Protein–RNA interactions for Protein: P97474

Pitx2, Pituitary homeobox 2, mousemouse

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pitx2P97474 Gm15317-201ENSMUST00000129569 699 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Pitx2P97474 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Pitx2P97474 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Pitx2P97474 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Pitx2P97474 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Pitx2P97474 Dkkl1-204ENSMUST00000210741 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Pitx2P97474 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Pitx2P97474 Tmem86b-201ENSMUST00000055085 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Pitx2P97474 S100a8-201ENSMUST00000069927 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Pitx2P97474 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Pitx2P97474 Itfg2-203ENSMUST00000142615 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Pitx2P97474 Lypla1-201ENSMUST00000027036 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Pitx2P97474 Tcea1-201ENSMUST00000081551 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Pitx2P97474 Gm15336-201ENSMUST00000128894 1571 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Pitx2P97474 Spert-202ENSMUST00000164082 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Pitx2P97474 Gm45684-201ENSMUST00000210244 1571 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Pitx2P97474 P4ha1-203ENSMUST00000105466 2918 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Pitx2P97474 A730020E08Rik-201ENSMUST00000180421 3387 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Pitx2P97474 Trip13-201ENSMUST00000022053 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Pitx2P97474 Psd-210ENSMUST00000225323 3398 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Pitx2P97474 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Pitx2P97474 Fmo1-202ENSMUST00000111518 1506 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Pitx2P97474 Plxdc1-201ENSMUST00000017561 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Pitx2P97474 Olfr95-202ENSMUST00000216318 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pitx2P97474 Itga2b-201ENSMUST00000103086 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pitx2P97474 Fam160a2-201ENSMUST00000048079 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pitx2P97474 Ackr4-202ENSMUST00000076147 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pitx2P97474 Fbxl12-201ENSMUST00000086458 2056 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pitx2P97474 Fbxl12-202ENSMUST00000086459 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pitx2P97474 Snx6-201ENSMUST00000005798 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pitx2P97474 Cd33-202ENSMUST00000039861 1791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pitx2P97474 Gata3-201ENSMUST00000102976 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pitx2P97474 Zfhx2os-202ENSMUST00000183750 4375 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pitx2P97474 Slc38a10-216ENSMUST00000179094 4052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pitx2P97474 Crtc1-201ENSMUST00000076615 5683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pitx2P97474 Hars2-201ENSMUST00000019287 2002 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pitx2P97474 Sars-202ENSMUST00000102625 1866 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pitx2P97474 Tk1-201ENSMUST00000026661 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pitx2P97474 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Pitx2P97474 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Pitx2P97474 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pitx2P97474 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Pitx2P97474 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pitx2P97474 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Pitx2P97474 Qdpr-202ENSMUST00000117425 1231 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pitx2P97474 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pitx2P97474 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pitx2P97474 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Pitx2P97474 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pitx2P97474 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pitx2P97474 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pitx2P97474 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Pitx2P97474 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Pitx2P97474 Kcnd3-201ENSMUST00000079169 2102 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pitx2P97474 St6galnac4-204ENSMUST00000179989 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pitx2P97474 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pitx2P97474 Urgcp-202ENSMUST00000093362 5089 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pitx2P97474 Gm7104-201ENSMUST00000179741 2532 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Pitx2P97474 Fbln7-202ENSMUST00000110324 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pitx2P97474 Incenp-201ENSMUST00000025562 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pitx2P97474 Cab39-201ENSMUST00000097666 2369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pitx2P97474 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pitx2P97474 Sqle-202ENSMUST00000100640 2636 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pitx2P97474 Sv2b-202ENSMUST00000165175 5524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pitx2P97474 Pnpla6-211ENSMUST00000207941 4263 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pitx2P97474 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pitx2P97474 4930430F08Rik-201ENSMUST00000054471 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pitx2P97474 Rpl22-208ENSMUST00000188151 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pitx2P97474 Ccdc85a-204ENSMUST00000109502 5220 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pitx2P97474 Grid2ip-203ENSMUST00000120825 3865 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pitx2P97474 Mast3-203ENSMUST00000211948 4251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pitx2P97474 2900097C17Rik-202ENSMUST00000192863 4915 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Pitx2P97474 Gcdh-202ENSMUST00000109745 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pitx2P97474 Pdp1-205ENSMUST00000108301 2635 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pitx2P97474 Grm2-201ENSMUST00000023959 4711 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pitx2P97474 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pitx2P97474 Hnrnpr-201ENSMUST00000084219 2647 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pitx2P97474 Kcnt1-211ENSMUST00000171268 3771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pitx2P97474 Prkca-201ENSMUST00000059595 8409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pitx2P97474 Dab2ip-204ENSMUST00000112983 6051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pitx2P97474 Trpm1-219ENSMUST00000206314 2323 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pitx2P97474 Ggnbp1-203ENSMUST00000133257 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pitx2P97474 2810407A14Rik-201ENSMUST00000069809 1699 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pitx2P97474 Nxph1-201ENSMUST00000060369 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pitx2P97474 Ccdc71-201ENSMUST00000061209 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pitx2P97474 Rph3al-204ENSMUST00000121287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pitx2P97474 Slc23a4-201ENSMUST00000044387 2175 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pitx2P97474 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Pitx2P97474 Tbx3os1-203ENSMUST00000140101 490 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pitx2P97474 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pitx2P97474 Gm28913-201ENSMUST00000186240 364 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pitx2P97474 Gm29608-201ENSMUST00000190444 463 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Pitx2P97474 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pitx2P97474 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Pitx2P97474 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pitx2P97474 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pitx2P97474 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Pitx2P97474 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pitx2P97474 Golim4-202ENSMUST00000117242 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pitx2P97474 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.3 ms