Protein–RNA interactions for Protein: P97793

Alk, ALK tyrosine kinase receptor, mousemouse

Predictions only

Length 1,621 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AlkP97793 Ppie-201ENSMUST00000030404 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
AlkP97793 Lce1e-201ENSMUST00000090867 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
AlkP97793 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
AlkP97793 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
AlkP97793 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
AlkP97793 Il2rg-201ENSMUST00000033664 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
AlkP97793 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
AlkP97793 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
AlkP97793 C530008M17Rik-203ENSMUST00000120818 1378 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
AlkP97793 Krt31-201ENSMUST00000007318 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
AlkP97793 Spop-202ENSMUST00000107724 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
AlkP97793 Cstad-201ENSMUST00000102853 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
AlkP97793 Gm24749-201ENSMUST00000157838 343 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
AlkP97793 Hcfc1r1-203ENSMUST00000180140 693 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
AlkP97793 Gm35082-202ENSMUST00000208164 525 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
AlkP97793 Abracl-204ENSMUST00000220110 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
AlkP97793 Plp2-201ENSMUST00000033486 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
AlkP97793 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
AlkP97793 Gm17767-201ENSMUST00000189410 1470 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
AlkP97793 Prss30-201ENSMUST00000024936 1470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
AlkP97793 Rabep2-202ENSMUST00000106407 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
AlkP97793 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
AlkP97793 Sp4-203ENSMUST00000222314 2677 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
AlkP97793 Sept10-201ENSMUST00000165971 2532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
AlkP97793 Irx3os-203ENSMUST00000133528 1354 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
AlkP97793 Serpina16-202ENSMUST00000164148 1582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
AlkP97793 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
AlkP97793 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
AlkP97793 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
AlkP97793 Tmem159-201ENSMUST00000033210 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
AlkP97793 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
AlkP97793 Gm11595-201ENSMUST00000107440 1200 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
AlkP97793 Gm13996-201ENSMUST00000118456 430 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
AlkP97793 Zar1l-201ENSMUST00000118769 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
AlkP97793 Gm12286-201ENSMUST00000119246 1002 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
AlkP97793 Gm14965-201ENSMUST00000124118 565 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
AlkP97793 Retn-201ENSMUST00000012849 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
AlkP97793 Nudt6-207ENSMUST00000141438 899 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
AlkP97793 Gm16308-201ENSMUST00000162171 940 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
AlkP97793 Gm37666-201ENSMUST00000194110 866 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
AlkP97793 Calml4-207ENSMUST00000215968 526 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
AlkP97793 AC136986.1-201ENSMUST00000222829 380 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
AlkP97793 AC134869.3-201ENSMUST00000225581 343 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
AlkP97793 Dhrs4-202ENSMUST00000226168 828 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
AlkP97793 Abhd14a-201ENSMUST00000048685 1256 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
AlkP97793 Tekt3-201ENSMUST00000035732 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
AlkP97793 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
AlkP97793 Alg14-201ENSMUST00000039442 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
AlkP97793 AC238940.1-201ENSMUST00000225106 1858 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
AlkP97793 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
AlkP97793 Slc7a15-201ENSMUST00000036938 1907 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
AlkP97793 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
AlkP97793 Gm39822-201ENSMUST00000212253 2284 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
AlkP97793 Nrf1-219ENSMUST00000167972 1541 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
AlkP97793 Wdr45-206ENSMUST00000116634 1250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
AlkP97793 Gm6963-201ENSMUST00000147879 379 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
AlkP97793 1700001G11Rik-203ENSMUST00000153646 764 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
AlkP97793 CT025551.1-201ENSMUST00000223996 692 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
AlkP97793 Gzmn-202ENSMUST00000225535 989 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
AlkP97793 Olfr272-201ENSMUST00000051600 962 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
AlkP97793 Gm10179-201ENSMUST00000086233 688 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
AlkP97793 A530013C23Rik-201ENSMUST00000130679 2555 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
AlkP97793 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
AlkP97793 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
AlkP97793 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
AlkP97793 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
AlkP97793 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
AlkP97793 Rgs6-209ENSMUST00000186848 1472 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
AlkP97793 Nepn-201ENSMUST00000067085 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
AlkP97793 Ccdc28a-203ENSMUST00000173243 590 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
AlkP97793 Gm27175-201ENSMUST00000183759 606 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
AlkP97793 Gm27223-201ENSMUST00000184653 606 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
AlkP97793 Washc3-201ENSMUST00000020248 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
AlkP97793 Gm7848-201ENSMUST00000210739 718 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
AlkP97793 Gm7207-201ENSMUST00000211575 1067 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
AlkP97793 Gm26953-204ENSMUST00000212526 553 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
AlkP97793 Csrp2-203ENSMUST00000219502 544 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
AlkP97793 AC163667.3-201ENSMUST00000225774 222 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
AlkP97793 Defb36-201ENSMUST00000058086 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
AlkP97793 Mlf1-201ENSMUST00000061322 1113 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
AlkP97793 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
AlkP97793 Cd247-201ENSMUST00000005907 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
AlkP97793 Gm10433-202ENSMUST00000146364 1984 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
AlkP97793 Pipox-201ENSMUST00000017597 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
AlkP97793 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
AlkP97793 Tmem51os1-204ENSMUST00000153023 3440 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
AlkP97793 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
AlkP97793 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
AlkP97793 BC055324-201ENSMUST00000045876 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
AlkP97793 Gm43858-201ENSMUST00000199418 1778 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
AlkP97793 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
AlkP97793 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
AlkP97793 Aldoa-203ENSMUST00000106348 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
AlkP97793 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
AlkP97793 Atg7-207ENSMUST00000182428 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
AlkP97793 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
AlkP97793 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
AlkP97793 Bhmt-201ENSMUST00000099309 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
AlkP97793 Fnbp1-203ENSMUST00000100207 1680 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
AlkP97793 Tcea1-201ENSMUST00000081551 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.5 ms