Protein–RNA interactions for Protein: Q3U285

Lcorl, Ligand-dependent nuclear receptor corepressor-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 600 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LcorlQ3U285 Dolpp1-202ENSMUST00000113612 1958 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
LcorlQ3U285 1810030O07Rik-201ENSMUST00000060108 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
LcorlQ3U285 Stx17-201ENSMUST00000064765 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
LcorlQ3U285 Trim27-205ENSMUST00000221464 1400 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
LcorlQ3U285 Prkcd-202ENSMUST00000112202 2005 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
LcorlQ3U285 Ephb3-201ENSMUST00000006112 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
LcorlQ3U285 Sirpa-214ENSMUST00000179001 3812 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
LcorlQ3U285 Mixl1-201ENSMUST00000027778 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
LcorlQ3U285 Il12rb1-201ENSMUST00000000808 2873 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
LcorlQ3U285 Cavin1-201ENSMUST00000060792 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
LcorlQ3U285 Slc7a15-201ENSMUST00000036938 1907 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
LcorlQ3U285 Golim4-202ENSMUST00000117242 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
LcorlQ3U285 Bbof1-201ENSMUST00000081828 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
LcorlQ3U285 Arhgef2-229ENSMUST00000177303 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
LcorlQ3U285 Rbm14-201ENSMUST00000006625 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
LcorlQ3U285 Vps4b-202ENSMUST00000112736 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
LcorlQ3U285 Siglecg-201ENSMUST00000005592 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
LcorlQ3U285 Dpp8-201ENSMUST00000034960 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
LcorlQ3U285 Nup88-203ENSMUST00000108531 2453 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
LcorlQ3U285 Zfp862-ps-204ENSMUST00000204484 6065 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
LcorlQ3U285 Lztr1-201ENSMUST00000023444 3112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
LcorlQ3U285 Slc7a6-201ENSMUST00000034378 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
LcorlQ3U285 Ikzf1-204ENSMUST00000076700 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
LcorlQ3U285 Oraov1-201ENSMUST00000033388 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
LcorlQ3U285 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
LcorlQ3U285 Fmo1-202ENSMUST00000111518 1506 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
LcorlQ3U285 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
LcorlQ3U285 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
LcorlQ3U285 Gm14224-201ENSMUST00000147187 864 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
LcorlQ3U285 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
LcorlQ3U285 Gm44397-201ENSMUST00000195950 113 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
LcorlQ3U285 Nrg1-210ENSMUST00000208488 2403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
LcorlQ3U285 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
LcorlQ3U285 Dbn1-201ENSMUST00000021950 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
LcorlQ3U285 Mest-211ENSMUST00000163949 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
LcorlQ3U285 Gm26519-201ENSMUST00000181193 2249 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
LcorlQ3U285 Nde1-203ENSMUST00000117958 1551 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
LcorlQ3U285 Ubqln1-202ENSMUST00000076454 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
LcorlQ3U285 Armc7-201ENSMUST00000035240 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
LcorlQ3U285 Myh3-202ENSMUST00000108689 6031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
LcorlQ3U285 Eif5-202ENSMUST00000166123 4050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
LcorlQ3U285 Rbbp5-207ENSMUST00000190997 2856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
LcorlQ3U285 Mrpl3-201ENSMUST00000035177 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
LcorlQ3U285 Daglb-201ENSMUST00000045593 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
LcorlQ3U285 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
LcorlQ3U285 M6pr-202ENSMUST00000112610 2539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
LcorlQ3U285 M6pr-201ENSMUST00000007602 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
LcorlQ3U285 Urgcp-203ENSMUST00000118076 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
LcorlQ3U285 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
LcorlQ3U285 Dlk1-202ENSMUST00000109841 879 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
LcorlQ3U285 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
LcorlQ3U285 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
LcorlQ3U285 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
LcorlQ3U285 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
LcorlQ3U285 2310040G24Rik-202ENSMUST00000189386 775 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
LcorlQ3U285 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
LcorlQ3U285 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
LcorlQ3U285 Cdc45-201ENSMUST00000000028 2143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
LcorlQ3U285 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
LcorlQ3U285 Ckm-203ENSMUST00000208710 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
LcorlQ3U285 Mlx-203ENSMUST00000107303 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
LcorlQ3U285 Polg-201ENSMUST00000073889 7837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
LcorlQ3U285 Abhd18-202ENSMUST00000108078 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
LcorlQ3U285 Reep3-201ENSMUST00000020023 5430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
LcorlQ3U285 Ubr7-201ENSMUST00000046404 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
LcorlQ3U285 Tnks1bp1-201ENSMUST00000048400 4799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
LcorlQ3U285 Phrf1-201ENSMUST00000106027 5248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
LcorlQ3U285 Mynn-202ENSMUST00000192715 5555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
LcorlQ3U285 Urgcp-204ENSMUST00000120306 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
LcorlQ3U285 Vps36-201ENSMUST00000033866 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
LcorlQ3U285 Ppara-202ENSMUST00000109422 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
LcorlQ3U285 4931429P17Rik-201ENSMUST00000061899 2012 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
LcorlQ3U285 Acoxl-202ENSMUST00000110344 1573 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
LcorlQ3U285 Zranb2-201ENSMUST00000029831 2540 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
LcorlQ3U285 Gm14350-201ENSMUST00000116642 640 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
LcorlQ3U285 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
LcorlQ3U285 4933427I22Rik-201ENSMUST00000138672 393 ntTSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
LcorlQ3U285 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
LcorlQ3U285 Rims3-204ENSMUST00000171363 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
LcorlQ3U285 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
LcorlQ3U285 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
LcorlQ3U285 Gm5276-201ENSMUST00000196683 1047 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
LcorlQ3U285 Trmt112-ps1-201ENSMUST00000202320 375 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
LcorlQ3U285 9230020A06Rik-204ENSMUST00000215201 1116 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
LcorlQ3U285 Itm2b-204ENSMUST00000228637 783 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
LcorlQ3U285 AC154276.1-201ENSMUST00000228874 1299 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
LcorlQ3U285 Cyct-201ENSMUST00000028430 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
LcorlQ3U285 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
LcorlQ3U285 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
LcorlQ3U285 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC12.83□□□□□ -0.36
LcorlQ3U285 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
LcorlQ3U285 Lyzl4-201ENSMUST00000077706 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
LcorlQ3U285 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
LcorlQ3U285 Fars2-202ENSMUST00000099582 962 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
LcorlQ3U285 Gm7114-201ENSMUST00000190159 1789 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
LcorlQ3U285 Usp17le-201ENSMUST00000053464 1626 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
LcorlQ3U285 Gcdh-202ENSMUST00000109745 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
LcorlQ3U285 Khdrbs2-205ENSMUST00000189878 3259 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
LcorlQ3U285 Ptp4a3-204ENSMUST00000167582 2640 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
LcorlQ3U285 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.7 ms