Protein–RNA interactions for Protein: Q0KL02

Trio, Triple functional domain protein, mousemouse

Predictions only

Length 3,102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TrioQ0KL02 Apoe-210ENSMUST00000174710 514 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
TrioQ0KL02 Gadd45a-206ENSMUST00000204282 460 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
TrioQ0KL02 Gm40983-201ENSMUST00000222524 502 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
TrioQ0KL02 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
TrioQ0KL02 Gm3287-205ENSMUST00000228893 1332 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
TrioQ0KL02 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
TrioQ0KL02 Cluap1-201ENSMUST00000040881 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
TrioQ0KL02 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
TrioQ0KL02 Cpq-207ENSMUST00000228916 1842 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.33
TrioQ0KL02 4930453L07Rik-201ENSMUST00000209053 1439 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
TrioQ0KL02 Espn-213ENSMUST00000105659 3595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
TrioQ0KL02 Hnf1b-202ENSMUST00000108113 2376 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
TrioQ0KL02 Usp10-210ENSMUST00000144458 3726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
TrioQ0KL02 Bpifb6-201ENSMUST00000088955 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
TrioQ0KL02 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
TrioQ0KL02 Gm11851-201ENSMUST00000132219 692 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
TrioQ0KL02 4930483J18Rik-202ENSMUST00000138715 1093 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
TrioQ0KL02 Gm16271-201ENSMUST00000162837 220 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
TrioQ0KL02 Gm29539-201ENSMUST00000188031 758 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
TrioQ0KL02 Gm25201-201ENSMUST00000083093 170 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
TrioQ0KL02 Zfp108-201ENSMUST00000072713 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
TrioQ0KL02 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
TrioQ0KL02 Ttc4-201ENSMUST00000026480 2121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
TrioQ0KL02 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
TrioQ0KL02 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
TrioQ0KL02 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
TrioQ0KL02 Gm16081-201ENSMUST00000155992 684 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
TrioQ0KL02 Gm6430-201ENSMUST00000054664 1248 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
TrioQ0KL02 Orc4-202ENSMUST00000090976 1153 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
TrioQ0KL02 Olfr139-204ENSMUST00000214111 1311 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
TrioQ0KL02 Fgfr3-211ENSMUST00000171509 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
TrioQ0KL02 Dppa4-201ENSMUST00000050705 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
TrioQ0KL02 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
TrioQ0KL02 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
TrioQ0KL02 Sp100-213ENSMUST00000155094 1666 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
TrioQ0KL02 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
TrioQ0KL02 Plcxd3-201ENSMUST00000061925 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
TrioQ0KL02 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
TrioQ0KL02 Gm15523-201ENSMUST00000160463 439 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
TrioQ0KL02 Rwdd2a-202ENSMUST00000179212 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
TrioQ0KL02 Gm17827-201ENSMUST00000211825 742 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
TrioQ0KL02 Gm3898-202ENSMUST00000216905 328 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
TrioQ0KL02 Ngdn-201ENSMUST00000022815 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
TrioQ0KL02 AC108416.1-202ENSMUST00000228927 1201 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
TrioQ0KL02 Them5-201ENSMUST00000029794 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
TrioQ0KL02 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
TrioQ0KL02 Spert-202ENSMUST00000164082 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
TrioQ0KL02 Ms4a15-201ENSMUST00000087923 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
TrioQ0KL02 Usf1-207ENSMUST00000160486 1878 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
TrioQ0KL02 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
TrioQ0KL02 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
TrioQ0KL02 Mansc1-201ENSMUST00000047443 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
TrioQ0KL02 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
TrioQ0KL02 Tspan13-201ENSMUST00000020896 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
TrioQ0KL02 Slc6a9-210ENSMUST00000169885 1876 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
TrioQ0KL02 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
TrioQ0KL02 Gm1848-201ENSMUST00000120711 789 ntBASIC13□□□□□ -0.33
TrioQ0KL02 Gm13830-203ENSMUST00000148916 247 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
TrioQ0KL02 1110038B12Rik-208ENSMUST00000174714 520 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
TrioQ0KL02 S100a3-205ENSMUST00000200508 587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
TrioQ0KL02 Gm45500-201ENSMUST00000211676 803 ntBASIC13□□□□□ -0.33
TrioQ0KL02 CT030135.2-201ENSMUST00000225255 893 ntBASIC13□□□□□ -0.33
TrioQ0KL02 Asb9-201ENSMUST00000033756 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
TrioQ0KL02 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
TrioQ0KL02 Slc25a25-205ENSMUST00000113310 3278 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
TrioQ0KL02 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
TrioQ0KL02 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
TrioQ0KL02 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
TrioQ0KL02 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
TrioQ0KL02 Anxa4-202ENSMUST00000113675 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
TrioQ0KL02 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
TrioQ0KL02 Thap1-201ENSMUST00000036807 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
TrioQ0KL02 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
TrioQ0KL02 1700012D14Rik-204ENSMUST00000210788 547 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
TrioQ0KL02 Gm2517-201ENSMUST00000215651 348 ntBASIC13□□□□□ -0.33
TrioQ0KL02 Try10-201ENSMUST00000072103 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
TrioQ0KL02 Gm10544-202ENSMUST00000181887 1923 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
TrioQ0KL02 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
TrioQ0KL02 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
TrioQ0KL02 Gm36266-201ENSMUST00000196660 1749 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
TrioQ0KL02 Gm42863-201ENSMUST00000197875 2958 ntBASIC13□□□□□ -0.33
TrioQ0KL02 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
TrioQ0KL02 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
TrioQ0KL02 Adck1-202ENSMUST00000166940 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
TrioQ0KL02 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
TrioQ0KL02 Fank1-201ENSMUST00000065359 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
TrioQ0KL02 Rhot1-204ENSMUST00000092857 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
TrioQ0KL02 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
TrioQ0KL02 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
TrioQ0KL02 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
TrioQ0KL02 5530401A14Rik-201ENSMUST00000021044 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
TrioQ0KL02 Gm26651-201ENSMUST00000181851 2325 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
TrioQ0KL02 Mup-ps26-201ENSMUST00000121751 202 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
TrioQ0KL02 Gm25604-201ENSMUST00000158359 133 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
TrioQ0KL02 Rpl41-206ENSMUST00000177163 544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
TrioQ0KL02 AA545190-201ENSMUST00000203495 1053 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
TrioQ0KL02 Fcer2a-206ENSMUST00000208438 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
TrioQ0KL02 Fcer2a-208ENSMUST00000208603 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
TrioQ0KL02 Gm20683-201ENSMUST00000176751 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
TrioQ0KL02 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.5 ms