Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHX8

Nkx6-3, Homeobox protein Nkx-6.3, mousemouse

Predictions only

Length 262 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkx6-3Q3UHX8 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Nkx6-3Q3UHX8 Oraov1-201ENSMUST00000033388 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Nkx6-3Q3UHX8 Trp53-202ENSMUST00000108657 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Nkx6-3Q3UHX8 Fbln1-201ENSMUST00000057410 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Nkx6-3Q3UHX8 5330406M23Rik-201ENSMUST00000195672 2094 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Nkx6-3Q3UHX8 Ccrl2-203ENSMUST00000199839 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Nkx6-3Q3UHX8 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Nkx6-3Q3UHX8 Spata3-202ENSMUST00000113344 1047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Nkx6-3Q3UHX8 Fam71f2-201ENSMUST00000115286 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Nkx6-3Q3UHX8 Gm12291-201ENSMUST00000121627 311 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Nkx6-3Q3UHX8 6330418K02Rik-201ENSMUST00000124298 743 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Nkx6-3Q3UHX8 Gm20521-201ENSMUST00000134077 1245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Nkx6-3Q3UHX8 Gm12843-201ENSMUST00000137607 601 ntTSL 3 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Nkx6-3Q3UHX8 Gm7809-201ENSMUST00000153199 742 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Nkx6-3Q3UHX8 1700037C18Rik-205ENSMUST00000177323 915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Nkx6-3Q3UHX8 Hmgcll1-207ENSMUST00000183979 1136 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Nkx6-3Q3UHX8 Gm8099-201ENSMUST00000200510 742 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Nkx6-3Q3UHX8 Gm43416-201ENSMUST00000201916 1015 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Nkx6-3Q3UHX8 Fam168a-206ENSMUST00000208013 1129 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Nkx6-3Q3UHX8 Gm18041-201ENSMUST00000218210 618 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Nkx6-3Q3UHX8 AC153506.3-201ENSMUST00000219287 1029 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Nkx6-3Q3UHX8 AC133598.1-201ENSMUST00000224327 660 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Nkx6-3Q3UHX8 Sit1-201ENSMUST00000030180 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Nkx6-3Q3UHX8 Gk5-202ENSMUST00000122383 4455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Nkx6-3Q3UHX8 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Nkx6-3Q3UHX8 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Nkx6-3Q3UHX8 Mest-211ENSMUST00000163949 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Nkx6-3Q3UHX8 Fktn-204ENSMUST00000221657 6241 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Nkx6-3Q3UHX8 Hmox2-201ENSMUST00000004172 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Nkx6-3Q3UHX8 Prdm5-202ENSMUST00000031976 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Nkx6-3Q3UHX8 Dppa4-202ENSMUST00000096045 1534 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Nkx6-3Q3UHX8 B430212C06Rik-205ENSMUST00000145081 2623 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Nkx6-3Q3UHX8 Dnm2-201ENSMUST00000072362 3502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Nkx6-3Q3UHX8 Eme1-201ENSMUST00000039949 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Nkx6-3Q3UHX8 Fbxw7-201ENSMUST00000029727 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Nkx6-3Q3UHX8 Acsl6-210ENSMUST00000108905 5807 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Nkx6-3Q3UHX8 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Nkx6-3Q3UHX8 B230209E15Rik-201ENSMUST00000209115 1597 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Nkx6-3Q3UHX8 Mtnr1a-201ENSMUST00000067984 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Nkx6-3Q3UHX8 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Nkx6-3Q3UHX8 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Nkx6-3Q3UHX8 Lingo1-202ENSMUST00000114247 2287 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Nkx6-3Q3UHX8 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Nkx6-3Q3UHX8 Akr1b3-201ENSMUST00000102980 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Nkx6-3Q3UHX8 Nectin4-202ENSMUST00000094325 3245 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
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Nkx6-3Q3UHX8 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Nkx6-3Q3UHX8 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Nkx6-3Q3UHX8 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Nkx6-3Q3UHX8 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Nkx6-3Q3UHX8 Smpd4-206ENSMUST00000163997 1722 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Nkx6-3Q3UHX8 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Nkx6-3Q3UHX8 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Nkx6-3Q3UHX8 Ddi2-202ENSMUST00000177592 3539 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
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Nkx6-3Q3UHX8 Mknk1-201ENSMUST00000019677 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
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Nkx6-3Q3UHX8 Net1-207ENSMUST00000223258 597 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
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Nkx6-3Q3UHX8 Asic3-202ENSMUST00000196296 1593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Nkx6-3Q3UHX8 2310026I22Rik-201ENSMUST00000180941 1300 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
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Nkx6-3Q3UHX8 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
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Nkx6-3Q3UHX8 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Nkx6-3Q3UHX8 Pitpnm2-204ENSMUST00000159677 1690 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Nkx6-3Q3UHX8 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Nkx6-3Q3UHX8 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Nkx6-3Q3UHX8 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Nkx6-3Q3UHX8 Slc6a18-210ENSMUST00000223074 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Nkx6-3Q3UHX8 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Nkx6-3Q3UHX8 Cyth1-204ENSMUST00000106305 3179 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Nkx6-3Q3UHX8 Gm44094-201ENSMUST00000204703 2030 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Nkx6-3Q3UHX8 Gm44775-201ENSMUST00000207266 1456 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Nkx6-3Q3UHX8 Dnd1-201ENSMUST00000061522 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Nkx6-3Q3UHX8 Mllt10-203ENSMUST00000114671 5063 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Nkx6-3Q3UHX8 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Nkx6-3Q3UHX8 Exoc6b-203ENSMUST00000160197 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Nkx6-3Q3UHX8 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Nkx6-3Q3UHX8 Tigd2-201ENSMUST00000062626 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Nkx6-3Q3UHX8 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Nkx6-3Q3UHX8 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
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