Protein–RNA interactions for Protein: P81068

Irx1, Iroquois-class homeodomain protein IRX-1, mousemouse

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Length 480 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx1P81068 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Irx1P81068 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Irx1P81068 Rad23a-201ENSMUST00000003911 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Irx1P81068 Gm5936-201ENSMUST00000114116 2857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Irx1P81068 Gm5640-201ENSMUST00000114119 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Irx1P81068 DXBay18-201ENSMUST00000080324 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Irx1P81068 Gm14685-201ENSMUST00000088459 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Irx1P81068 Trappc9-204ENSMUST00000170633 4688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Irx1P81068 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Irx1P81068 Kcnma1-212ENSMUST00000188285 4440 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Irx1P81068 Gm17276-201ENSMUST00000180839 2782 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Irx1P81068 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC13.71□□□□□ -0.22
Irx1P81068 Prrc2b-201ENSMUST00000036691 8612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Irx1P81068 Zfp862-ps-204ENSMUST00000204484 6065 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Irx1P81068 Sall4-201ENSMUST00000029061 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Irx1P81068 Ncan-201ENSMUST00000002412 7195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Irx1P81068 Ankrd34b-201ENSMUST00000061594 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Irx1P81068 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Irx1P81068 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Irx1P81068 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Irx1P81068 Btrc-202ENSMUST00000111936 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Irx1P81068 Ppp2r2b-203ENSMUST00000120632 2081 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Irx1P81068 Adcyap1-201ENSMUST00000064775 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Irx1P81068 Gfap-201ENSMUST00000067444 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Irx1P81068 Larp4-202ENSMUST00000100206 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Irx1P81068 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Irx1P81068 Flywch1-201ENSMUST00000045517 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Irx1P81068 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Irx1P81068 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Irx1P81068 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Irx1P81068 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Irx1P81068 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Irx1P81068 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Irx1P81068 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Irx1P81068 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Irx1P81068 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Irx1P81068 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Irx1P81068 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Irx1P81068 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Irx1P81068 Slc25a42-201ENSMUST00000063788 3081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Irx1P81068 Cdkl2-204ENSMUST00000113143 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Irx1P81068 Gpd1l-202ENSMUST00000129305 2543 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Irx1P81068 Pxdn-202ENSMUST00000122328 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Irx1P81068 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Irx1P81068 Mdga1-201ENSMUST00000073556 7566 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Irx1P81068 Gm4755-201ENSMUST00000181803 2647 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Irx1P81068 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Irx1P81068 Urgcp-202ENSMUST00000093362 5089 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Irx1P81068 Nfatc2-202ENSMUST00000074618 6637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Irx1P81068 Thy1-201ENSMUST00000114840 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Irx1P81068 Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Irx1P81068 G2e3-201ENSMUST00000054308 6803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Irx1P81068 Gpat3-201ENSMUST00000031255 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Irx1P81068 Tcea1-201ENSMUST00000081551 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Irx1P81068 Lmnb2-201ENSMUST00000057623 3531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Irx1P81068 Bmp7-201ENSMUST00000009143 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Irx1P81068 Ska1-202ENSMUST00000177604 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Irx1P81068 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Irx1P81068 Asap1-218ENSMUST00000177374 4582 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Irx1P81068 Bcas3-202ENSMUST00000092821 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Irx1P81068 1700001L05Rik-201ENSMUST00000100370 2270 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Irx1P81068 Mirt1-203ENSMUST00000181539 2259 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Irx1P81068 Ppp1r9b-202ENSMUST00000107748 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Irx1P81068 Gm42890-202ENSMUST00000167642 2566 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Irx1P81068 Gm45332-201ENSMUST00000210508 1949 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Irx1P81068 Eif3j1-201ENSMUST00000028668 5413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Irx1P81068 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Irx1P81068 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
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Irx1P81068 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Irx1P81068 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Irx1P81068 Ptgr2-205ENSMUST00000135001 1286 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Irx1P81068 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Irx1P81068 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Irx1P81068 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Irx1P81068 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Irx1P81068 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Irx1P81068 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Irx1P81068 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Irx1P81068 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Irx1P81068 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Irx1P81068 Top2b-201ENSMUST00000017629 10335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Irx1P81068 3110062M04Rik-203ENSMUST00000115007 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Irx1P81068 Uspl1-205ENSMUST00000121416 3792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Irx1P81068 Dab2ip-206ENSMUST00000112987 6287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Irx1P81068 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Irx1P81068 Plxnb2-201ENSMUST00000060808 6394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Irx1P81068 Rph3al-204ENSMUST00000121287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Irx1P81068 Rgs12-207ENSMUST00000114285 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Irx1P81068 Polg-201ENSMUST00000073889 7837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Irx1P81068 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Irx1P81068 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Irx1P81068 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Irx1P81068 Zfp618-202ENSMUST00000064814 2868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Irx1P81068 Reln-201ENSMUST00000062372 10885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Irx1P81068 Ddah1-201ENSMUST00000029845 3764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Irx1P81068 Ppp4r3b-201ENSMUST00000020755 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Irx1P81068 Dgcr2-203ENSMUST00000117082 2987 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Irx1P81068 Rfx6-204ENSMUST00000219364 2682 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Irx1P81068 Gm26588-202ENSMUST00000181355 2538 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
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