Protein–RNA interactions for Protein: Q0KL01

Ubxn2b, UBX domain-containing protein 2B, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn2bQ0KL01 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ubxn2bQ0KL01 Gm26013-201ENSMUST00000104404 119 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Ubxn2bQ0KL01 Timm10b-204ENSMUST00000106784 494 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ubxn2bQ0KL01 Smim11-202ENSMUST00000118064 782 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ubxn2bQ0KL01 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ubxn2bQ0KL01 Gm3948-201ENSMUST00000147795 421 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ubxn2bQ0KL01 Gm11630-201ENSMUST00000152825 382 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ubxn2bQ0KL01 Gm37695-201ENSMUST00000191765 530 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ubxn2bQ0KL01 Olfr431-ps1-201ENSMUST00000192435 544 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Ubxn2bQ0KL01 Gm37859-201ENSMUST00000195529 2173 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Ubxn2bQ0KL01 Gm36266-201ENSMUST00000196660 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ubxn2bQ0KL01 D5Ertd615e-203ENSMUST00000198493 1032 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ubxn2bQ0KL01 Gm43001-201ENSMUST00000198925 603 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ubxn2bQ0KL01 AC124752.1-201ENSMUST00000222131 776 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ubxn2bQ0KL01 CT030653.1-201ENSMUST00000224382 1279 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Ubxn2bQ0KL01 AC125209.1-201ENSMUST00000225812 766 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Ubxn2bQ0KL01 Lgi3-203ENSMUST00000226548 1001 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Ubxn2bQ0KL01 Fetub-201ENSMUST00000023587 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ubxn2bQ0KL01 Pla2g1b-201ENSMUST00000031495 557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ubxn2bQ0KL01 Gm9785-201ENSMUST00000062642 1006 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Ubxn2bQ0KL01 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ubxn2bQ0KL01 Gm26448-201ENSMUST00000082446 203 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Ubxn2bQ0KL01 Gm10288-201ENSMUST00000084614 537 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Ubxn2bQ0KL01 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ubxn2bQ0KL01 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ubxn2bQ0KL01 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ubxn2bQ0KL01 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ubxn2bQ0KL01 5033406O09Rik-201ENSMUST00000221314 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ubxn2bQ0KL01 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ubxn2bQ0KL01 Pnp2-201ENSMUST00000095925 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ubxn2bQ0KL01 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ubxn2bQ0KL01 Snrpn-201ENSMUST00000059305 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ubxn2bQ0KL01 Bop1-201ENSMUST00000023217 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ubxn2bQ0KL01 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Ubxn2bQ0KL01 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ubxn2bQ0KL01 Etv1-205ENSMUST00000160856 1474 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ubxn2bQ0KL01 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ubxn2bQ0KL01 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ubxn2bQ0KL01 Gm18626-201ENSMUST00000221512 1409 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Ubxn2bQ0KL01 Rpl23-201ENSMUST00000103146 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ubxn2bQ0KL01 Ntm-202ENSMUST00000115236 1072 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ubxn2bQ0KL01 Gm11949-201ENSMUST00000117640 372 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Ubxn2bQ0KL01 Gm13558-201ENSMUST00000140464 554 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ubxn2bQ0KL01 Gm13008-201ENSMUST00000142289 507 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ubxn2bQ0KL01 Gm9116-201ENSMUST00000192400 1018 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Ubxn2bQ0KL01 Gm45781-201ENSMUST00000212860 539 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ubxn2bQ0KL01 AC168279.1-201ENSMUST00000214611 382 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Ubxn2bQ0KL01 Gm40578-201ENSMUST00000220837 390 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ubxn2bQ0KL01 Bloc1s1-201ENSMUST00000026405 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ubxn2bQ0KL01 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ubxn2bQ0KL01 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ubxn2bQ0KL01 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ubxn2bQ0KL01 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ubxn2bQ0KL01 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ubxn2bQ0KL01 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ubxn2bQ0KL01 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ubxn2bQ0KL01 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ubxn2bQ0KL01 Ccdc90b-202ENSMUST00000085017 1494 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ubxn2bQ0KL01 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ubxn2bQ0KL01 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ubxn2bQ0KL01 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ubxn2bQ0KL01 Cpq-207ENSMUST00000228916 1842 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ubxn2bQ0KL01 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ubxn2bQ0KL01 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ubxn2bQ0KL01 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ubxn2bQ0KL01 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ubxn2bQ0KL01 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ubxn2bQ0KL01 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ubxn2bQ0KL01 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ubxn2bQ0KL01 Trav11-201ENSMUST00000103585 343 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ubxn2bQ0KL01 Trav11d-201ENSMUST00000103648 342 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ubxn2bQ0KL01 Gm25063-201ENSMUST00000104666 94 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Ubxn2bQ0KL01 Gosr2-202ENSMUST00000107013 1044 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ubxn2bQ0KL01 Mapkapk5-203ENSMUST00000111782 969 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ubxn2bQ0KL01 Dmrtc1a-204ENSMUST00000121197 1067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ubxn2bQ0KL01 Msrb3-202ENSMUST00000130950 561 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ubxn2bQ0KL01 Mc5r-201ENSMUST00000172148 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ubxn2bQ0KL01 Gm18201-201ENSMUST00000174735 875 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Ubxn2bQ0KL01 6430590A07Rik-201ENSMUST00000181813 1032 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ubxn2bQ0KL01 Zfp229-206ENSMUST00000183192 653 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ubxn2bQ0KL01 Gm5100-201ENSMUST00000195631 589 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Ubxn2bQ0KL01 Trav11n-201ENSMUST00000200113 343 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Ubxn2bQ0KL01 8030455M16Rik-201ENSMUST00000213014 902 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ubxn2bQ0KL01 AC115122.1-201ENSMUST00000224850 1040 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Ubxn2bQ0KL01 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ubxn2bQ0KL01 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ubxn2bQ0KL01 Oprm1-211ENSMUST00000105602 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ubxn2bQ0KL01 Il1f5-205ENSMUST00000147885 1392 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ubxn2bQ0KL01 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ubxn2bQ0KL01 Sec14l5-201ENSMUST00000165810 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ubxn2bQ0KL01 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ubxn2bQ0KL01 Gm16278-201ENSMUST00000148064 2071 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ubxn2bQ0KL01 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Ubxn2bQ0KL01 Acoxl-202ENSMUST00000110344 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ubxn2bQ0KL01 Kcnab2-203ENSMUST00000159186 1552 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ubxn2bQ0KL01 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ubxn2bQ0KL01 Max-201ENSMUST00000082136 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ubxn2bQ0KL01 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ubxn2bQ0KL01 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ubxn2bQ0KL01 Kars-201ENSMUST00000034426 2008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.5 ms