Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF55

Atp2b3, Calcium-transporting ATPase, mousemouse

Predictions only

Length 1,220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp2b3Q0VF55 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Atp2b3Q0VF55 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Atp2b3Q0VF55 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Atp2b3Q0VF55 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Atp2b3Q0VF55 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Atp2b3Q0VF55 Srsf10-205ENSMUST00000126641 3754 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Atp2b3Q0VF55 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Atp2b3Q0VF55 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Atp2b3Q0VF55 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Atp2b3Q0VF55 Ngly1-207ENSMUST00000224656 2329 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Atp2b3Q0VF55 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Atp2b3Q0VF55 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Atp2b3Q0VF55 Tollip-204ENSMUST00000151890 1753 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Atp2b3Q0VF55 Phldb1-213ENSMUST00000144251 3589 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Atp2b3Q0VF55 Acta1-201ENSMUST00000034453 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Atp2b3Q0VF55 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Atp2b3Q0VF55 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Atp2b3Q0VF55 Rfx7-203ENSMUST00000183372 1457 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Atp2b3Q0VF55 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Atp2b3Q0VF55 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Atp2b3Q0VF55 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Atp2b3Q0VF55 Fam71f2-201ENSMUST00000115286 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Atp2b3Q0VF55 Rpl3-ps2-201ENSMUST00000117131 1214 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Atp2b3Q0VF55 Gm15198-201ENSMUST00000117283 177 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Atp2b3Q0VF55 Gm12329-201ENSMUST00000120829 1007 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Atp2b3Q0VF55 Gm16191-202ENSMUST00000148464 484 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Atp2b3Q0VF55 Gm16379-201ENSMUST00000161469 348 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Atp2b3Q0VF55 Cox6b2-204ENSMUST00000182173 391 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Atp2b3Q0VF55 Gm5850-201ENSMUST00000192923 1206 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Atp2b3Q0VF55 Gm8762-201ENSMUST00000193486 339 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Atp2b3Q0VF55 Gm19710-201ENSMUST00000200257 640 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Atp2b3Q0VF55 Brk1-201ENSMUST00000035725 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Atp2b3Q0VF55 Rpl18a-201ENSMUST00000054220 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Atp2b3Q0VF55 Cdc26-201ENSMUST00000084525 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Atp2b3Q0VF55 Dph2-201ENSMUST00000030265 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Atp2b3Q0VF55 Gjb5-201ENSMUST00000046498 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Atp2b3Q0VF55 Slc5a11-201ENSMUST00000033035 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Atp2b3Q0VF55 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Atp2b3Q0VF55 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Atp2b3Q0VF55 Hid1-202ENSMUST00000106542 3276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Atp2b3Q0VF55 Brd2-201ENSMUST00000025193 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Atp2b3Q0VF55 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Atp2b3Q0VF55 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Atp2b3Q0VF55 Stx4a-202ENSMUST00000121705 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Atp2b3Q0VF55 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Atp2b3Q0VF55 Fbxo44-208ENSMUST00000167160 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Atp2b3Q0VF55 Emp1-206ENSMUST00000205156 2911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Atp2b3Q0VF55 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Atp2b3Q0VF55 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Atp2b3Q0VF55 Ebf1-202ENSMUST00000101326 3422 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Atp2b3Q0VF55 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Atp2b3Q0VF55 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Atp2b3Q0VF55 Gm18222-201ENSMUST00000202416 1387 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Atp2b3Q0VF55 Sema4a-214ENSMUST00000166237 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Atp2b3Q0VF55 Ntrk2-204ENSMUST00000224259 3049 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Atp2b3Q0VF55 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Atp2b3Q0VF55 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Atp2b3Q0VF55 Dgcr8-202ENSMUST00000115633 4522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Atp2b3Q0VF55 Diaph1-204ENSMUST00000115631 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Atp2b3Q0VF55 Ptgdr2-201ENSMUST00000037261 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Atp2b3Q0VF55 Tspan13-201ENSMUST00000020896 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Atp2b3Q0VF55 Slc34a3-201ENSMUST00000006638 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Atp2b3Q0VF55 Cbs-203ENSMUST00000118504 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Atp2b3Q0VF55 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Atp2b3Q0VF55 Pnck-203ENSMUST00000114473 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Atp2b3Q0VF55 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Atp2b3Q0VF55 Tigd2-201ENSMUST00000062626 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Atp2b3Q0VF55 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Atp2b3Q0VF55 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Atp2b3Q0VF55 Mir874-201ENSMUST00000104769 76 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Atp2b3Q0VF55 Ypel3-202ENSMUST00000106356 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Atp2b3Q0VF55 Prr13-204ENSMUST00000164957 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Atp2b3Q0VF55 Gm17208-201ENSMUST00000168388 535 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Atp2b3Q0VF55 1700113H08Rik-202ENSMUST00000189456 974 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Atp2b3Q0VF55 Il15-202ENSMUST00000209363 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Atp2b3Q0VF55 AC160029.2-201ENSMUST00000218285 548 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Atp2b3Q0VF55 AC154462.2-201ENSMUST00000227519 370 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Atp2b3Q0VF55 Dmkn-201ENSMUST00000041703 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Atp2b3Q0VF55 Dnal4-202ENSMUST00000069877 1011 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Atp2b3Q0VF55 Olfr1423-201ENSMUST00000087831 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Atp2b3Q0VF55 Chml-201ENSMUST00000104984 6905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Atp2b3Q0VF55 Chml-202ENSMUST00000209720 6905 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Atp2b3Q0VF55 Gm5989-201ENSMUST00000096092 2077 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Atp2b3Q0VF55 Ctdspl2-204ENSMUST00000110578 3386 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Atp2b3Q0VF55 Ralgds-202ENSMUST00000100241 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Atp2b3Q0VF55 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Atp2b3Q0VF55 A530072M11Rik-201ENSMUST00000151122 1852 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Atp2b3Q0VF55 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Atp2b3Q0VF55 Armcx1-206ENSMUST00000113201 2228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Atp2b3Q0VF55 Sp6-202ENSMUST00000107622 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Atp2b3Q0VF55 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Atp2b3Q0VF55 Ablim2-209ENSMUST00000129347 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Atp2b3Q0VF55 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Atp2b3Q0VF55 Pkp3-201ENSMUST00000066873 2848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Atp2b3Q0VF55 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Atp2b3Q0VF55 Dido1-207ENSMUST00000130986 4898 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Atp2b3Q0VF55 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Atp2b3Q0VF55 Crx-203ENSMUST00000172758 1469 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Atp2b3Q0VF55 BB123696-201ENSMUST00000222580 2056 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Atp2b3Q0VF55 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.5 ms