Protein–RNA interactions for Protein: Q0VE29

Samd12, Sterile alpha motif domain-containing protein 12, mousemouse

Predictions only

Length 161 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samd12Q0VE29 Plekhg5-204ENSMUST00000118648 3818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Samd12Q0VE29 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Samd12Q0VE29 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Samd12Q0VE29 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Samd12Q0VE29 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Samd12Q0VE29 Atic-201ENSMUST00000027384 2845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Samd12Q0VE29 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Samd12Q0VE29 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Samd12Q0VE29 Anp32e-204ENSMUST00000168106 2890 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Samd12Q0VE29 Spred2-201ENSMUST00000093298 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Samd12Q0VE29 Pdyn-201ENSMUST00000028883 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Samd12Q0VE29 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Samd12Q0VE29 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Samd12Q0VE29 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Samd12Q0VE29 Ppfia4-205ENSMUST00000189361 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Samd12Q0VE29 Nup205-204ENSMUST00000201374 6411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Samd12Q0VE29 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Samd12Q0VE29 Kcp-203ENSMUST00000101614 4885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Samd12Q0VE29 Parvg-201ENSMUST00000023074 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Samd12Q0VE29 Ppp6r3-202ENSMUST00000113997 4952 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Samd12Q0VE29 Cant1-203ENSMUST00000106287 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Samd12Q0VE29 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Samd12Q0VE29 Gm16278-201ENSMUST00000148064 2071 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Samd12Q0VE29 Kirrel2-201ENSMUST00000045817 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Samd12Q0VE29 Sema3f-201ENSMUST00000080560 3395 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Samd12Q0VE29 Zfp941-201ENSMUST00000080651 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Samd12Q0VE29 Mbd1-202ENSMUST00000224047 2838 ntAPPRIS P1 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Samd12Q0VE29 Bcl2l14-201ENSMUST00000032321 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Samd12Q0VE29 Tgfbr1-202ENSMUST00000044234 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Samd12Q0VE29 Phyhipl-201ENSMUST00000046513 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Samd12Q0VE29 Zbtb24-205ENSMUST00000216656 2476 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Samd12Q0VE29 Wwtr1-201ENSMUST00000029380 4697 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Samd12Q0VE29 Tnn-202ENSMUST00000131919 3987 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Samd12Q0VE29 Rbm39-217ENSMUST00000146297 2580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Samd12Q0VE29 Klhl29-202ENSMUST00000218384 2716 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Samd12Q0VE29 Qpctl-201ENSMUST00000032566 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Samd12Q0VE29 Stra6-202ENSMUST00000085677 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Samd12Q0VE29 Slc30a3-206ENSMUST00000202740 1989 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Samd12Q0VE29 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Samd12Q0VE29 Adam11-202ENSMUST00000103081 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Samd12Q0VE29 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Samd12Q0VE29 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Samd12Q0VE29 Pfkfb3-204ENSMUST00000114844 2107 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Samd12Q0VE29 Gm15966-201ENSMUST00000136853 480 ntTSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Samd12Q0VE29 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Samd12Q0VE29 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Samd12Q0VE29 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Samd12Q0VE29 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Samd12Q0VE29 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Samd12Q0VE29 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Samd12Q0VE29 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Samd12Q0VE29 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Samd12Q0VE29 Rab14-201ENSMUST00000028238 3081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Samd12Q0VE29 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Samd12Q0VE29 2610037D02Rik-201ENSMUST00000180852 2449 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Samd12Q0VE29 Olfr1344-202ENSMUST00000218906 2590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Samd12Q0VE29 Zc3h18-205ENSMUST00000176629 3672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Samd12Q0VE29 4833420G17Rik-204ENSMUST00000225186 2627 ntAPPRIS P1 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Samd12Q0VE29 Spata20-201ENSMUST00000041705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Samd12Q0VE29 Flrt1-201ENSMUST00000113383 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Samd12Q0VE29 Gm17189-201ENSMUST00000163707 1630 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Samd12Q0VE29 Lrrfip1-202ENSMUST00000068167 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Samd12Q0VE29 Wdr89-201ENSMUST00000062370 2979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Samd12Q0VE29 Mical1-202ENSMUST00000099934 3292 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Samd12Q0VE29 1110051M20Rik-203ENSMUST00000102594 1977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Samd12Q0VE29 Psd2-201ENSMUST00000115716 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Samd12Q0VE29 Smim1-208ENSMUST00000143047 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Samd12Q0VE29 Ddx17-201ENSMUST00000054014 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Samd12Q0VE29 Eya1-202ENSMUST00000080664 3426 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Samd12Q0VE29 Tubd1-201ENSMUST00000020821 2070 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Samd12Q0VE29 Pex26-202ENSMUST00000118234 3778 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Samd12Q0VE29 Slc7a6-201ENSMUST00000034378 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Samd12Q0VE29 Tram1l1-201ENSMUST00000058994 3889 ntAPPRIS P1 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Samd12Q0VE29 Ticam2-201ENSMUST00000070084 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Samd12Q0VE29 Atg7-212ENSMUST00000182902 2543 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Samd12Q0VE29 Pmaip1-201ENSMUST00000025399 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Samd12Q0VE29 Palm-204ENSMUST00000218631 2725 ntTSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Samd12Q0VE29 Mindy1-202ENSMUST00000107187 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Samd12Q0VE29 Cmklr1-201ENSMUST00000047936 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Samd12Q0VE29 Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Samd12Q0VE29 Tax1bp1-201ENSMUST00000080723 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Samd12Q0VE29 Npr2-202ENSMUST00000107874 3480 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Samd12Q0VE29 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Samd12Q0VE29 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Samd12Q0VE29 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Samd12Q0VE29 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Samd12Q0VE29 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Samd12Q0VE29 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Samd12Q0VE29 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Samd12Q0VE29 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Samd12Q0VE29 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Samd12Q0VE29 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Samd12Q0VE29 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Samd12Q0VE29 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Samd12Q0VE29 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Samd12Q0VE29 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Samd12Q0VE29 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Samd12Q0VE29 AC138604.1-201ENSMUST00000226969 739 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Samd12Q0VE29 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Samd12Q0VE29 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.9 ms