Protein–RNA interactions for Protein: Q05020

Apoc2, Apolipoprotein C-II, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoc2Q05020 Crx-203ENSMUST00000172758 1469 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Apoc2Q05020 Commd1-201ENSMUST00000057843 1459 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Apoc2Q05020 Adam19-201ENSMUST00000011400 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Apoc2Q05020 Fam198a-203ENSMUST00000214536 2789 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Apoc2Q05020 Ugt1a6a-201ENSMUST00000014263 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Apoc2Q05020 Micalcl-201ENSMUST00000033033 2259 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Apoc2Q05020 Poc1b-203ENSMUST00000159228 1799 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Apoc2Q05020 Mogat2-201ENSMUST00000064231 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Apoc2Q05020 Tyk2-206ENSMUST00000216874 4828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Apoc2Q05020 Grm5-202ENSMUST00000125009 8047 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Apoc2Q05020 Hspa4l-201ENSMUST00000108086 2744 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Apoc2Q05020 1110032A03Rik-201ENSMUST00000042468 2082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Apoc2Q05020 Cox16-202ENSMUST00000110340 668 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Apoc2Q05020 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Apoc2Q05020 Gm13886-201ENSMUST00000117876 1183 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Apoc2Q05020 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Apoc2Q05020 Rab15-204ENSMUST00000122419 856 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Apoc2Q05020 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Apoc2Q05020 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Apoc2Q05020 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Apoc2Q05020 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Apoc2Q05020 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Apoc2Q05020 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Apoc2Q05020 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Apoc2Q05020 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Apoc2Q05020 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Apoc2Q05020 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Apoc2Q05020 Atp6v0c-ps1-201ENSMUST00000206596 463 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Apoc2Q05020 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Apoc2Q05020 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Apoc2Q05020 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Apoc2Q05020 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Apoc2Q05020 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Apoc2Q05020 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Apoc2Q05020 Mgll-207ENSMUST00000163271 3991 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Apoc2Q05020 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Apoc2Q05020 Nup98-201ENSMUST00000070165 4052 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Apoc2Q05020 Osbp2-203ENSMUST00000102950 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Apoc2Q05020 Adprhl1-205ENSMUST00000204916 5228 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Apoc2Q05020 Lmnb2-201ENSMUST00000057623 3531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Apoc2Q05020 Fosb-205ENSMUST00000208326 3654 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Apoc2Q05020 Pdcd6-203ENSMUST00000222759 1376 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Apoc2Q05020 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Apoc2Q05020 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC11.65□□□□□ -0.55
Apoc2Q05020 Tns2-202ENSMUST00000169627 4707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Apoc2Q05020 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Apoc2Q05020 Golga4-201ENSMUST00000084820 7583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Apoc2Q05020 Sncaip-209ENSMUST00000179625 2568 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Apoc2Q05020 Ptger4-202ENSMUST00000120563 3312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Apoc2Q05020 Padi2-201ENSMUST00000030765 4774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Apoc2Q05020 Epm2aip1-201ENSMUST00000060711 7149 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Apoc2Q05020 Dysf-210ENSMUST00000153860 6525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Apoc2Q05020 Nek3-202ENSMUST00000110730 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Apoc2Q05020 Pianp-207ENSMUST00000162170 2053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Apoc2Q05020 Sgce-204ENSMUST00000115577 1776 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Apoc2Q05020 4930444K16Rik-201ENSMUST00000220438 1767 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Apoc2Q05020 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Apoc2Q05020 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Apoc2Q05020 Xpo1-201ENSMUST00000020538 5145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Apoc2Q05020 Tfe3-204ENSMUST00000115677 2943 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Apoc2Q05020 Kif1a-202ENSMUST00000112958 5931 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Apoc2Q05020 Itfg2-203ENSMUST00000142615 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Apoc2Q05020 Cldn15-201ENSMUST00000001790 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Apoc2Q05020 Sema4a-202ENSMUST00000107531 2897 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Apoc2Q05020 Cdc7-203ENSMUST00000117196 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Apoc2Q05020 Trim29-201ENSMUST00000034511 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Apoc2Q05020 Sstr5-201ENSMUST00000051864 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Apoc2Q05020 Cpa1-201ENSMUST00000031806 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Apoc2Q05020 Gm42890-202ENSMUST00000167642 2566 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Apoc2Q05020 Rhobtb1-205ENSMUST00000164034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Apoc2Q05020 Thoc5-202ENSMUST00000101615 2116 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Apoc2Q05020 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Apoc2Q05020 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Apoc2Q05020 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Apoc2Q05020 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Apoc2Q05020 Met-202ENSMUST00000115442 4663 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Apoc2Q05020 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Apoc2Q05020 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Apoc2Q05020 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Apoc2Q05020 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Apoc2Q05020 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Apoc2Q05020 Dmrtc1c2-201ENSMUST00000087896 1255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Apoc2Q05020 Sorcs1-201ENSMUST00000072685 4396 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Apoc2Q05020 Aaas-201ENSMUST00000041208 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Apoc2Q05020 Lypla1-201ENSMUST00000027036 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Apoc2Q05020 Cyp27b1-201ENSMUST00000165764 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Apoc2Q05020 Fmo1-201ENSMUST00000046049 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Apoc2Q05020 Abcg5-201ENSMUST00000066175 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Apoc2Q05020 Gm26677-201ENSMUST00000180553 1672 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Apoc2Q05020 Uap1l1-201ENSMUST00000102925 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Apoc2Q05020 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Apoc2Q05020 Tmem201-203ENSMUST00000105687 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Apoc2Q05020 Nxph1-201ENSMUST00000060369 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Apoc2Q05020 Usp17le-201ENSMUST00000053464 1626 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Apoc2Q05020 Wdfy2-201ENSMUST00000014691 6646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Apoc2Q05020 Adora1-201ENSMUST00000038191 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Apoc2Q05020 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Apoc2Q05020 Rxfp3-201ENSMUST00000058007 4275 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Apoc2Q05020 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Apoc2Q05020 Gm9025-201ENSMUST00000122415 1575 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.9 ms