Protein–RNA interactions for Protein: Q2V6D6

Gbp8, Guanylate-binding protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 525 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbp8Q2V6D6 Hps3-201ENSMUST00000012580 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gbp8Q2V6D6 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gbp8Q2V6D6 Cd33-202ENSMUST00000039861 1791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Gbp8Q2V6D6 Trp53-202ENSMUST00000108657 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Gbp8Q2V6D6 Cd200r1-201ENSMUST00000057488 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Gbp8Q2V6D6 Sfxn3-202ENSMUST00000084493 2843 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Gbp8Q2V6D6 Olfr648-202ENSMUST00000216612 2929 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Gbp8Q2V6D6 Zmym1-202ENSMUST00000106099 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Gbp8Q2V6D6 Csrnp2-201ENSMUST00000061457 4126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Gbp8Q2V6D6 Stat5b-202ENSMUST00000107358 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Gbp8Q2V6D6 Gm19817-201ENSMUST00000199764 2132 ntBASIC13.27□□□□□ -0.28
Gbp8Q2V6D6 Epha5-206ENSMUST00000113406 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Gbp8Q2V6D6 Plce1-204ENSMUST00000182481 8357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gbp8Q2V6D6 Sorbs3-202ENSMUST00000227259 2481 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gbp8Q2V6D6 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Gbp8Q2V6D6 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Gbp8Q2V6D6 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gbp8Q2V6D6 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gbp8Q2V6D6 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gbp8Q2V6D6 AC156504.2-201ENSMUST00000213800 711 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gbp8Q2V6D6 Fam173b-201ENSMUST00000042702 1164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gbp8Q2V6D6 Tcp10b-202ENSMUST00000116666 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gbp8Q2V6D6 Kcnd1-201ENSMUST00000009875 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gbp8Q2V6D6 Tmem30c-202ENSMUST00000119407 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gbp8Q2V6D6 Kcnc2-204ENSMUST00000219301 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gbp8Q2V6D6 Vps52-201ENSMUST00000025178 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gbp8Q2V6D6 Abra-201ENSMUST00000054742 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gbp8Q2V6D6 Vps36-201ENSMUST00000033866 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gbp8Q2V6D6 Map2k4-201ENSMUST00000046963 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gbp8Q2V6D6 Cdk7-201ENSMUST00000091299 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gbp8Q2V6D6 Gm14866-201ENSMUST00000149206 2118 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gbp8Q2V6D6 Arhgap20os-204ENSMUST00000152203 2113 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gbp8Q2V6D6 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gbp8Q2V6D6 Pbld2-201ENSMUST00000020262 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gbp8Q2V6D6 Accsl-201ENSMUST00000099690 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gbp8Q2V6D6 Micalcl-201ENSMUST00000033033 2259 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gbp8Q2V6D6 Gsn-205ENSMUST00000201185 2607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gbp8Q2V6D6 Cpt1c-206ENSMUST00000212836 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gbp8Q2V6D6 Cdc42se1-201ENSMUST00000053872 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gbp8Q2V6D6 Cdc7-203ENSMUST00000117196 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gbp8Q2V6D6 Gm10578-202ENSMUST00000211070 2876 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gbp8Q2V6D6 Il12rb1-201ENSMUST00000000808 2873 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gbp8Q2V6D6 Rbfox2-202ENSMUST00000111581 3072 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gbp8Q2V6D6 Pex5-205ENSMUST00000112532 3148 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gbp8Q2V6D6 Rara-207ENSMUST00000164748 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gbp8Q2V6D6 Trim26-205ENSMUST00000130367 3187 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gbp8Q2V6D6 Tbkbp1-204ENSMUST00000107615 3333 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gbp8Q2V6D6 Armcx2-201ENSMUST00000035559 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gbp8Q2V6D6 Setd1a-201ENSMUST00000047075 6487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gbp8Q2V6D6 Prok2-203ENSMUST00000101120 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gbp8Q2V6D6 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gbp8Q2V6D6 Nek3-202ENSMUST00000110730 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gbp8Q2V6D6 Tfe3-205ENSMUST00000115678 2658 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gbp8Q2V6D6 Pdxdc1-204ENSMUST00000115804 2880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gbp8Q2V6D6 Dctn6-202ENSMUST00000117243 962 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gbp8Q2V6D6 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Gbp8Q2V6D6 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Gbp8Q2V6D6 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gbp8Q2V6D6 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gbp8Q2V6D6 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Gbp8Q2V6D6 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gbp8Q2V6D6 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gbp8Q2V6D6 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
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Gbp8Q2V6D6 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gbp8Q2V6D6 Ccdc30-202ENSMUST00000063642 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gbp8Q2V6D6 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gbp8Q2V6D6 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gbp8Q2V6D6 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gbp8Q2V6D6 Nup98-201ENSMUST00000070165 4052 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gbp8Q2V6D6 Arhgap27-204ENSMUST00000107024 3976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gbp8Q2V6D6 Lin28a-201ENSMUST00000051674 3505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gbp8Q2V6D6 Ocrl-203ENSMUST00000115020 3210 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gbp8Q2V6D6 Slc39a8-201ENSMUST00000029810 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gbp8Q2V6D6 Dlc1-201ENSMUST00000033923 6159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gbp8Q2V6D6 Polr3e-202ENSMUST00000106483 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gbp8Q2V6D6 Anks1b-221ENSMUST00000182786 3042 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gbp8Q2V6D6 Jmjd1c-211ENSMUST00000174408 8377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gbp8Q2V6D6 Jmjd1c-201ENSMUST00000051446 8382 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gbp8Q2V6D6 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gbp8Q2V6D6 Fmo1-201ENSMUST00000046049 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gbp8Q2V6D6 Hhipl2-202ENSMUST00000192527 2310 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gbp8Q2V6D6 Zkscan3-207ENSMUST00000223831 2101 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Gbp8Q2V6D6 Atp6v1b1-201ENSMUST00000006431 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gbp8Q2V6D6 Cldn15-201ENSMUST00000001790 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gbp8Q2V6D6 Sgce-204ENSMUST00000115577 1776 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gbp8Q2V6D6 Wnt9a-202ENSMUST00000108783 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gbp8Q2V6D6 Kcnab2-203ENSMUST00000159186 1552 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gbp8Q2V6D6 Pex2-206ENSMUST00000195855 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gbp8Q2V6D6 Zufsp-201ENSMUST00000048222 2991 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gbp8Q2V6D6 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gbp8Q2V6D6 Tekt2-201ENSMUST00000030658 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gbp8Q2V6D6 Tfe3-204ENSMUST00000115677 2943 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gbp8Q2V6D6 Brms1-201ENSMUST00000116567 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gbp8Q2V6D6 Sstr5-202ENSMUST00000165183 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gbp8Q2V6D6 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Gbp8Q2V6D6 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gbp8Q2V6D6 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Gbp8Q2V6D6 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gbp8Q2V6D6 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.5 ms