Protein–RNA interactions for Protein: Q14AI6

Rpusd3, Mitochondrial mRNA pseudouridine synthase Rpusd3, mousemouse

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Length 344 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd3Q14AI6 Man1a2-201ENSMUST00000008907 7969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rpusd3Q14AI6 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rpusd3Q14AI6 Lrig2-201ENSMUST00000046316 7099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rpusd3Q14AI6 Sh3kbp1-206ENSMUST00000112456 7317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rpusd3Q14AI6 Msh4-201ENSMUST00000005630 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rpusd3Q14AI6 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rpusd3Q14AI6 Naaa-201ENSMUST00000113102 2414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rpusd3Q14AI6 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
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Rpusd3Q14AI6 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
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Rpusd3Q14AI6 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
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Rpusd3Q14AI6 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
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Rpusd3Q14AI6 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC11.33□□□□□ -0.6
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Rpusd3Q14AI6 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rpusd3Q14AI6 Capn2-201ENSMUST00000068505 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
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Rpusd3Q14AI6 Nup160-201ENSMUST00000057481 5684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rpusd3Q14AI6 Tjap1-201ENSMUST00000012440 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rpusd3Q14AI6 Drd1-201ENSMUST00000021932 3526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rpusd3Q14AI6 Rpl9-204ENSMUST00000127874 2690 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rpusd3Q14AI6 Madd-212ENSMUST00000111375 5706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rpusd3Q14AI6 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rpusd3Q14AI6 Gm26857-201ENSMUST00000181580 3347 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rpusd3Q14AI6 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rpusd3Q14AI6 Setd1a-202ENSMUST00000047157 5927 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rpusd3Q14AI6 Pcid2-201ENSMUST00000164416 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rpusd3Q14AI6 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rpusd3Q14AI6 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rpusd3Q14AI6 Flcn-202ENSMUST00000091246 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rpusd3Q14AI6 Vipr1-201ENSMUST00000035115 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rpusd3Q14AI6 Prodh-205ENSMUST00000136776 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
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Rpusd3Q14AI6 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rpusd3Q14AI6 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rpusd3Q14AI6 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rpusd3Q14AI6 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rpusd3Q14AI6 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
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Rpusd3Q14AI6 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rpusd3Q14AI6 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rpusd3Q14AI6 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rpusd3Q14AI6 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rpusd3Q14AI6 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rpusd3Q14AI6 Sorcs1-205ENSMUST00000209413 4398 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rpusd3Q14AI6 Zfp108-203ENSMUST00000206777 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rpusd3Q14AI6 Pcdhb1-201ENSMUST00000052366 2588 ntAPPRIS P1 BASIC11.32□□□□□ -0.6
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Rpusd3Q14AI6 Rtn4rl1-201ENSMUST00000102514 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rpusd3Q14AI6 Pprc1-201ENSMUST00000062322 5205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rpusd3Q14AI6 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rpusd3Q14AI6 Add2-202ENSMUST00000203196 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rpusd3Q14AI6 AC151895.1-201ENSMUST00000219025 1742 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
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Rpusd3Q14AI6 Lin28a-201ENSMUST00000051674 3505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
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Rpusd3Q14AI6 Scd2-201ENSMUST00000026221 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rpusd3Q14AI6 Phrf1-201ENSMUST00000106027 5248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rpusd3Q14AI6 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rpusd3Q14AI6 Trim26-205ENSMUST00000130367 3187 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
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Rpusd3Q14AI6 Pglyrp2-202ENSMUST00000170392 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rpusd3Q14AI6 Chodl-202ENSMUST00000069148 2051 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rpusd3Q14AI6 Ppil2-212ENSMUST00000164458 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rpusd3Q14AI6 Eif2ak1-201ENSMUST00000100487 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rpusd3Q14AI6 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rpusd3Q14AI6 Cyp27b1-201ENSMUST00000165764 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rpusd3Q14AI6 Cdkl2-204ENSMUST00000113143 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rpusd3Q14AI6 Ank3-201ENSMUST00000047061 2517 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rpusd3Q14AI6 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rpusd3Q14AI6 E2f3-201ENSMUST00000102948 5097 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rpusd3Q14AI6 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rpusd3Q14AI6 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rpusd3Q14AI6 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rpusd3Q14AI6 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rpusd3Q14AI6 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Rpusd3Q14AI6 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rpusd3Q14AI6 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rpusd3Q14AI6 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rpusd3Q14AI6 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rpusd3Q14AI6 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rpusd3Q14AI6 Tpm3-rs7-201ENSMUST00000072359 2147 ntAPPRIS P1 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rpusd3Q14AI6 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rpusd3Q14AI6 Kcnt1-201ENSMUST00000037580 5881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rpusd3Q14AI6 Cpt1c-206ENSMUST00000212836 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rpusd3Q14AI6 Tmem132a-202ENSMUST00000120524 3895 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.1 ms