Protein–RNA interactions for Protein: Q01065

Pde1b, Calcium/calmodulin-dependent 3',5'-cyclic nucleotide phosphodiesterase 1B, mousemouse

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Length 535 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pde1bQ01065 5930412G12Rik-203ENSMUST00000134673 2087 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Pde1bQ01065 Sidt1-201ENSMUST00000047446 4279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Pde1bQ01065 Phf21a-206ENSMUST00000111292 2461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Pde1bQ01065 Olfr533-204ENSMUST00000216258 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Pde1bQ01065 Sema7a-201ENSMUST00000043059 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Pde1bQ01065 Pcnx2-201ENSMUST00000047239 7236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Pde1bQ01065 Srp54a-202ENSMUST00000220578 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Pde1bQ01065 Ahcyl2-205ENSMUST00000125911 2039 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Pde1bQ01065 Acot7-202ENSMUST00000075363 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Pde1bQ01065 Zfp28-201ENSMUST00000081022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Pde1bQ01065 Fam83h-201ENSMUST00000060807 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Pde1bQ01065 Chrna10-201ENSMUST00000084830 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Pde1bQ01065 Ciz1-202ENSMUST00000113331 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Pde1bQ01065 Nol4-206ENSMUST00000164186 2622 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Pde1bQ01065 Gm26770-201ENSMUST00000180586 2237 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Pde1bQ01065 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Pde1bQ01065 Rnf44-218ENSMUST00000177950 3941 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Pde1bQ01065 Cox19-201ENSMUST00000049630 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Pde1bQ01065 Spry2-201ENSMUST00000022709 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Pde1bQ01065 Tmem201-202ENSMUST00000103208 3620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Pde1bQ01065 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Pde1bQ01065 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Pde1bQ01065 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Pde1bQ01065 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Pde1bQ01065 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Pde1bQ01065 3830422I06Rik-201ENSMUST00000200199 1181 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Pde1bQ01065 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Pde1bQ01065 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Pde1bQ01065 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Pde1bQ01065 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Pde1bQ01065 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Pde1bQ01065 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Pde1bQ01065 Olfr157-202ENSMUST00000215442 1766 ntAPPRIS P1 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Pde1bQ01065 Pou2af1-201ENSMUST00000034554 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Pde1bQ01065 Klc2-202ENSMUST00000113727 2874 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Pde1bQ01065 Ccrl2-203ENSMUST00000199839 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Pde1bQ01065 Chrna3-201ENSMUST00000034851 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Pde1bQ01065 Fam160a2-202ENSMUST00000074686 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Pde1bQ01065 Med28-205ENSMUST00000156481 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Pde1bQ01065 Pomgnt1-201ENSMUST00000106494 2226 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Pde1bQ01065 Ubqln1-202ENSMUST00000076454 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Pde1bQ01065 Rusc1-201ENSMUST00000052539 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Pde1bQ01065 Syne3-203ENSMUST00000109927 5263 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Pde1bQ01065 Glrx3-203ENSMUST00000211496 3440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Pde1bQ01065 Pigq-201ENSMUST00000026823 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Pde1bQ01065 Xpo1-201ENSMUST00000020538 5145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Pde1bQ01065 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pde1bQ01065 Pde4d-205ENSMUST00000119507 2163 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pde1bQ01065 Rhog-202ENSMUST00000106923 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pde1bQ01065 Gpd1l-202ENSMUST00000129305 2543 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pde1bQ01065 Kcnt1-201ENSMUST00000037580 5881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pde1bQ01065 Tesmin-203ENSMUST00000142193 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pde1bQ01065 Gm36356-201ENSMUST00000209224 2277 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pde1bQ01065 Vill-203ENSMUST00000126251 1411 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pde1bQ01065 Ptgir-201ENSMUST00000086101 2725 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pde1bQ01065 Sltm-206ENSMUST00000216816 3755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
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Pde1bQ01065 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pde1bQ01065 Cox16-202ENSMUST00000110340 668 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
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Pde1bQ01065 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
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Pde1bQ01065 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
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Pde1bQ01065 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pde1bQ01065 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pde1bQ01065 Foxb1-201ENSMUST00000071281 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pde1bQ01065 Auts2-208ENSMUST00000161374 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pde1bQ01065 Htr2c-207ENSMUST00000156697 4654 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pde1bQ01065 Ccdc162-208ENSMUST00000179614 2739 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pde1bQ01065 Zbtb44-205ENSMUST00000216649 3157 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pde1bQ01065 Rubcn-202ENSMUST00000089684 5311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pde1bQ01065 Max-201ENSMUST00000082136 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
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Pde1bQ01065 Slc16a2-201ENSMUST00000042664 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pde1bQ01065 Ptp4a3-202ENSMUST00000163582 3808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pde1bQ01065 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pde1bQ01065 Cog1-201ENSMUST00000018805 3935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pde1bQ01065 C3-201ENSMUST00000024988 5136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pde1bQ01065 Zfp618-202ENSMUST00000064814 2868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pde1bQ01065 Ctsl-201ENSMUST00000021933 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pde1bQ01065 Trio-201ENSMUST00000090247 11495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pde1bQ01065 Ppfia4-205ENSMUST00000189361 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pde1bQ01065 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pde1bQ01065 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pde1bQ01065 Slco4a1-202ENSMUST00000038259 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pde1bQ01065 Brd3-202ENSMUST00000077737 5272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pde1bQ01065 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pde1bQ01065 Plekhb1-204ENSMUST00000107045 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pde1bQ01065 Col26a1-202ENSMUST00000111103 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pde1bQ01065 Met-202ENSMUST00000115442 4663 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pde1bQ01065 Gm11524-201ENSMUST00000119349 807 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Pde1bQ01065 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pde1bQ01065 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.5 ms