Protein–RNA interactions for Protein: Q01822

Hoxd1, Homeobox protein Hox-D1, mousemouse

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd1Q01822 Mmp28-202ENSMUST00000103209 3438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Hoxd1Q01822 Vill-203ENSMUST00000126251 1411 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Hoxd1Q01822 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Hoxd1Q01822 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Hoxd1Q01822 Gm4610-201ENSMUST00000198222 905 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Hoxd1Q01822 Nme2-201ENSMUST00000021217 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Hoxd1Q01822 Gm45706-201ENSMUST00000213063 2136 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Hoxd1Q01822 9230020A06Rik-204ENSMUST00000215201 1116 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Hoxd1Q01822 Itm2b-204ENSMUST00000228637 783 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Hoxd1Q01822 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Hoxd1Q01822 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Hoxd1Q01822 Gm10433-202ENSMUST00000146364 1984 ntTSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Hoxd1Q01822 Gpr107-201ENSMUST00000056433 6134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Hoxd1Q01822 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Hoxd1Q01822 Ubxn10-201ENSMUST00000105809 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Hoxd1Q01822 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Hoxd1Q01822 Creld2-201ENSMUST00000024042 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Hoxd1Q01822 2810430I11Rik-201ENSMUST00000154246 3416 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Hoxd1Q01822 Cpt1c-206ENSMUST00000212836 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
Hoxd1Q01822 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
Hoxd1Q01822 Stx3-203ENSMUST00000075304 2430 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
Hoxd1Q01822 Coro2b-201ENSMUST00000048043 3610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
Hoxd1Q01822 Gm37269-201ENSMUST00000193906 1891 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Hoxd1Q01822 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Hoxd1Q01822 Foxred1-202ENSMUST00000127996 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Hoxd1Q01822 Fchsd1-201ENSMUST00000043437 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Hoxd1Q01822 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Hoxd1Q01822 Gm17435-202ENSMUST00000212699 1998 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Hoxd1Q01822 Gm4755-201ENSMUST00000181803 2647 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Hoxd1Q01822 Il12rb1-201ENSMUST00000000808 2873 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Hoxd1Q01822 Adamts7-207ENSMUST00000147250 4833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Hoxd1Q01822 Rrnad1-201ENSMUST00000005016 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Hoxd1Q01822 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Hoxd1Q01822 Ntsr1-202ENSMUST00000170448 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Hoxd1Q01822 Siglecg-201ENSMUST00000005592 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Hoxd1Q01822 Atp6ap1-202ENSMUST00000114171 2157 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Hoxd1Q01822 Lhx6-201ENSMUST00000112960 3345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Hoxd1Q01822 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Hoxd1Q01822 Zfp64-201ENSMUST00000087971 2438 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Hoxd1Q01822 Mir692-1-201ENSMUST00000102263 109 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Hoxd1Q01822 Gm12928-201ENSMUST00000117115 573 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Hoxd1Q01822 Gm5687-201ENSMUST00000118252 640 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Hoxd1Q01822 Far2os1-201ENSMUST00000162391 555 ntTSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Hoxd1Q01822 Gm9002-201ENSMUST00000178437 499 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Hoxd1Q01822 1700029B24Rik-201ENSMUST00000194040 497 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Hoxd1Q01822 Zfp936-202ENSMUST00000200973 578 ntTSL 3 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Hoxd1Q01822 Gm44985-201ENSMUST00000206202 1016 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Hoxd1Q01822 Gm45384-201ENSMUST00000210451 277 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Hoxd1Q01822 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Hoxd1Q01822 Gm18473-201ENSMUST00000220543 868 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Hoxd1Q01822 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Hoxd1Q01822 Kcnk9-201ENSMUST00000044624 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Hoxd1Q01822 Tescl-201ENSMUST00000069562 855 ntAPPRIS P1 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Hoxd1Q01822 Fam173a-201ENSMUST00000072735 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Hoxd1Q01822 Ppil3-201ENSMUST00000081677 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Hoxd1Q01822 G6pdx-201ENSMUST00000004327 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Hoxd1Q01822 Olfr648-202ENSMUST00000216612 2929 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Hoxd1Q01822 Yeats2-201ENSMUST00000090052 5997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Hoxd1Q01822 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Hoxd1Q01822 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Hoxd1Q01822 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Hoxd1Q01822 Gucy2e-201ENSMUST00000021259 8331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Hoxd1Q01822 Nup88-203ENSMUST00000108531 2453 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Hoxd1Q01822 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Hoxd1Q01822 Epha5-204ENSMUST00000113401 5158 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Hoxd1Q01822 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Hoxd1Q01822 Gm26747-201ENSMUST00000180597 1716 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Hoxd1Q01822 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Hoxd1Q01822 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Hoxd1Q01822 Gtf2ird1-224ENSMUST00000202280 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Hoxd1Q01822 Cant1-203ENSMUST00000106287 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Hoxd1Q01822 Tmed9-203ENSMUST00000224741 1450 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Hoxd1Q01822 Stard5-202ENSMUST00000117410 2832 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Hoxd1Q01822 Gli2-201ENSMUST00000062483 6637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Hoxd1Q01822 Ppp1r12b-201ENSMUST00000045665 8840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Hoxd1Q01822 Tnks1bp1-201ENSMUST00000048400 4799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Hoxd1Q01822 Fam160a2-201ENSMUST00000048079 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Hoxd1Q01822 Strada-201ENSMUST00000007444 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Hoxd1Q01822 Hectd1-201ENSMUST00000042052 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Hoxd1Q01822 Timp3-201ENSMUST00000020234 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Hoxd1Q01822 Sox11-201ENSMUST00000079063 8311 ntAPPRIS P1 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Hoxd1Q01822 Ccdc30-202ENSMUST00000063642 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Hoxd1Q01822 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Hoxd1Q01822 Gm5608-201ENSMUST00000210253 2290 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Hoxd1Q01822 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Hoxd1Q01822 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Hoxd1Q01822 AC096628.2-201ENSMUST00000225443 1413 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Hoxd1Q01822 Mogat2-201ENSMUST00000064231 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Hoxd1Q01822 Pex26-202ENSMUST00000118234 3778 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Hoxd1Q01822 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Hoxd1Q01822 Selenot-201ENSMUST00000107924 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Hoxd1Q01822 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Hoxd1Q01822 AI839979-202ENSMUST00000201790 1539 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Hoxd1Q01822 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Hoxd1Q01822 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Hoxd1Q01822 Gm8108-202ENSMUST00000170207 1961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Hoxd1Q01822 Etl4-201ENSMUST00000045555 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Hoxd1Q01822 Gm12490-201ENSMUST00000120255 560 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Hoxd1Q01822 Gm11400-201ENSMUST00000120853 1214 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Hoxd1Q01822 Plekhd1os-201ENSMUST00000153297 944 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.5 ms