Protein–RNA interactions for Protein: Q06986

Siah2, E3 ubiquitin-protein ligase SIAH2, mousemouse

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Siah2Q06986 Zfp942-201ENSMUST00000074295 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Siah2Q06986 Slitrk5-201ENSMUST00000042767 4831 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Siah2Q06986 Nfatc2-204ENSMUST00000109184 6828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Siah2Q06986 Tacr2-201ENSMUST00000020278 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Siah2Q06986 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Siah2Q06986 Stk32b-201ENSMUST00000094836 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Siah2Q06986 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Siah2Q06986 Smarcd2-203ENSMUST00000106843 2548 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Siah2Q06986 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Siah2Q06986 Gm45743-201ENSMUST00000212701 2795 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Siah2Q06986 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Siah2Q06986 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Siah2Q06986 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Siah2Q06986 Gm20121-201ENSMUST00000198547 1594 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Siah2Q06986 Dmtn-208ENSMUST00000228009 2643 ntAPPRIS P2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Siah2Q06986 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Siah2Q06986 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Siah2Q06986 Gm45832-201ENSMUST00000212762 1443 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Siah2Q06986 Pik3r6-201ENSMUST00000060441 3237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Siah2Q06986 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Siah2Q06986 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Siah2Q06986 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Siah2Q06986 Gm7350-201ENSMUST00000120964 636 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Siah2Q06986 Gm12670-201ENSMUST00000123606 576 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Siah2Q06986 Tnfrsf12a-202ENSMUST00000167059 858 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Siah2Q06986 1700003H04Rik-203ENSMUST00000178485 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Siah2Q06986 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Siah2Q06986 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Siah2Q06986 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Siah2Q06986 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Siah2Q06986 A930036I15Rik-201ENSMUST00000196018 1045 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Siah2Q06986 Gm43491-201ENSMUST00000197133 784 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Siah2Q06986 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Siah2Q06986 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Siah2Q06986 Olfr163-ps1-201ENSMUST00000205891 940 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Siah2Q06986 Gm31992-201ENSMUST00000213387 862 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Siah2Q06986 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Siah2Q06986 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Siah2Q06986 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Siah2Q06986 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Siah2Q06986 Cbx3-202ENSMUST00000094623 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Siah2Q06986 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Siah2Q06986 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Siah2Q06986 Mast4-207ENSMUST00000167058 10636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Siah2Q06986 Spib-201ENSMUST00000035323 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Siah2Q06986 Vrtn-201ENSMUST00000095551 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Siah2Q06986 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Siah2Q06986 Clec11a-201ENSMUST00000004587 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Siah2Q06986 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Siah2Q06986 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Siah2Q06986 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Siah2Q06986 Gm42975-201ENSMUST00000200612 1491 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Siah2Q06986 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Siah2Q06986 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Siah2Q06986 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Siah2Q06986 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Siah2Q06986 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Siah2Q06986 Gm28649-201ENSMUST00000189153 1581 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Siah2Q06986 Pcdhgb1-201ENSMUST00000192931 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Siah2Q06986 Pcdhga9-201ENSMUST00000091935 4724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Siah2Q06986 D630023F18Rik-201ENSMUST00000050047 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Siah2Q06986 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Siah2Q06986 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Siah2Q06986 Engase-202ENSMUST00000135383 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Siah2Q06986 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Siah2Q06986 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Siah2Q06986 Edrf1-202ENSMUST00000128901 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Siah2Q06986 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Siah2Q06986 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Siah2Q06986 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Siah2Q06986 Zfp341-202ENSMUST00000109702 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Siah2Q06986 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Siah2Q06986 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Siah2Q06986 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Siah2Q06986 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Siah2Q06986 Gm14975-201ENSMUST00000118741 664 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Siah2Q06986 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Siah2Q06986 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Siah2Q06986 1700057H21Rik-201ENSMUST00000152467 383 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Siah2Q06986 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Siah2Q06986 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Siah2Q06986 Gm8480-201ENSMUST00000190350 698 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Siah2Q06986 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Siah2Q06986 Psmc3ip-201ENSMUST00000019447 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Siah2Q06986 Gm43438-201ENSMUST00000198133 379 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Siah2Q06986 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Siah2Q06986 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Siah2Q06986 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Siah2Q06986 AC117949.2-201ENSMUST00000225900 584 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Siah2Q06986 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Siah2Q06986 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Siah2Q06986 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Siah2Q06986 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Siah2Q06986 Tcf4-210ENSMUST00000128706 2066 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Siah2Q06986 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Siah2Q06986 Rubcn-203ENSMUST00000115105 5255 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Siah2Q06986 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Siah2Q06986 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Siah2Q06986 Slc38a10-204ENSMUST00000103018 4578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Siah2Q06986 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.5 ms