ENSMUST00000207266 1456 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Usp19Q3UJD6 Pacrg-201ENSMUST00000041463 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Usp19Q3UJD6 Tmc6-201ENSMUST00000026659 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Usp19Q3UJD6 Chfr-201ENSMUST00000014812 3146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Usp19Q3UJD6 Gm595-201ENSMUST00000114928 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Usp19Q3UJD6 Marco-201ENSMUST00000027639 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Usp19Q3UJD6 Ube2a-201ENSMUST00000016452 1732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Usp19Q3UJD6 Tmem17-201ENSMUST00000059319 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Usp19Q3UJD6 Ints5-201ENSMUST00000096249 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Usp19Q3UJD6 Gm12132-201ENSMUST00000130945 1391 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Usp19Q3UJD6 Ahcyl2-205ENSMUST00000125911 2039 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Usp19Q3UJD6 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Usp19Q3UJD6 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Usp19Q3UJD6 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Usp19Q3UJD6 Adam32-202ENSMUST00000121438 2450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Usp19Q3UJD6 Ddx19b-202ENSMUST00000065784 3104 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Usp19Q3UJD6 Dnaja2-201ENSMUST00000034138 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Usp19Q3UJD6 Rnf185-201ENSMUST00000064364 2906 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Usp19Q3UJD6 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Usp19Q3UJD6 Osgepl1-201ENSMUST00000027265 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Usp19Q3UJD6 Myc-205ENSMUST00000161976 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Usp19Q3UJD6 Myc-201ENSMUST00000022971 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Usp19Q3UJD6 Gm14866-201ENSMUST00000149206 2118 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Usp19Q3UJD6 Terb2-201ENSMUST00000028661 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Usp19Q3UJD6 Slc25a22-223ENSMUST00000201710 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Usp19Q3UJD6 Pphln1-204ENSMUST00000165935 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Usp19Q3UJD6 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Usp19Q3UJD6 Slc34a3-201ENSMUST00000006638 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Usp19Q3UJD6 Tmprss9-203ENSMUST00000219817 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Usp19Q3UJD6 Toe1-202ENSMUST00000106455 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Usp19Q3UJD6 Rpl3-ps2-201ENSMUST00000117131 1214 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Usp19Q3UJD6 Gm16296-201ENSMUST00000159905 325 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Usp19Q3UJD6 4930516B21Rik-201ENSMUST00000181600 1195 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Usp19Q3UJD6 Anapc16-202ENSMUST00000182116 581 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Usp19Q3UJD6 Gm5850-201ENSMUST00000192923 1206 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Usp19Q3UJD6 Gm8099-201ENSMUST00000200510 742 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Usp19Q3UJD6 Gm9176-201ENSMUST00000219955 1120 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Usp19Q3UJD6 4921530L21Rik-202ENSMUST00000228913 1115 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Usp19Q3UJD6 Gm24526-201ENSMUST00000082921 158 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Usp19Q3UJD6 Dppa4-202ENSMUST00000096045 1534 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Usp19Q3UJD6 Cad-206ENSMUST00000201838 3153 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Usp19Q3UJD6 2900069G24Rik-201ENSMUST00000192780 1311 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Usp19Q3UJD6 Vrtn-202ENSMUST00000166772 3098 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Usp19Q3UJD6 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.4 ms