Protein–RNA interactions for Protein: Q02789

Cacna1s, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1S, mousemouse

Predictions only

Length 1,880 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna1sQ02789 2610005L07Rik-201ENSMUST00000139264 948 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Cacna1sQ02789 Gm13609-201ENSMUST00000141023 589 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cacna1sQ02789 Gm21092-201ENSMUST00000178995 955 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Cacna1sQ02789 Gm2449-201ENSMUST00000180676 585 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cacna1sQ02789 Rpain-201ENSMUST00000018593 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cacna1sQ02789 Gm44329-201ENSMUST00000197469 112 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Cacna1sQ02789 AC159376.1-201ENSMUST00000218504 630 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Cacna1sQ02789 H1foo-201ENSMUST00000037831 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cacna1sQ02789 Gm17080-201ENSMUST00000087588 811 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cacna1sQ02789 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cacna1sQ02789 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cacna1sQ02789 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cacna1sQ02789 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cacna1sQ02789 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cacna1sQ02789 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cacna1sQ02789 Dusp14-201ENSMUST00000018792 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cacna1sQ02789 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cacna1sQ02789 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cacna1sQ02789 Slc6a21-201ENSMUST00000085364 1732 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cacna1sQ02789 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cacna1sQ02789 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cacna1sQ02789 Psap-204ENSMUST00000177779 2657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cacna1sQ02789 Psap-205ENSMUST00000179238 2657 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cacna1sQ02789 Psap-201ENSMUST00000004316 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cacna1sQ02789 Gprc5a-201ENSMUST00000050104 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cacna1sQ02789 AC127242.1-201ENSMUST00000222861 1464 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cacna1sQ02789 Ntpcr-202ENSMUST00000065135 1497 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cacna1sQ02789 Gm13830-203ENSMUST00000148916 247 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cacna1sQ02789 Gm15744-201ENSMUST00000161734 213 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
Cacna1sQ02789 4930535L15Rik-201ENSMUST00000175891 536 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cacna1sQ02789 Gm44270-201ENSMUST00000203084 1234 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
Cacna1sQ02789 1700011B04Rik-212ENSMUST00000223526 889 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cacna1sQ02789 Eny2-204ENSMUST00000226827 558 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cacna1sQ02789 Npff-201ENSMUST00000023814 540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cacna1sQ02789 Dmrtc1c2-201ENSMUST00000087896 1255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cacna1sQ02789 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cacna1sQ02789 Alg14-201ENSMUST00000039442 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cacna1sQ02789 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cacna1sQ02789 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cacna1sQ02789 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cacna1sQ02789 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cacna1sQ02789 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cacna1sQ02789 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cacna1sQ02789 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cacna1sQ02789 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cacna1sQ02789 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cacna1sQ02789 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cacna1sQ02789 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cacna1sQ02789 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cacna1sQ02789 Mak-202ENSMUST00000070193 2937 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cacna1sQ02789 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cacna1sQ02789 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cacna1sQ02789 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cacna1sQ02789 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cacna1sQ02789 n-R5s64-201ENSMUST00000102019 119 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Cacna1sQ02789 Gm24891-201ENSMUST00000104391 136 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Cacna1sQ02789 Cenpx-203ENSMUST00000106154 873 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cacna1sQ02789 Gm12969-201ENSMUST00000120199 1004 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Cacna1sQ02789 Gm13263-201ENSMUST00000121271 838 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Cacna1sQ02789 Igf1-205ENSMUST00000121952 798 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cacna1sQ02789 Gm11354-201ENSMUST00000121974 422 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Cacna1sQ02789 Gm13523-201ENSMUST00000151820 488 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cacna1sQ02789 4930562C15Rik-202ENSMUST00000171105 1299 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cacna1sQ02789 Gm6408-201ENSMUST00000179032 1171 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cacna1sQ02789 Gm38228-201ENSMUST00000193169 1293 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Cacna1sQ02789 Isg20-206ENSMUST00000205981 834 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cacna1sQ02789 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cacna1sQ02789 Tff2-201ENSMUST00000024826 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cacna1sQ02789 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cacna1sQ02789 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cacna1sQ02789 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cacna1sQ02789 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cacna1sQ02789 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cacna1sQ02789 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cacna1sQ02789 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cacna1sQ02789 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cacna1sQ02789 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cacna1sQ02789 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cacna1sQ02789 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cacna1sQ02789 Usp17le-201ENSMUST00000053464 1626 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cacna1sQ02789 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cacna1sQ02789 Bbs4-201ENSMUST00000026265 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cacna1sQ02789 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cacna1sQ02789 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cacna1sQ02789 Prkcd-202ENSMUST00000112202 2005 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cacna1sQ02789 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cacna1sQ02789 Gm11422-201ENSMUST00000118925 1103 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Cacna1sQ02789 Gm26685-201ENSMUST00000181831 2023 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cacna1sQ02789 A630035G10Rik-202ENSMUST00000194468 1065 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cacna1sQ02789 Gm19009-201ENSMUST00000223072 823 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Cacna1sQ02789 AC140375.1-201ENSMUST00000225421 694 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Cacna1sQ02789 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cacna1sQ02789 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cacna1sQ02789 Pgpep1l-201ENSMUST00000032770 953 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cacna1sQ02789 Gm5544-201ENSMUST00000098828 891 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cacna1sQ02789 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cacna1sQ02789 Gm5989-201ENSMUST00000096092 2077 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Cacna1sQ02789 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cacna1sQ02789 Fen1-201ENSMUST00000025651 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cacna1sQ02789 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.5 ms