Protein–RNA interactions for Protein: Q08423

Tff1, Trefoil factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 87 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tff1Q08423 AI597479-201ENSMUST00000010434 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Tff1Q08423 Tlr9-201ENSMUST00000062241 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Tff1Q08423 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Tff1Q08423 Epm2aip1-201ENSMUST00000060711 7149 ntAPPRIS P1 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Tff1Q08423 C77080-203ENSMUST00000106051 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Tff1Q08423 C77080-202ENSMUST00000097873 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Tff1Q08423 Hdac11-201ENSMUST00000041736 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Tff1Q08423 Mapt-204ENSMUST00000106992 5253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Tff1Q08423 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Tff1Q08423 Ripor3-201ENSMUST00000099073 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Tff1Q08423 Pphln1-202ENSMUST00000068457 3816 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Tff1Q08423 Myadm-203ENSMUST00000203328 1899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Tff1Q08423 Irf1-202ENSMUST00000108920 2137 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Tff1Q08423 Dnajc16-201ENSMUST00000038014 5969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Tff1Q08423 Cad-201ENSMUST00000013773 7137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Tff1Q08423 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Tff1Q08423 Cant1-203ENSMUST00000106287 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Tff1Q08423 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Tff1Q08423 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Tff1Q08423 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Tff1Q08423 Ttyh1-202ENSMUST00000079415 2882 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Tff1Q08423 Atp2b2-203ENSMUST00000101045 8877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Tff1Q08423 Gm26770-201ENSMUST00000180586 2237 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Tff1Q08423 Sipa1l2-204ENSMUST00000212987 6690 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Tff1Q08423 Rfc2-201ENSMUST00000023867 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Tff1Q08423 Pprc1-201ENSMUST00000062322 5205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Tff1Q08423 BB123696-201ENSMUST00000222580 2056 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Tff1Q08423 Rusc1-201ENSMUST00000052539 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Tff1Q08423 Rnft2-202ENSMUST00000121369 4431 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Tff1Q08423 Shisa9-202ENSMUST00000170672 3421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Tff1Q08423 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Tff1Q08423 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Tff1Q08423 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Tff1Q08423 Vash2-201ENSMUST00000047409 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Tff1Q08423 Dnm1-202ENSMUST00000091089 3764 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Tff1Q08423 Nsun7-204ENSMUST00000202994 3632 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Tff1Q08423 Dysf-210ENSMUST00000153860 6525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Tff1Q08423 Ccdc22-201ENSMUST00000033483 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Tff1Q08423 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Tff1Q08423 Cox16-202ENSMUST00000110340 668 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Tff1Q08423 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Tff1Q08423 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Tff1Q08423 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Tff1Q08423 Gm833-201ENSMUST00000143133 884 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Tff1Q08423 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Tff1Q08423 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Tff1Q08423 Olfr455-201ENSMUST00000171307 954 ntAPPRIS P1 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Tff1Q08423 Gm9002-201ENSMUST00000178437 499 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Tff1Q08423 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Tff1Q08423 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Tff1Q08423 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Tff1Q08423 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Tff1Q08423 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Tff1Q08423 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Tff1Q08423 Aoc2-202ENSMUST00000107264 2230 ntTSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Tff1Q08423 Rbm14-201ENSMUST00000006625 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Tff1Q08423 Add2-202ENSMUST00000203196 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Tff1Q08423 Eif2ak1-201ENSMUST00000100487 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Tff1Q08423 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Tff1Q08423 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Tff1Q08423 Phldb1-218ENSMUST00000156918 3485 ntTSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Tff1Q08423 Gm15684-201ENSMUST00000160605 1814 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Tff1Q08423 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Tff1Q08423 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Tff1Q08423 Ska1-202ENSMUST00000177604 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Tff1Q08423 Nars-201ENSMUST00000025483 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Tff1Q08423 Map3k12-201ENSMUST00000023812 5182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Tff1Q08423 Ifi47-201ENSMUST00000046704 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Tff1Q08423 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Tff1Q08423 Syde2-203ENSMUST00000200546 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Tff1Q08423 Ncln-201ENSMUST00000020463 3118 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Tff1Q08423 Top2b-201ENSMUST00000017629 10335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Tff1Q08423 Vsx1-201ENSMUST00000046095 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Tff1Q08423 Rapgef2-201ENSMUST00000118100 6573 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Tff1Q08423 Kcp-203ENSMUST00000101614 4885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Tff1Q08423 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Tff1Q08423 Plekhg2-202ENSMUST00000119990 4880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Tff1Q08423 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Tff1Q08423 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Tff1Q08423 Cd80-201ENSMUST00000099816 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Tff1Q08423 Gm12960-201ENSMUST00000120017 1066 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Tff1Q08423 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Tff1Q08423 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Tff1Q08423 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Tff1Q08423 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Tff1Q08423 Dnpep-203ENSMUST00000185419 2833 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Tff1Q08423 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Tff1Q08423 Dst-213ENSMUST00000183302 8788 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Tff1Q08423 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Tff1Q08423 Enpp5-203ENSMUST00000154166 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Tff1Q08423 Mtus2-203ENSMUST00000085558 7543 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Tff1Q08423 Vmn1r198-203ENSMUST00000226909 6259 ntAPPRIS P2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Tff1Q08423 Lmbr1-203ENSMUST00000196321 3422 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Tff1Q08423 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Tff1Q08423 Pcdhb22-202ENSMUST00000192409 6609 ntAPPRIS P1 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Tff1Q08423 Sgce-204ENSMUST00000115577 1776 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Tff1Q08423 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Tff1Q08423 Hps3-201ENSMUST00000012580 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Tff1Q08423 Wnt7b-201ENSMUST00000023015 3371 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Tff1Q08423 Sdf4-201ENSMUST00000050078 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.2 ms