Protein–RNA interactions for Protein: Q04888

Sox10, Transcription factor SOX-10, mousemouse

Predictions only

Length 466 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox10Q04888 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sox10Q04888 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sox10Q04888 Gm16481-201ENSMUST00000119074 1227 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Sox10Q04888 Med9os-203ENSMUST00000146334 527 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sox10Q04888 2010310C07Rik-202ENSMUST00000190889 842 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sox10Q04888 Gm21057-202ENSMUST00000206111 512 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sox10Q04888 Arhgef33-207ENSMUST00000224966 490 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
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Sox10Q04888 Nmur1-201ENSMUST00000027440 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sox10Q04888 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sox10Q04888 Rpl34-202ENSMUST00000079085 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sox10Q04888 Gm11559-201ENSMUST00000092694 1096 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sox10Q04888 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sox10Q04888 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sox10Q04888 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sox10Q04888 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sox10Q04888 Bag6-203ENSMUST00000172571 3599 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sox10Q04888 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
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Sox10Q04888 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sox10Q04888 Olfr763-201ENSMUST00000077460 2523 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sox10Q04888 Poc1b-203ENSMUST00000159228 1799 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sox10Q04888 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sox10Q04888 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sox10Q04888 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sox10Q04888 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sox10Q04888 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
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Sox10Q04888 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sox10Q04888 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sox10Q04888 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sox10Q04888 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sox10Q04888 Aire-202ENSMUST00000105395 1630 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sox10Q04888 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sox10Q04888 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sox10Q04888 Gm11568-201ENSMUST00000107434 1145 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
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Sox10Q04888 Uox-202ENSMUST00000121133 768 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sox10Q04888 Nr2f1-203ENSMUST00000127137 991 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sox10Q04888 Tmem190-201ENSMUST00000013235 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sox10Q04888 Hmgn1-202ENSMUST00000133885 261 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sox10Q04888 3110056K07Rik-202ENSMUST00000136690 1063 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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Sox10Q04888 Smarcd2-203ENSMUST00000106843 2548 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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Sox10Q04888 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sox10Q04888 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sox10Q04888 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sox10Q04888 Ccnc-204ENSMUST00000120679 1453 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sox10Q04888 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sox10Q04888 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sox10Q04888 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sox10Q04888 Pax5-203ENSMUST00000107825 1445 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sox10Q04888 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sox10Q04888 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sox10Q04888 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sox10Q04888 Tufm-201ENSMUST00000098048 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sox10Q04888 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
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Sox10Q04888 Gm28590-201ENSMUST00000185679 1609 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sox10Q04888 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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Sox10Q04888 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sox10Q04888 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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Sox10Q04888 Pcbd2-202ENSMUST00000124968 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sox10Q04888 Egfl7-209ENSMUST00000150404 892 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sox10Q04888 Gm20416-201ENSMUST00000174760 484 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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Sox10Q04888 H2-Oa-201ENSMUST00000025192 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sox10Q04888 Olfr983-201ENSMUST00000050996 1050 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sox10Q04888 Nrf1-219ENSMUST00000167972 1541 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sox10Q04888 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sox10Q04888 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sox10Q04888 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sox10Q04888 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sox10Q04888 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sox10Q04888 Serpinb6d-201ENSMUST00000059637 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sox10Q04888 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sox10Q04888 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sox10Q04888 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sox10Q04888 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sox10Q04888 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sox10Q04888 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sox10Q04888 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sox10Q04888 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sox10Q04888 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sox10Q04888 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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