Protein–RNA interactions for Protein: Q0P5W1

Vps8, Vacuolar protein sorting-associated protein 8 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,427 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps8Q0P5W1 Gm14809-201ENSMUST00000152025 695 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Vps8Q0P5W1 Nme9-202ENSMUST00000163199 1196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Vps8Q0P5W1 Gm39185-201ENSMUST00000212941 540 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Vps8Q0P5W1 H2-Oa-201ENSMUST00000025192 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Vps8Q0P5W1 Prss39-201ENSMUST00000027299 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Vps8Q0P5W1 Gpc2-205ENSMUST00000161827 2586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Vps8Q0P5W1 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Vps8Q0P5W1 Cab39-201ENSMUST00000097666 2369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Vps8Q0P5W1 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Vps8Q0P5W1 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Vps8Q0P5W1 Hrg-201ENSMUST00000023590 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Vps8Q0P5W1 Tcf4-249ENSMUST00000202435 2427 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Vps8Q0P5W1 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Vps8Q0P5W1 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Vps8Q0P5W1 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Vps8Q0P5W1 4931414P19Rik-201ENSMUST00000022786 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Vps8Q0P5W1 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Vps8Q0P5W1 Adam32-202ENSMUST00000121438 2450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Vps8Q0P5W1 Ccdc28b-202ENSMUST00000106035 821 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Vps8Q0P5W1 Apoc1-202ENSMUST00000108451 532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Vps8Q0P5W1 Tmem255b-202ENSMUST00000167505 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Vps8Q0P5W1 1700040D17Rik-201ENSMUST00000181305 998 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Vps8Q0P5W1 Dmrt1i-203ENSMUST00000197311 718 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Vps8Q0P5W1 Gm43138-201ENSMUST00000199123 708 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Vps8Q0P5W1 Gm815-201ENSMUST00000099536 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Vps8Q0P5W1 Laptm5-207ENSMUST00000151698 2600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Vps8Q0P5W1 Nrf1-210ENSMUST00000115211 3295 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Vps8Q0P5W1 Slc25a15-201ENSMUST00000033871 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Vps8Q0P5W1 Spats2l-203ENSMUST00000164302 2088 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Vps8Q0P5W1 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Vps8Q0P5W1 Gm3693-201ENSMUST00000182077 2865 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Vps8Q0P5W1 Odf3-202ENSMUST00000106049 1509 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Vps8Q0P5W1 Spock1-206ENSMUST00000189373 3128 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Vps8Q0P5W1 Adi1-201ENSMUST00000020957 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Vps8Q0P5W1 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Vps8Q0P5W1 Phldb1-213ENSMUST00000144251 3589 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Vps8Q0P5W1 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Vps8Q0P5W1 Gm26551-201ENSMUST00000181262 2432 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Vps8Q0P5W1 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Vps8Q0P5W1 Prr15l-201ENSMUST00000054311 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Vps8Q0P5W1 Fam131b-202ENSMUST00000095974 3992 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Vps8Q0P5W1 Plcd3-201ENSMUST00000103077 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Vps8Q0P5W1 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Vps8Q0P5W1 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Vps8Q0P5W1 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Vps8Q0P5W1 Gm6370-201ENSMUST00000110611 1142 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Vps8Q0P5W1 Fam155a-201ENSMUST00000110969 3388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Vps8Q0P5W1 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Vps8Q0P5W1 Mogat1-202ENSMUST00000113524 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Vps8Q0P5W1 Gm11930-201ENSMUST00000117788 190 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Vps8Q0P5W1 Gm15703-201ENSMUST00000120250 880 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Vps8Q0P5W1 Pkm-202ENSMUST00000163694 2041 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Vps8Q0P5W1 Gm6309-201ENSMUST00000174320 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Vps8Q0P5W1 1700030M09Rik-202ENSMUST00000181679 964 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Vps8Q0P5W1 Pfn1-201ENSMUST00000018437 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Vps8Q0P5W1 Aprt-203ENSMUST00000211823 590 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Vps8Q0P5W1 AC166095.1-201ENSMUST00000223731 1241 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Vps8Q0P5W1 Olfr368-201ENSMUST00000053990 985 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Vps8Q0P5W1 Tnfrsf22-203ENSMUST00000146692 2298 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Vps8Q0P5W1 Gm16168-201ENSMUST00000161091 1359 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Vps8Q0P5W1 Ccdc25-201ENSMUST00000022614 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Vps8Q0P5W1 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Vps8Q0P5W1 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Vps8Q0P5W1 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Vps8Q0P5W1 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Vps8Q0P5W1 Pipox-201ENSMUST00000017597 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Vps8Q0P5W1 Gm5422-202ENSMUST00000216161 2928 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Vps8Q0P5W1 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Vps8Q0P5W1 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Vps8Q0P5W1 B430212C06Rik-205ENSMUST00000145081 2623 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Vps8Q0P5W1 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Vps8Q0P5W1 Pla2g10-202ENSMUST00000115807 964 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Vps8Q0P5W1 Gm14109-201ENSMUST00000118814 309 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Vps8Q0P5W1 Gm11961-202ENSMUST00000141157 760 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Vps8Q0P5W1 Gm11630-201ENSMUST00000152825 382 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Vps8Q0P5W1 Cmtm1-201ENSMUST00000159039 1130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Vps8Q0P5W1 Olfr686-201ENSMUST00000050157 1018 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Vps8Q0P5W1 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Vps8Q0P5W1 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Vps8Q0P5W1 Zfp207-206ENSMUST00000165565 2311 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Vps8Q0P5W1 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Vps8Q0P5W1 Acp5-203ENSMUST00000165735 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Vps8Q0P5W1 Fam219a-202ENSMUST00000108050 3321 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Vps8Q0P5W1 Micalcl-201ENSMUST00000033033 2259 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Vps8Q0P5W1 Cd300lf-202ENSMUST00000106561 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Vps8Q0P5W1 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Vps8Q0P5W1 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Vps8Q0P5W1 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Vps8Q0P5W1 Xrra1-202ENSMUST00000207855 1334 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Vps8Q0P5W1 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Vps8Q0P5W1 Cutal-201ENSMUST00000028228 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Vps8Q0P5W1 Gm10544-202ENSMUST00000181887 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Vps8Q0P5W1 Marco-201ENSMUST00000027639 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Vps8Q0P5W1 Cdk5rap3-201ENSMUST00000103152 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Vps8Q0P5W1 Lrrc30-201ENSMUST00000097290 1759 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Vps8Q0P5W1 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Vps8Q0P5W1 Blvrb-202ENSMUST00000108357 782 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Vps8Q0P5W1 Prox1os-201ENSMUST00000110279 828 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Vps8Q0P5W1 Gm16099-202ENSMUST00000151873 660 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Vps8Q0P5W1 Adtrp-204ENSMUST00000179758 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 112 ms