Protein–RNA interactions for Protein: Q06649

Sh3bp2, SH3 domain-binding protein 2, mousemouse

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Length 559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp2Q06649 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
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Sh3bp2Q06649 Sgce-201ENSMUST00000004750 1703 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Sh3bp2Q06649 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Sh3bp2Q06649 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Sh3bp2Q06649 Pole3-201ENSMUST00000030091 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Sh3bp2Q06649 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Sh3bp2Q06649 Ano6-201ENSMUST00000071874 4927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Sh3bp2Q06649 Hvcn1-201ENSMUST00000072602 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Sh3bp2Q06649 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
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Sh3bp2Q06649 Gm13850-201ENSMUST00000140465 623 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Sh3bp2Q06649 U2af1l4-215ENSMUST00000166257 546 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
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Sh3bp2Q06649 Oit1-201ENSMUST00000022269 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
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Sh3bp2Q06649 Med27-201ENSMUST00000028139 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Sh3bp2Q06649 Cox7a2-201ENSMUST00000034881 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Sh3bp2Q06649 Otos-201ENSMUST00000053144 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Sh3bp2Q06649 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Sh3bp2Q06649 Gm9955-201ENSMUST00000067987 309 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Sh3bp2Q06649 Prss2-201ENSMUST00000070380 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Sh3bp2Q06649 Pgghg-201ENSMUST00000079403 2981 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Sh3bp2Q06649 Snora73a-201ENSMUST00000082453 205 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
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Sh3bp2Q06649 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
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Sh3bp2Q06649 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Sh3bp2Q06649 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Sh3bp2Q06649 Elp4-202ENSMUST00000122965 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Sh3bp2Q06649 Trim26-210ENSMUST00000179968 3203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Sh3bp2Q06649 Pglyrp2-202ENSMUST00000170392 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Sh3bp2Q06649 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Sh3bp2Q06649 Mpp3-204ENSMUST00000107168 3094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.23
Sh3bp2Q06649 Canx-201ENSMUST00000020637 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
Sh3bp2Q06649 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Sh3bp2Q06649 Dppa4-202ENSMUST00000096045 1534 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Sh3bp2Q06649 Adtrp-202ENSMUST00000121404 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Sh3bp2Q06649 Ube2a-201ENSMUST00000016452 1732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Sh3bp2Q06649 Klhdc7b-201ENSMUST00000166926 1818 ntAPPRIS P2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Sh3bp2Q06649 Cenpo-201ENSMUST00000020981 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Sh3bp2Q06649 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Sh3bp2Q06649 Gm853-201ENSMUST00000023884 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Sh3bp2Q06649 Zfp64-203ENSMUST00000109162 2848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Sh3bp2Q06649 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Sh3bp2Q06649 Phf13-201ENSMUST00000055688 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Sh3bp2Q06649 Gm43666-201ENSMUST00000197116 2989 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Sh3bp2Q06649 Aph1a-201ENSMUST00000015894 2863 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Sh3bp2Q06649 Flcn-202ENSMUST00000091246 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
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Sh3bp2Q06649 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
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Sh3bp2Q06649 Tnnt3-201ENSMUST00000074187 1007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
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Sh3bp2Q06649 Chfr-201ENSMUST00000014812 3146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
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Sh3bp2Q06649 Trp53i11-202ENSMUST00000111266 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
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Sh3bp2Q06649 Rcan2-202ENSMUST00000044895 3363 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Sh3bp2Q06649 Pex19-201ENSMUST00000075895 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Sh3bp2Q06649 Ppox-201ENSMUST00000073120 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Sh3bp2Q06649 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Sh3bp2Q06649 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Sh3bp2Q06649 Gart-201ENSMUST00000023684 3518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Sh3bp2Q06649 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Sh3bp2Q06649 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Sh3bp2Q06649 Exosc2-201ENSMUST00000038474 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Sh3bp2Q06649 Gm44775-201ENSMUST00000207266 1456 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Sh3bp2Q06649 Dnajb4-201ENSMUST00000029669 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Sh3bp2Q06649 B230344G16Rik-201ENSMUST00000180782 2024 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Sh3bp2Q06649 Ficd-201ENSMUST00000065698 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Sh3bp2Q06649 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Sh3bp2Q06649 Lrguk-202ENSMUST00000101564 967 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Sh3bp2Q06649 Gm16046-203ENSMUST00000150889 1001 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Sh3bp2Q06649 Gm25261-201ENSMUST00000157416 134 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Sh3bp2Q06649 Snora78-201ENSMUST00000158630 128 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
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