Protein–RNA interactions for Protein: Q06348

Prrx2, Paired mesoderm homeobox protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrx2Q06348 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Prrx2Q06348 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Prrx2Q06348 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Prrx2Q06348 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Prrx2Q06348 Rims1-205ENSMUST00000097811 6446 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Prrx2Q06348 Apoc1-202ENSMUST00000108451 532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Prrx2Q06348 Zfp157-203ENSMUST00000110912 886 ntTSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Prrx2Q06348 Gm13716-201ENSMUST00000126401 808 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Prrx2Q06348 Mcpt8-201ENSMUST00000015594 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Prrx2Q06348 Gm27023-201ENSMUST00000182372 285 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Prrx2Q06348 Gm28693-202ENSMUST00000190758 331 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Prrx2Q06348 Gm43378-201ENSMUST00000199336 582 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Prrx2Q06348 Ceacam1-209ENSMUST00000206687 1061 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Prrx2Q06348 Gm19963-201ENSMUST00000208413 1255 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Prrx2Q06348 Bet1l-207ENSMUST00000211527 298 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Prrx2Q06348 Mpzl2-205ENSMUST00000217097 1175 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Prrx2Q06348 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Prrx2Q06348 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Prrx2Q06348 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Prrx2Q06348 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Prrx2Q06348 Polr2a-202ENSMUST00000071213 5799 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Prrx2Q06348 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Prrx2Q06348 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Prrx2Q06348 Plxnb2-202ENSMUST00000109331 6377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Prrx2Q06348 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Prrx2Q06348 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Prrx2Q06348 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Prrx2Q06348 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Prrx2Q06348 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Prrx2Q06348 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Prrx2Q06348 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Prrx2Q06348 Kifc5c-ps-201ENSMUST00000179040 1530 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Prrx2Q06348 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Prrx2Q06348 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Prrx2Q06348 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Prrx2Q06348 Eif4ebp2-202ENSMUST00000167087 1422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Prrx2Q06348 Aamp-202ENSMUST00000178235 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Prrx2Q06348 Rtl6-201ENSMUST00000069476 4426 ntAPPRIS P1 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Prrx2Q06348 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Prrx2Q06348 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Prrx2Q06348 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Prrx2Q06348 Per1-206ENSMUST00000166748 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Prrx2Q06348 Slc25a22-202ENSMUST00000106006 2277 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Prrx2Q06348 Mettl17-201ENSMUST00000047899 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Prrx2Q06348 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Prrx2Q06348 E130114P18Rik-202ENSMUST00000107068 1132 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Prrx2Q06348 Rpl13-ps1-201ENSMUST00000121801 668 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Prrx2Q06348 Gm11985-201ENSMUST00000122910 1007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Prrx2Q06348 Egfl7-209ENSMUST00000150404 892 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Prrx2Q06348 Cox16-206ENSMUST00000168463 431 ntTSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Prrx2Q06348 Gm20457-201ENSMUST00000173374 682 ntTSL 3 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Prrx2Q06348 2810405F17Rik-201ENSMUST00000189334 1117 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Prrx2Q06348 AC122305.4-201ENSMUST00000216159 1206 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Prrx2Q06348 AC153974.2-201ENSMUST00000218577 1025 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Prrx2Q06348 Majin-201ENSMUST00000025699 1239 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Prrx2Q06348 Fam92b-201ENSMUST00000048786 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Prrx2Q06348 Tnni3-201ENSMUST00000098859 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Prrx2Q06348 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Prrx2Q06348 Mgat3-201ENSMUST00000044970 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Prrx2Q06348 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Prrx2Q06348 Gm10097-201ENSMUST00000180100 2784 ntAPPRIS P1 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Prrx2Q06348 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Prrx2Q06348 Diaph3-202ENSMUST00000168889 4582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Prrx2Q06348 Diaph3-201ENSMUST00000022599 4582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Prrx2Q06348 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Prrx2Q06348 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Prrx2Q06348 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Prrx2Q06348 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Prrx2Q06348 Asap1-217ENSMUST00000177371 6164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Prrx2Q06348 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Prrx2Q06348 Gm9947-201ENSMUST00000067599 2920 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Prrx2Q06348 9030407P20Rik-201ENSMUST00000180933 2310 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Prrx2Q06348 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Prrx2Q06348 Cyth2-208ENSMUST00000211783 1983 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Prrx2Q06348 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Prrx2Q06348 Gsdme-201ENSMUST00000031845 2502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Prrx2Q06348 Exosc2-201ENSMUST00000038474 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Prrx2Q06348 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Prrx2Q06348 Gm44089-201ENSMUST00000203624 1930 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Prrx2Q06348 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Prrx2Q06348 Nphp4-201ENSMUST00000056567 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Prrx2Q06348 Traf6-201ENSMUST00000004949 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Prrx2Q06348 Asxl1-205ENSMUST00000227428 6981 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Prrx2Q06348 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Prrx2Q06348 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Prrx2Q06348 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Prrx2Q06348 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Prrx2Q06348 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Prrx2Q06348 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Prrx2Q06348 Ncmap-202ENSMUST00000105857 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Prrx2Q06348 Tax1bp3-202ENSMUST00000108477 1153 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Prrx2Q06348 Gm11531-201ENSMUST00000117614 555 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Prrx2Q06348 Lamr1-ps1-201ENSMUST00000119759 874 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Prrx2Q06348 Gm12502-201ENSMUST00000120197 444 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Prrx2Q06348 Gm9083-201ENSMUST00000120423 819 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Prrx2Q06348 Rpsa-ps12-201ENSMUST00000120596 892 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Prrx2Q06348 Ggnbp1-202ENSMUST00000122106 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Prrx2Q06348 Gm15395-201ENSMUST00000153724 702 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Prrx2Q06348 Cmtm1-201ENSMUST00000159039 1130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Prrx2Q06348 1110038B12Rik-203ENSMUST00000173070 434 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.8 ms