Protein–RNA interactions for Protein: P83917

Cbx1, Chromobox protein homolog 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 185 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cbx1P83917 Glrx3-203ENSMUST00000211496 3440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cbx1P83917 Ccdc57-201ENSMUST00000056781 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cbx1P83917 Arhgap4-201ENSMUST00000064376 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cbx1P83917 Tnfaip3-201ENSMUST00000019997 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cbx1P83917 Armc3-202ENSMUST00000114640 2818 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cbx1P83917 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cbx1P83917 Abca3-201ENSMUST00000039013 6476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cbx1P83917 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cbx1P83917 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cbx1P83917 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cbx1P83917 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cbx1P83917 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cbx1P83917 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Cbx1P83917 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cbx1P83917 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cbx1P83917 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cbx1P83917 Odf2-209ENSMUST00000113764 2450 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cbx1P83917 Gtf2ird2-201ENSMUST00000016086 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cbx1P83917 Cyp26b1-204ENSMUST00000204146 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cbx1P83917 Zfyve1-203ENSMUST00000221919 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cbx1P83917 Gm13135-201ENSMUST00000117628 3121 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Cbx1P83917 Spesp1-201ENSMUST00000056949 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cbx1P83917 Cdc7-201ENSMUST00000031221 2961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cbx1P83917 Arfgap1-204ENSMUST00000108861 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cbx1P83917 Trpv1-203ENSMUST00000108470 2667 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cbx1P83917 Far2-201ENSMUST00000032443 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cbx1P83917 2810404F17Rik-201ENSMUST00000156615 1704 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cbx1P83917 Sgk1-203ENSMUST00000100036 2476 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cbx1P83917 Sgk1-201ENSMUST00000020145 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cbx1P83917 Atxn2l-203ENSMUST00000167759 4023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cbx1P83917 Cntnap4-201ENSMUST00000034225 4848 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cbx1P83917 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cbx1P83917 Inpp4a-211ENSMUST00000168546 2964 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cbx1P83917 Hgs-203ENSMUST00000106205 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cbx1P83917 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cbx1P83917 Gm42498-201ENSMUST00000199981 1372 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Cbx1P83917 Zfp235-201ENSMUST00000056549 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cbx1P83917 Wdr45-223ENSMUST00000207675 1335 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cbx1P83917 Trim45-201ENSMUST00000037409 4612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cbx1P83917 Lamp5-201ENSMUST00000057503 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cbx1P83917 Srr-203ENSMUST00000108448 3239 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cbx1P83917 Trpv4-201ENSMUST00000071968 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cbx1P83917 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cbx1P83917 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cbx1P83917 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cbx1P83917 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cbx1P83917 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cbx1P83917 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cbx1P83917 Tnfaip8l3-201ENSMUST00000098760 4403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cbx1P83917 Gper1-201ENSMUST00000066211 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cbx1P83917 Angpt4-201ENSMUST00000028955 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cbx1P83917 Coro6-204ENSMUST00000102493 2804 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cbx1P83917 BC004004-201ENSMUST00000064709 2803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cbx1P83917 Ep400-202ENSMUST00000112433 3399 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cbx1P83917 Miga2-201ENSMUST00000077977 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cbx1P83917 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cbx1P83917 Patl1-201ENSMUST00000061618 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cbx1P83917 Ncoa3-202ENSMUST00000109252 5757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cbx1P83917 Nrg1-206ENSMUST00000208205 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cbx1P83917 Wdr45-203ENSMUST00000115688 1510 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cbx1P83917 Gm13264-201ENSMUST00000138416 2011 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cbx1P83917 Atp9a-201ENSMUST00000029060 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cbx1P83917 Flicr-201ENSMUST00000144719 3455 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cbx1P83917 Slc30a8-201ENSMUST00000037240 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cbx1P83917 Gm26883-201ENSMUST00000180945 4878 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cbx1P83917 Gm37437-201ENSMUST00000194451 1937 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Cbx1P83917 Zscan10-201ENSMUST00000095595 2698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cbx1P83917 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cbx1P83917 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cbx1P83917 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cbx1P83917 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cbx1P83917 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cbx1P83917 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cbx1P83917 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cbx1P83917 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cbx1P83917 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Cbx1P83917 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cbx1P83917 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cbx1P83917 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cbx1P83917 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cbx1P83917 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cbx1P83917 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Cbx1P83917 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cbx1P83917 Dmrtc1c2-201ENSMUST00000087896 1255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cbx1P83917 Arhgef2-203ENSMUST00000170653 4238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cbx1P83917 Gm8798-201ENSMUST00000211877 1661 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Cbx1P83917 Acnat2-201ENSMUST00000081541 1664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cbx1P83917 Ddx11-201ENSMUST00000163605 4149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cbx1P83917 Zfp597-201ENSMUST00000090522 5668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cbx1P83917 Osgin1-206ENSMUST00000152420 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cbx1P83917 Plin4-201ENSMUST00000002908 5755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cbx1P83917 Crispld2-202ENSMUST00000108972 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cbx1P83917 Cntnap1-201ENSMUST00000103109 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cbx1P83917 Rnf165-202ENSMUST00000182024 4309 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cbx1P83917 Arhgap1-204ENSMUST00000111331 2883 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cbx1P83917 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cbx1P83917 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cbx1P83917 Pla2g4b-201ENSMUST00000126150 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cbx1P83917 Lhx9-204ENSMUST00000112026 2065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cbx1P83917 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 83 ms